C'est le 7 Décembre 1941. De retour d'une mission top-secret, l'Enterprise et son groupe aérien tombe en plein dans l'attaque de Pearl Harbor. Pendant les premières semaines de la Seconde Guerre mondiale, alors que l'Amérique subit défaite après défaite, l'Enterprise reste l'un des rares espoirs, coulant les sous-marins ennemis, frappant la marine japonaise dans les îles Marshall, et participant au fameux raid de Doolittle.

Dans l'une des batailles navales les plus célèbres de l'histoire, l'Enterprise et ses sister-ships Yorktown et Hornet, changent le cours de la guerre du Pacifique. En quelques jours de violents combats dans les eaux au large de l'île de Midway, la flotte de porte-avions américains défait la marine japonaise, et l'Enterprise contribue à l'une des premières victoires de l'Amérique dans la Seconde Guerre mondiale.

À l'été 1942, la marine américaine est enfin à l'offensive. La première frappe est dans les îles Salomon, au nord de l'Australie. L'Enterprise supporte la première invasion américaine de la Seconde Guerre mondiale lorsque les Marines américains débarquent sur les rivages de Guadalcanal. Les japonais contre-attaquent brutalement dans les îles Salomon orientales, l'Enterprise subit les pires dommages en combat qu'il n'ait jamais connus.

La deuxième partie de la saga meurtrière des Salomons se joue dans les îles Santa Cruz, l'Enterprise perd son sister-ship Hornet et déplore des dizaines de victimes suite aux bombes qui ont atteint son pont d'envol. Lorsque la fumée se dissipe, l'Enterprise est le seul porte-avions américain restant dans le Pacifique.

Novembre 1942: pour l'équipage à bord de l'USS Enterprise la guerre n'a jamais été plus personnelle. "The Big E" est le seul porte-avions américain prêt au combat restant dans le Pacifique et quand la marine japonaise tente de reprendre Guadalcanal, c'est l'Enterprise qui détruit ses transports, cuirassés et destroyers dans le détroit de Savo.

L'USS Enterprise devient le premier navire à recevoir la Presidential Unit Citation, la plus haute distinction qu'un navire américain puisse atteindre. C'est la mi-temps pour le porte-avions dans sa guerre du Pacifique, lorsque que l'Enterprise se dirige à la maison pour une refonte majeure. Avec un nouvel équipage de "Citizen Sailors" à bord, et de nouvelles technologies, "The Ghost Grey" revient dans la bataille lors de la sanglante invasion des îles Gilbert, en lançant les premières opérations aériennes de nuit ayant jamais volé à partir d'un porte-avions américain.

Alors que l'année 1944 commence, l'Enterprise et les Task Forces de porte-avions bombardent les bases ennemies sur l'atoll de Kwajalien et dans le lagon de Truk. Les Japonais mènent une résistance désespérée dans les îles Marshall. Des Marshalls, l'Enterprise met le cap sur la Nouvelle-Guinée et soutient l'invasion de de la ville d'Hollandia lors de l'opération "Persecution".

Alors que les Alliés débarquent en France, de l'autre côté du monde les forces américaines attaquent Saipan dans les îles Mariannes. L'Enterprise prend part à l'une des batailles les plus importantes et les plus meurtrières de la guerre du Pacifique, anéantissant presque totalement la puissance aéronavale japonaise dans le "grand tir aux pigeons des Mariannes" et dévastant les forces de surface de l'ennemi dans la mer des Philippines.

L'USS Enterprise et son escorte de navires et sous-marins s'engagent dans la plus grande bataille navale de l'histoire: dans une série combats féroces en surface et dans les airs, la marine japonaise est presque totalement anéantie. Avec le reste de flotte ennemie désorganisée, L'Enterprise et la force des porte-avions américains ouvrent la voie à une invasion américaine des Philippines et mettent le cap sur la route de Tokyo.

À l'hiver 1945, l'Enterprise frappe Luzon, Hong Kong, l'Asie du Sud-Est et Iwo Jima. The Big E inaugure également un tout nouveau groupe aérien d'attaque de nuit. Mais comme la marine américaine se rapproche d'Okinawa et du cœur du Japon, l'Empire japonais lâche une arme impitoyable, le Kamikaze. Les marins sur l'Enterprise font maintenant face à l'horreur meurtrière des attaques suicides alors que les alliés resserrent leur étreinte.