Gli alieni del pianeta Cambel, dopo anni di attesa, decidono di invadere il pianeta Terra. Cinque ragazzi, dotati di abilità speciali, vengono chiamati a raccolta da diverse parti del Giappone per raggiungere la Base Laboratorio, un importante istituto di ricerca. Dotati di un apposito lasciapassare fornito dalle massime autorità del governo, ognuno si mette in viaggio. Il mostro alieno attacca subito il treno su cui viaggia Furio, uno dei 5 ragazzi, che riesce a scampare alla morte per miracolo; per caso incontra anche Roy, un compagno, e insieme si recano al laboratorio. Alla base incontrano il resto della squadra e il professor Stevens, un eminente scienziato che ha scoperto i piani dell'invasione aliena e che ha realizzato il Combatter, un robot super elettromagnetico composto da 5 navicelle che dovranno essere pilotate dai ragazzi per unirsi in un unico robot e sconfiggere i mostri nemici I ragazzi vengono fatti salire a bordo, istruiti brevevente sul funzionamento delle navicelle e spediti alla città di Matsuhama dove il mostro sta devastando tutto ciò che si para sul suo cammino.

In attesa della vendetta aliena i capi di stato si riuniscono per ascoltare la conferenza del prof. Stevens su come reagire alla minaccia proveniente dallo spazio. I rappresentanti delle nazioni assistano alla dimostrazione delle navette e all'improvviso compare un mostro guerriero alieno. I 5 Jet partono all'arrembaggio e nonostante la scarsa cooperazione tra i ragazzi, riescono a sconfiggere la creatura. Il professor Stevens parte alla volta dell'Hokkaido per contattare un secondo scienziato, il professor Mirabilius. Ma quando è in volo, la creatura, dal mare, attacca il Jet che si schianta al suolo. Roy e Furio, intenti a regolare le loro rivalità a cazzotti, trovano il professore in fin di vita che li avvisa della minaccia. I ragazzi allora riprendono i loro jet e si uniscono in Combatter. Dopo una lunga e dura lotta la bestia nemica viene sconfitta e la pace ripristinata. Alla base infine il professore riprende i sensi: non può ancora morire, non prima di aver insegnato ai 5 ragazzi ad essere un gruppo.

Al professor Stevens purtroppo vengono diagnosticati al massimo 10 giorni di vita. Ryo e Maggie intanto vanno a prelevare il professor Mirabilius, uno scienziato in grado di aiutare il team. Nel frattempo un mostro attacca una città e le altre tre navette cercano di affrontarlo ma trovano notevoli difficoltà. Le bestie nemiche poi raddoppiano e mettono in difficoltà il Combatter. Il combattimento è lungo e doloroso ma grazie alla forza di volontà di Roy, Combatter riesce a reagire ed eliminare entrambi i mostri, Sfortunatamente però, l'esplosione ferisce ilprofessor Stevens, accorso sul campo di battaglia per mostrare al reticente professor Mirabilius l'entità della minaccia e la forza del Combatter. Il dottore muore fra le braccia del collega, lasciandolgli la pesante eredità della conduzione della base e dei giovani piloti.

Una nuova bestia robot attacca la città e Combatter interviene per salvare la situazione ma il nemico spara una sostanza corrosiva che danneggia seriamente il Combatter e solo una mossa rischiosissima di Roy riesce ad allontanare il mostro. Il Combatter viene potenziato con un acciaio speciale ma anche il nemico ha nuove protezioni. Lo scontro è durissimo ma il Combatter ha una nuova arma, lo Yo-yo Elettromagnetico che devasta la bestia nemica.

Jolly riceve una lettera dei suoi genitori che lo preoccupa non poco per le condizioni del padre. Improvvisamente compare un mostro proprio nella zona dove abita la famiglia di Jolly. Il team del Combatter interviene e aiuta Jolly a salvare la famiglia dell'amico. Padre e madre vengono ricoverati in ospedale e il giovane pilota li accudisce devotamente. Una base del pianeta Cambel compare nel lago nei pressi della casa dei genitori di Jolly e il ragazzo non sa che fare ma la madre lo convince a intervenire a fianco degli amici per salvare l'umanità. Il team può ricostituirsi e formare il robot Combatter che affronta nuovamente il mostro e lo sconfigge definitivamente.

L'orfanatrofio dove Roy è cresciuto viene attaccato da un mostro. Il Combatter interviene e Roy, che ha a cuore la vita dei piccoli e della madre superiore che l'ha cresciuto, sconfigge il nemico. Malik con un vile ricatto nei confronti dei bambini dell'orfanatrofio, impone la resa a Roy. Il ragazzo affronta il capo dei nemici e nella colluttazione viene ferito ma il nemico scacciato. Un secondo mostro attacca nuovamente e Roy convince il prof affinchè possa pilotare il Combatter con la guida cerebrale. La lotta è dura ma gli eroi trionfano ancora.

Roy, gravemente ferito alle braccia, viene operato dal professor Mirabilius. Grazie alla coltivazione di cellule artificiali, metodo del professor Frankstone, vengono ricostruite completamente le braccia del ragazzo che ritrova l'uso degli arti superiori. Il professor Frankstone in realtà è un ostaggio degli alieni di Cambel che dietro ordine di Malik si presenta alla base per incontrarsi con il paziente riuscendo a pungerlo con un ago contenente un mortale veleno. Il professore si allontana dalla base ma viene presto smascherato dai ragazzi del team. Un nuovo mostro compare all'orizzonte e la base viene assediata. Nonostante il dolore alle braccia Roy riesce ad unirsi ai compagni per formare il Combatter. La lotta ha inizio e le pessime condizioni del pilota impediscono al robot di combattere al meglio ma si riesce comunque a scacciare il mostro. Roy viene presto ricoverato nell'attesa che venga scoperto un antidoto; nel frattempo il professor Frankestone nel regno alieno viene silurato e schiavizzato a causa del suo parziale fallimento. Resosi conto del suo errore lo scienziato decide di fuggire per salvare i terrestri. Il mostro, potenziato al massimo livello, mette fuori combattimento i 4 ragazzi. Il professor Frankestone, approfittando di un momento di distrazione dei suoi aguzzini, riesce a comnunicare via radio la formula dell'antidoto al veleno al professor Mirabilius che riesce a rimettere in sesto Roy che non esita a tornare sul campo di battaglia unendosi ai suoi amici per formare il Combatter e sconfiggere il mostro.

Un gigantesco uovo emerge misteriosamente dal sottosuolo della città e il team del Combatter lo preleva per sottoporlo a esami approfonditi. L'uovo si dischiude e ne esce il buffo cucciolo di uno strano animale alieno simile ad un cavallo. Il cucciolo riesce a fuggire, impazzando per la città dove crea disastri a non finire. Ma fa tutto parte di un piano di Malik infatti sulla Terra viene inviato il mostro genitore del cucciolo che intende vendicarsi del male infertogli. Il mostro riesce ad arrivare alla base, dove si trova il corpo del piccolo mentre le navette vengono sconfitte. Roy però scopre il trucco di Malik , il quale intendeva approfittare dei sentimenti nutriti dagli umani per il cucciolo e la madre. Ma quando la situazione è drastica si da vita al Combatter che suo malgrado abbatte il mostro inferocito.

Apparentemente nel Paese accadono degli inspiegabili incidenti che portano morte e distruzione. Il Combatter team parte in ricognizione ma non trova alcuna minaccia. Intanto alla base compare una nuova robottina di cui Dingo s'innamora perdutamente grazie ai meccanismi del sentimento al suo interno collocati dal deceduto prof. Stevens. In realtà la robottina è una spia di Malik e riesce a collocare un meccanismo all'interno di Dingo, modificando i suoi circuiti pensanti. Il robot, controllato a distanza dai nemici, dispone l'unione delle navette che stanno combattendo contro l'ultimo mostro nemico. La mancanza di coordinazione nell'azione crea un disastro e le navette devono ritirarsi, gravemente danneggiate. La robottina nemica infine impartisce l'ordine a Dingo di collocare delle bombe sulle navette che infatti esplodono nell'hangar della base. Il nemico, credendo di aver eliminato il maggiore ostacolo all'invasione dà il via all'assalto al Giappone! Ma era tutto un trucco del professore che ha sostituito le navette con delle copie così il Combatter compare in battaglia sorprendendo e sconfiggendo i nemici.

Malik, esasperato dalle sconfitte, decide di affrontare Roy ad un duello corpo a corpo, com'è usanza del pianeta alieno. I due si affrontano su una spiaggia deserta ed entrambi ne escono feriti ma è Malik ad avere la peggio. Marzia, giovane innamorata di Malik, interviene con un mostro alieno affinchè lo salvi dall'umano, con suo enorme disonore. Roy, ferito ad una spalla, viene curato alla base e può così tornare a lottare a bordo del Combatter. Il mostro alieno attacca la base, tenuto a bada dai quattro compagni di Roy ma quando questo interviene si può dar forma al Combatter e lottare ad armi pari. La battaglia è molto dura ma alla fine gli eroi trionfano di nuovo. Ma l'esito è stato condizionato dallo zampino di Marzia, che per una seconda volta si infrappone nella lotta fra Malik e Roy.

I ragazzi si recano ad assistere ad una gara di motociclismo nella quale trionfa Jenny Roberts, l'ex ragazza di Roy. Un nuovo mostro attacca e Malik, osservata la situazione, decide di usare la ragazza come esca. Il nemico attacca la base Stevens e il Combatter si oppone fermamente ma è solo un diversivo perchè il reggimento motorizzato dei soldati di Cambel attacca la ragazza di Roy il quale si deconcentra e decide di fuggire per salvare Jenny. L'eroe raggiunge l'amica ma vi sono i nemici in agguato! L'abilità di Roy però è superiore e con diverse acrobazie motociclistiche riesce a fuggire e tornare alla base. Maggie recupera la navicella di Roy che riesce a tornare in battaglia ma solo grazie al sacrificio dell'amata che dà la vita per salvare Roy. La rabbia del giovane è incontenibile e il mostro viene spazzato via. E' tornata la pace ma al caro prezzo di una vita umana.

L'aereo in cui viaggia il segretario delle Nazioni Unite viene rapito da un mostro spaziale. In cambio dell'ostaggio Malik richiede la distruzione della base laboratorio e del Combatter. Il professore affida la base ai militari ed al governo ma i ragazzi si barricano al loro interno per evitare la sconfitta. Mirabilius riesce a convincere i ragazzi e quando dà il via al processo di autodistruzione in realtà, dietro false esplosioni, il team viene trasportato nel sottosuolo dove Stevens ha realizzato a suo tempo un rifugio sotterraneo. Malik, convinto del suo successo, viene meno ai patti e attacca la Terra ma quando il nemico è sicuro della vittoria esce il Combatter che salva il segretagio generale e sconfigge il mostro, mandando in fumo i piani del nemico.

Una meteora sta per cadere sulla Terra e il Combatter Team interviene in avanscoperta. I ragazzi si accorgono che si tratta di una capsula spaziale e quando Roy e Furio scendono per controllare la navetta è completamente vuota. L'occupante è una graziosa ragazzina Cosmo Alua abitante del pianeta Eterea che ha disertato dalle file degli schiavi Cambelliani per cercare rifugio sulla Terra. Malik però riesce a catturarla e ipnotizzarla per renderla schiava. Improvvisamente la città viene colpita lungo le vie principali di collegamento e fortunatamente Gonghi riesce catturarla e sottorporla all'attenzione del professore che riesce a liberarla dall'ipnosi. Un mostro nel frattempo attacca la città e i ragazzi intervengono con le navette; la ragazza si sveglia dall'ipnosi e dopo aver realizzato di essere responsabile dell situazione, si getta in battaglia con la sua navetta e si sacrifica per permettere al Combatter di distruggere il mostro.

Teddy, il cuginetto combinaguai di Roy si presenta alla Base Laboratorio Stevens. In barba ai controlli il ragazzino si intrufola nell'hangar e prende il controllo della navetta e decolla nel cielo. I componenti del team intervengono per ecuperarlo ma durante le operazioni il mostro Cambelliano attacca, impedendo la creazione del Combatter. Il nemico attacca assedia la base ma nel frattempo Roy riesce a recuperare la sua navetta, tornare in formazione e dare vito al mitico robot per sconfiggere il mostro e salvare la base.

I Cambelliani realizzano un falso Combatter che semina morte e distruzione, ingannando la popolazione che crede nel tradimento dell'eroe terrestre. I ragazzi vengono fermati, il professore arrestato e processato, anche grazie all'infiltrazione di alieni nelle file delle forze militari e giudiziarie terrestri. Si decide di smantellare il Combatter ma quando i ragazzi lo scoprono riescono a fuggire dalla prigione e prendere un auto ma il finto Combatter interrompe la loro corsa, permettendo ai militari di riacciuffarli. Assieme al professore i cinque vengono condotti alla base per assistere alla distruzione del Combatter ma grazie ad un trucco organizzato con Dingo viene fatta brillare una copia del robot. I nemici si scoprono e i ragazzi riescono a liberarsi e prendere il comando del vero Combatter che affronta la brutta copia sotto la quale si cela un repelente mostro. Dopo un breve combattimento ilbene trionfa e il Combatter riconquista la fiducia della popolazione.

Malik attacca il Giappone, San Francisco e in Africa. Il professor Mirabilus chiede l'aiuto alla comunità internazionale ed in particolare cerca l'intervento del professor Piccadilly, inventore del robot inglese Churchill. Nonostante il tentativo del professore di convincere alla cooperazione in nome della salvezza dell'umanità gli inglesi fanno i sostenuti e si rifiutano di cooperare. Roy durante un combattimento coi mostri precipita e viene tratto in arresto dagli inglese che lo credono una spia. Liberato da un diplomatico che crede nella pace, Roy può tornare con la squadra e formare il Combatter. La lotta è impari, tre contro uno ma il professore inglese, messo da parte il suo orgoglio interviene in battaglia permettendo agli eroi di vincere ma a costo della sua vita.

Il villaggio dei genitori di Gonghi viene attaccato da un mostro simile ad una pianta carnivora che cattura tutti gli abitanti. Il team del Combatter interviene per controllare Gonghi viene ingurgitato dal mostro; riuscito a fuggire dal mostro il ragazzo finisce in una grotta dove trova i compaesani resi schiavi che lavorano per costruire un cannone termico. Approfittando di un momento di confusione Gonghi riesce a liberare i prigionieri mentre all'esterno i compagni a bordo delle navette tengono a bada il nemico. Uscito dall'anfratto il giovane risale sul suo mezzo e distrugge l'avamposto nemico. Il cannone termico viene messo fuori uso e con il Combatter viene distrutto il mostro nemico.

Il professore deve tenere un'importante conferenza sul'elettromagnetismo. Giunto all'aeroroporto lo scienziato viene rapito da soltai di Malik. I ragazzi escono coi mezzi per liberarlo ma affrontano il mostro di turno e lo scontro finisce in parità. Sotto le torture del nemico, il prof. Mirabilius rivela i punti deboli del Combatter e Malik annuncia la sua conquista ai ragazzi che decidono di accettare la sfida nonostante le informazioni in mano al nemico. In realtà grazie ad uno stratagemma il professore non fa alctro che rivelare al nemico come fornire più energia al Combatter che riesce a eliminare il mostro e trarre in salvo lo scienziato.

Un nuovo mostra attacca la base e Combatter lo sconfigge, facendolo esplodere sul fondo del lago nelle vicinanze del laboratorio. Poco convinto della facile vittoria, il professor Mirabilius invia Maggie con la sua navetta in perlustrazione sul fondo ma il mostro la assale: era un piano per isolare un componente e evitare la formazione del Combatter. La navetta viene privata delle ali e bloccata sul fondo ma l'energia elettromagnetica dei ragazzi riesce a riunire le navette per riformare il robot terrestre e sconfiggere il nemico.

La flotta navale delle nazioni unite si scontra nel Pacifico con un mostro che ghiaccia l'oceano e distrugge le navi terrestri. Il Combatter lo affronta e lo sconfigge ma incredibilmente sotto l'armatura del mostro si svela un abitante senziente del pianeta Sigma, costretto a combattere dai perfidi Cambelliani. L'alieno viene portato alla base laboratorio per essere studiato ma Malik introfula una spia che restituisce il controllo della mente del gigante al generale Mailk. Roy si rifiuta di combatterlo e dialogando con l'alieno lo riporta alla ragione ma nuovi mostri alieni lo puniscono per il suo tradikento. Roy, pieno d'ira, forma il Combatter e sconfigge i nemici senza pietà.

Furio, per una promessa fatta ad un vecchio amico, Valdo, deve presentarsi al Lago Smeraldo per determinare chi è il miglior tiratore fra i due. Malik però prende in ostaggio i genitori di Valdo ricattandolo affinchè uccida a tradisca l'amico. Furio riesce a convincere l'amico a eliminare i suoi oppressori e ma presto compare un mostro che cerca di distruggere la navetta dell'eroe. I due ragazzi riescono a sfuggire al nemico e nel frattempo arrivano anche i compagni del team. Malik però appende la madre di Valdo a due corde sospese sul Graydon per ricattare i terrestri ma grazie a due precisi colpi dei due tiratori la donna viene salvata. Formato il Combatter poi il mostro viene eliminato e la pace viene ristabilita.

Maggie mostra segni di affaticamento durante un'esercitazione. Un'approfondita analisi medica della dottoressa rivela una malformazione cardiaca che necessita di un intervento chirurgico e pregiudica la partecipazione della ragazza nelle azioni del team. Ma un improvviso allarme richiama la ragazza in azione che stordisce la dottoressa pur di partecipare alla battaglia. Ma durante la lotta col mostro la ragazza accusa un malore e il Combatter riesce a malapena a respingere il nemico. Roy alla base riprende duramente la compagna, minacciandola di escluderla dalla squadra. Jolly però scopre il problema di Maggie ma viene ricattato affinchè non riveli nulla. Il ritorno del mostro riporta la squadra in azione e Maggi si ritrova in difficoltà; presto si scopre il segreto di Maggie e coraggiosamente riesce a cavarsi dagli impicci e riformare il Combatter che sconfigge il nemico. La ragazza verrà operata e vincerà la sua battaglia più importante.

La grande madre Oleana, alla luce dei fallimenti del figlio, di esonerarlo dalle azioni militari. Marzia, fedele compagna del generale, decide di entrare personalmente in azione ottenendo dalla sovrana una promessa di reintegrare Malik in caso di vittoria col Combatter. La ragazza si scontra col robot terrestre ma viene presto sconfitta. Malik nel vedere ciò si precipita in combattimento ma Marzia, per salvare la vita all'amato si scontra con il Combatter ferendosi mortalmente. Il Combatter è in gravi condizioni e Malik fugge sul Graydon cercando di riportare Marzia alla base dove potrebbe ancora salvarle la vita. Ma quando entra nei laboratori più nascosti della sua fortezza scopre un deposito di suoi duplicati meccanici e realizza un'amara verità: anche lui non è nient'altro che un automa fantoccio nelle mani di colei che ha chiamato madre. Nel frattempo Jollu, pedinato il Graydon, scopre l'ubicazione della base nemica.

Il generale Malik viene esautorato e il comando viene assegnato a Lucifer. Malik nel frattempo, curiosando nei laboratori per cercare un posto in cui far riposare le spoglie di Marzia, trova un robot con le sue fattezza, di cui era rimasto all'oscuro. Il Combatter intanto, individuata la base, cerca di sferrare l'ultimo decisivo attacco contro i nemici. Penetrato nella base, il robot terrestre si affronta con la statua della terribile madre Oleana ma non prima di aver definitivamente distrutto il Graydon, la base volante degli alieni. Improvvisamente però arriva Malik che si sferra contro la madre distruggendo la stuatua e affrontando poi il Combatter con un tremendo corpo a corpo. La lotta è dura e bilanciata ma alla fine Roy e gli altri riescono a sconfiggere definitivamente il generale nemico che se ne va senza rimorsi raggiungendo l'amata Marzia nell'altro mondo.

La regina Janera, stanca dei fallimenti del suo sottoposto, il Generale Dankel, attiva nel corpo del militare robot un meccanismo di autodistruzione a tempo, affinchè sia stimolato nella battaglia contro Combattler. Il mostro insettoide attacca la città e Combattler incontra notevoli difficoltà a tenere testa al nemico. Roy è bravo a sfruttare una debolezza del nemico che viene tempestato di missili e fatto esplodere nell'oceano. Ma dai frammenti dell'eplosione ecco rinascere un mostro il cui corpo è composto di magma, con cui gli eroi hanno ancor più difficoltà. La battaglia è terribile e senza esclusione di colpi: Combattler, con non poca fatica, riesce a immobilizzare il nemico e perforarlo con la sua mossa finale. Dankel, ormai sconfitto, ricompare sul campo di battaglia e sfida Roy ad una battaglia corpo a corpo. Dankel, nonostante la sua notevole forza fisica, non riesce a imporsi sull'agilità e sull'astuzia di Roy che riesce a mettere KO il generale alieno. Nello stesso momento scade il periodo della bomba a tempo e la testa del militare esplode, a testimonianza della spietatezza della perfida regina Janera.