Au mois de juin 1983, Keiichi a emménagé à Hinamizawa avec sa famille et profite de sa nouvelle vie avec Rena et les autres habitants du village. Mais un beau jour, Rena remarque que son père devient plus distant, ce qui éveille des soupçons chez elle…

Rena découvre que son père entretient financièrement une femme nommée Mamiya Rina, qui se trouve être l'employée d'un bar à hôtesses. Elle se remémore alors son enfance, quand sa famille a été déchirée par sa faute. Ne voulant plus commettre la même erreur, elle décide d'affronter celle qui veut nuire à sa famille.

Rena craint que Keiichi ait découvert son terrible crime… Elle apprend ensuite que l'inspecteur Ôishi enquête sur la disparition de Rina, ce qui ne fait que semer davantage le doute dans son esprit.

Rika pensait avoir évité que la tragédie ne se répète en rassurant Keiichi vis-à-vis de Rena, mais elle sombre dans le désespoir en apprenant qu'ils sont entretués. Elle continue toutefois d'aller de l'avant et espère atteindre un fragment où aucun drame ne se produira.

Mion est sur un petit nuage depuis que son Keiichi adoré lui a offert une poupée. Mais quand elle aperçoit ce dernier sur son lieu de travail en compagnie de Shion, son cœur n'en est que plus bouleversé…

Mion a décidé de protéger Keiichi de la malédiction d'Oyashiro, et ce coûte que coûte. Elle enferme Oryô dans les sous-sols de sa résidence pour l'interroger, pensant que la cheffe des trois familles est celle qui manipule la malédiction dans l'ombre. Malheureusement, cette dernière semble avoir déjà rendu son dernier souffle…

Rika a beau parcourir tous les fragments existants, elle n'a pas l'air de pouvoir échapper à la tragédie qui plane au-dessus d'elle. De son côté, Hanyû est attristée de la voir perdre espoir, mais son impuissance semble la tourmenter par-dessus tout. Le monde suivant débute alors avec Satoko, la meilleure amie de Rika, qui console gentiment cette dernière en lui disant de sécher ses larmes.

Satoko informe Rika qu'elle retourne vivre avec son oncle Teppei. Malheureusement, cette dernière ne sait pas que Teppei a changé, et considère ce nouveau monde comme l'un des pires possibles. Ses efforts seront-ils suffisants pour empêcher Satoko de partir ?

Lorsque Keiichi et ses amis assistent à la crise de pleurs de Satoko, ils savent qu'il n'y a pas un instant à perdre. Peu après, celle qui est derrière cette supercherie ne peut s'empêcher d'esquisser un sourire en voyant les membres du club s'unir pour sauver leur amie.

Ôishi a toujours voulu découvrir la vérité qui se cache derrière les mystérieuses morts de Hinamizawa. Dans ce fragment, il décide d'utiliser la révélation de Teppei comme appât pour attirer la malédiction sur sa famille, et ainsi démasquer la personne qui la contrôle…

Le soir du Watanagashi, Rika décide de passer récupérer Satoko chez elle. Cette dernière lui ouvre la porte avec le sourire et dans une toute nouvelle tenue. Malheureusement, Rika ignore qu'un événement sanglant a eu lieu sous son toit, et part rapidement avec elle pour aller profiter du festival.

À cause de la tragédie sans fin qui la consume, Rika n'est plus qu'à deux doigts de craquer. Hanyû, quant à elle, remarque que le village de Hinamizawa a bien changé comparé à avant. Elle décide alors de remédier au pouvoir imparfait qu'elle a octroyé à Rika.

Alors qu'Eua se délecte du récit opposant Rika à Satoko, Hanyû fait son apparition. Cette dernière est ébranlée lorsqu'elle apprend l'identité de la personne responsable des tragédies…

Quand Rika découvre toute la vérité, la fille aux yeux de sorcière n'hésite pas une seconde à pointer son arme sur elle. C'est alors qu'un combat sans fin débute entre les deux voyageuses de la boucle…

Au bout d'un affrontement sans fin, Rika saisit enfin l'épée permettant de tuer les voyageurs de la boucle. Tout en se remémorant de vieux souvenirs, elle prend une décision difficile… Voici la conclusion du récit opposant deux jeunes filles luttant contre le destin.