Yashiro Nene cherche l'aide d'un esprit pour améliorer sa vie amoureuse. Mais, quand "Hanako", l'esprit exauçant les vœux et hante les toilettes des filles, se révèle être un garçon, elle finira peut-être par en avoir plus, et moins, qu'elle ne l'espérait.

Une augmentation de vols mystérieux frappe l'école, et la rumeur veut que l'apparition "Yousei-san" soit à l'origine. Lorsque Nene aperçoit la créature, finira-t-elle par perdre plus que ses fournitures scolaires ?

La meilleure amie de Nene disparaît sans laisser de trace et personne d'autre ne se souvient qu'elle ait jamais existé ! Pour récupérer son amie, Nene est obligée de demander de l'aide à Hanako et de voyager dans une "frontière" entre le monde des vivants et le monde des morts.

Nene, Hanako et Ko ont atteint le sommet des escaliers Misaki, où une femme mystérieuse et envoûtante les attend. Nene récupérera-t-elle son amie ou disparaîtra-t-elle avec elle ?

L'école est pleine de couples improbables grâce à un arbre qui selon la rumeur réalise les déclarations faites en dessous. Lorsque Hanako demande à Nene de le rencontrer là-bas, Nene commence à croire qu'il la voit comme plus qu'une assistante.

À la recherche des secrets de Hanako, Nene et Ko entrent dans le cinquième Mystère, Les Archives de 16 heures. Ses livres contiennent le passé et l'avenir de chaque élève que leur école a eu, mais certaines connaissances ont un prix.

La relation de Nene avec Hanako devient tendue après avoir appris son passé. Avec l'aide de Ko, elle cuisine des donuts pour Hanako espérant pouvoir discuter avec lui. Mais, le tête à tête est interrompu par un intrus choquant !

Ko obtient plus que ce qu'il a négocié lorsqu'il essaie d'aider le fantôme d'un élève exaucer son dernier souhait. Mitsuba peut sembler délicat, mais son parler est ne l'est pas du tout. Ko va-t-il le supporter assez longtemps pour réussir à l'aider ?

Après une invitation surprise, Nene se retrouve kidnappée et emmenée à ... un goûter ? Nene baisse rapidement sa garde en discutant avec la belle et mystérieuse Sakura, mais leur rencontre est-elle aussi innocente qu'il n'y paraît ?