Rosette est envoyée en mission avec Chrono dans l'East Side. Elle arrive trop tard pour sauver les victimes du démon qu'elle doit combattre, mais parvient néanmoins à éliminer celui-ci, non sans détruire sa voiture et tout un immeuble dans l'aventure. Elle se fait évidemment copieusement semoncer par soeur Kate et doit écrire une nouvelle lettre d'excuses...

Elder vient d'inventer un nouveau type de munition, la balle "Spirit", qui renferme un démon. Très impatiente de l'essayer, Rosette s'empresse de l'emmener avec elle pour sa nouvelle mission. Mais alors qu'elle est sur le point de l'utiliser sur le démon qu'elle combat, son arme lui est arrachée des mains et est emportée par un mystérieux individu...

Rosette et Chrono sont chargés de protéger Azmaria Hendric, une jeune fille que l'Ordre de Marie Madeleine croit être un Apôtre, un être investi d'un pouvoir divin. Azmaria est pour l'instant sous la coupe de Ricardo Hendric, un riche homme d'affaires qui est également un adorateur de Satan. A ses côtés se tient un démon que Chrono connait bien...

Lerajie et Hendric se sont à nouveau emparés d'Azmaria. Pour la sauver, il ne reste qu'une solution à Rosette: elle doit libérer les vrais pouvoirs de Chrono. Pendant ce temps, sur le dirigeable de Hendric, ce dernier se prépare à utiliser les pouvoirs d'Azmaria pour rendre vie à son corps pourrissant, mais il est trahi par Lerajie, qui se débarrasse de lui...

Depuis que Soeur Kate lui a interdit de poursuivre ses recherches en vue de retrouver Joshua, Rosette n'a plus qu'une envie: quitter le couvent. Le Père Remington lui propose alors de rejoindre la Milice et d'ainsi jouir d'une plus grande liberté. Remington organise un test pour Rosette, mais celui-ci prend un tour inattendu...

Soeur Kate a chargé Rosette de récupérer une momie que la Mafia essaye de faire entrer en secret dans le pays. Rosette part en compagnie de Chrono et d'Azumaria, qui souhaite devenir une exorciste, et fait la rencontre de Satella Harvenheit, une sorcière aux puissants pouvoirs. Celle-ci réagit fort mal lorsqu'elle découvre la nature de Chrono...

D'étranges événements frappent New York: les statues de la Vierge se mettent à pleurer des larmes de sang, la lune écarlate apparaît et le sceau qui protégeait la zone de Central Park est brisé. Tous ces signes semblent annoncer l'arrivée d'une vieille connaissance de Rosette et de Chrono: Aion, le puissant démon qui a enlevé Joshua autrefois...

Alors que Rosette, qui a été envoyée faire des courses sous une pluie battante, est de fort mauvaise humeur, elle reçoit un appel du Père Remington qui lui demande de venir le chercher à la gare. Lorsque Rosette arrive, elle découvre qu'il s'agit un piège du démon Rizel, qui tient tous les voyageurs sous son emprise...

À l’occasion d’une visite à l’orphelinat où vécurent jadis Rosetta et son frère, la première revit certains souvenirs vieux de quatre ans, notamment sa rencontre avec Chrno et les déboires de Joshua.

Joshua accepte les cornes de Chrno et, transfiguré, fige le temps. Rosetta et Chrno se mettent en tête de tout faire pour secourir l'ange devenu démon...

Une veuve, désireuse de venger son époux tué durant une guerre des gangs, invoque un puissant chien noir qu'elle lance sur les traces des différentes familles maffieuses. Rosetta et Satella sont chargées d'y remédier.

C'est Noël et Rosetta et Chrno décident d'organiser une fête en l'honneur d'Azmaria. Cela faisait bien longtemps que la jeune apôtre n'avait plus passé un Noël joyeux...

Rosetta découvre une photo de son frère. Rizel, la marionnettiste, apparaît...

Décidée à sauver Chrno, gravement malade, Rosetta part à la recherche de médicaments pour démons mais ceux-ci demeurent introuvables. Elle décide de consulter une voyante...

Le démon Deufo demande l'aide de Rosetta et de Chrno pour combattre Aion. À cette occasion, Chrno évoque le temps où il était encore allié au puissant démon qu'ils combattent aujourd'hui...

Alors que Satella enquête sur des disparitions, elle rencontre une sataniste aux ordres d'Aion... Entre-temps, Rosetta et Chrno font un pacte avec Deufo et son groupe...

Chrno, Rosetta et Deufo se préparent à affronter les partisans d'Aion au cours d'un terrible combat...

C'est carnaval et Azmaria emmène Rosetta et Chrono faire la fête. Une virée pleine de surprises durant laquelle ces derniers auront matière à se rapprocher vraiment...

Alors que Joshua terrasse Chrno, Rosetta est faite prisonnière par Aion qui s’apprête à l’utiliser pour faire renaître Marie de Magdalena...

Chrno et Joshua poursuivent leur combat, tandis que Remington et Deufo affrontent Jenai. Aion, de son côté, disparaît avec Rosetta. L’espoir s’amenuise...

L’esprit de Marie de Magdalena apparaît pour venir en aide à un Chrno en mauvaise posture. Parallèlement, un précieux flashback nous en apprend davantage sur le passé de ce dernier.

Chrno reçoit une arme susceptible de lui permettre d’affronter Aion sur un pied d’égalité, sans devoir prendre sa véritable apparence. Au moment où le jeune démon fait son possible pour sauver Rosetta, une lutte fratricide est lancée...

Chrno multiplie les tentatives de sauvetage, mais Rosetta semble désormais nourrir une haine profonde à son encontre. N’est-il pas celui qui lui a jadis volé sa vie ?

Les pensionnaires de l’orphelinat de Rosetta et de Joshua sont revenu à la vie. Mais Chrno et la sœur combattante ont disparu...