Au retour d'une mission désastreuse, James Reece, commandant d'une unité de Navy Seals, rentre chez lui avec des souvenirs confus de l'opération et s'interroge sur sa propre culpabilité.

Reece se concentre sur sa première cible potentielle. Alors que Katie continue ses recherches, cette dernière et Reece travaillent comme ils le peuvent ensemble pour trouver des réponses.

Reece va de plus en plus loin dans sa guerre personnelle face à une conspiration grandissante. La secrétaire de la défense annonce une nouvelle politique drastique destinée à aider les soldats des forces spéciales sur le front. Katie révèle la cause du traumatisme crânien de Reece.

Avec l’aide de ses meilleurs amis, Reece se rend au Mexique pour rechercher le tueur à gages qui a tué sa famille. Katie continue son enquête à partir d’un appartement en location. Steve Horn prend des mesures pour préserver les contrats de Capstone, et le FBI de San Diego dirigé par Tony Layun se lance à la poursuite de James Reece, Navy Seal en fuite.

Reece se rend à San Francisco pour trouver des explications sur la drogue qui est peut être à l’origine de tout. Katie essaie de confondre Mike Tedesco afin de ruiner les plans de Capstone pour Nubellum. Tony et son équipe surveillent Horn de près, dans l'espoir d' intercepter Reece avant qu’il ne tue sa prochaine cible.

La chasse à l’homme organisée par le FBI s’intensifie alors que Reece a été repéré. Sans médicaments, les symptômes physiques et mentaux de Reece sont de plus en plus difficiles à supporter. Cerné par les forces de l’ordre, il doit leur échapper pour continuer sa mission, mais ne peut pas risquer de tuer des innocents.

Reece retourne à Coronado pour se venger de ceux qui l’ont le plus trahi. En revenant chez lui, des souvenirs fragmentés refont surface. Katie joue avec le feu avec le FBI de façon à terminer son article.

Une épreuve de force se prépare chez la Secrétaire de la Défense Hartley sur Orcas Island, alors que les objectifs de Reece, Katie et Ben s’affrontent à ceux de Tony.