La comédienne Christine Rapp, qui interprétait le rôle d'une petite fille dans «Le Clan Cooper», la série préférée de Monk quand il était enfant, est victime d'un attentat. Il semble que le livre de mémoires qu'elle vient de publier contient des révélations gênantes pour ses anciens partenaires. L'actrice fait alors appel à Monk pour la protéger lors de sa tournée de promotion. Celui-ci est ravi de passer un peu de temps avec son idole de jeunesse. Cependant, il découvre rapidement que Christine n'est pas aussi charmante et candide que le personnage qu'elle incarnait sur le petit écran...

Dérangé par un homme qui joue de la musique sous ses fenêtres en pleine nuit, Monk lui offre cinq dollars pour qu'il aille s'installer ailleurs. L'homme, Samuel Waingaya, explique alors à Monk qu'il ne peut pas bouger de ce coin de rue : son épouse y a été tuée par un chauffard il y a deux semaines. Depuis, cet endroit est devenu pour lui un lieu sacré...

Natalie et Monk assistent à la cérémonie de mariage d'une de leurs connaissances. Tout se déroule pour le mieux. Les festivités qui s'ensuivent sont l'expression même de la félicité. Ravis, Monk et Natalie rentrent chez eux en prenant la route. Durant le long trajet qu'ils effectuent, leur voiture tombe en panne. Et rien à faire pour redémarrer le capricieux véhicule. Tous deux se retrouvent au milieu de nulle part, arrêtés non loin d'une toute petite bourgade. C'est alors que Monk, levant par hasard les yeux au ciel, aperçoit, stupéfait, une impressionnante soucoupe volante qui survole l'endroit où ils se trouvent. L'objet volant non identifié est-il réel ?

Le FBI contacte Monk : un dénommé Frank DePalma, ressemblant en tous points à Adrien, vient de mourir renversé par une voiture mais son décès a été caché à tout le monde. DePalma était un tueur de la mafia que les fédéraux avaient à l'œil. L'agent Stone propose à Monk de prendre sa place, le temps de découvrir qui voulait l'engager à San Francisco et qui devait être sa victime…

Monk doit témoigner lors du procès de Evan Gildea. Mais, l'avocat de la défense est un coriace.

Alors que la fille de Nathalie, Julie, chante sur scène pour la première fois, un meurtre est commis. Nathalie cherche à prouver que le meurtrier est celui qui a mis une mauvaise critique à sa fille Julie dans le journal local. Mais l'affaire se complique car Nathalie et Monk ont vu le critique pendant la représentation et le meurtre a eu lieu pendant la représentation...

Des habitants du quartier reçoivent des poupées sans adresse d'expéditeur. Celles ci semblent prédire une série de meurtres étranges, ce qui en conduit beaucoup à suspecter une malédiction vaudou. Ce mystère devient une affaire personnelle lorsque Nathalie se retrouve impliquée.

Monk reçoit une lettre de sa mutuelle l'avisant qu'elle ne lui remboursera plus qu'une seule séance avec son psychiatre, le docteur Bell. Au cours de ce dernier rendez-vous, Monk fait de son mieux pour régler tous ses problèmes, obsessions, tocs et phobies, mais en vain. Le docteur Bell lui propose alors une thérapie de groupe, qui sera prise en charge par sa mutuelle. Monk n'apprécie guère de devoir écouter les jérémiades des autres patients et la première séance tourne au fiasco. Peu de temps après, le détective est contacté par Stottlemeyer et Disher qui enquêtent sur un suicide. Il s'avère que le défunt est l'un des patients du docteur Bell...

Pour l'anniversaire de Monk, Nathalie est déterminée à lui organiser une fête surprise. Mais son patron n'apprécie guère ce genre de réjouissances et il espère bien qu'elle abandonnera cette idée. Monk est chargé de l'enquête consécutive au meurtre d'un concierge, qui a été retrouvé broyé peu avant l'assassinat par empoisonnement d'un puissant homme d'affaires. Mais ses investigations sont parasitées par la perspective de cette fête, qui ne le laisse pas en paix. Il est persuadé que tous ses collègues et amis sont sur le point de lui sauter dessus en hurlant «Joyeux anniversaire !». L'enquête piétine...

Sharona Fleming revient à San Francisco pour s'occuper des formalités légales liées à la mort accidentelle de son oncle Howie. Elle rend visite à Monk, son ex-employeur. Celui-ci émet rapidement des doutes sur les circonstances du décès de Howie...

Monk se sent terriblement seul lorsque Natalie et les filles en viennent à évoquer leur vie de famille. Pendant ce temps, la police enquête sur la disparition d'une femme qui n'a laissé que son chien derrière elle. Tout en aidant le capitaine Stottlemeyer dans son enquête, Monk s'interroge sur le sort de l'animal en attendant le retour de sa maîtresse. Et il a raison : la malheureuse a été tuée lors d'une dispute qui a tourné au drame. Monk finit par adopter la bête, prénommée Shelby. Comme lui, pense-t-il, elle n'a pas de famille. C'est alors qu'il s'aperçoit que Shelby attend une portée, ce à quoi il n'était pas du tout préparé...

Monk fait une nouvelle demande de réintégration dans la police. Malheureusement, le capitaine Frank Willis, un des membres du comité de décision, s'oppose à son retour dans les forces de l'ordre. Monk, surmontant sa phobie des insectes et de la nature, décide alors d'accompagner le lieutenant Disher, qui part camper avec quelques adolescents, parmi lesquels figure le fils du capitaine Willis...

Le capitaine Stottlemeyer demande T.K. en mariage alors qu'un homme est retrouvé mort, carbonisé dans un parc. Monk accepte d'être le témoin de Leland et se retrouve en charge de l'alliance et de l'enterrement de vie de garçon. Mais le capitaine et sa fiancée sont les cibles d'attaques anonymes qui effraient T.K.

Monk est enfin de retour dans la police. Il est directement confronté à une affaire très complexe à propos d'un tueur en série...

Durant son sommeil, Monk voit Trudy, son épouse, qui lui annonce qu'il est temps pour elle de partir. Troublé, il parle de son rêve à Natalie. Selon elle, il ne peut s'agir que d'un présage. Tous deux sont chargés d'enquêter sur la mort d'un médecin, un certain docteur Nash. Monk est bouleversé lorsqu'il réalise que celui-ci travaillait dans l'hôpital dans lequel il se trouvait au moment où il a jadis entendu la nouvelle de la mort de Trudy. Nash a été assassiné de deux balles dans la tête tirées par un pistolet muni d'un silencieux. Sur les lieux du crime, Monk découvre assez vite que le tueur a utilisé l'ordinateur de l'hôpital et qu'il est gaucher...

Une vidéo enregistrée par Trudy avant sa mort offre à Monk les éléments nécessaires à la résolution du crime qui a bouleversé sa vie...