Otis s’ennuie du club de lecture d’Abby, alors il libère Wild Mike de sa cage pour organiser une fête dansante. Mais Wild Mike s’échappe accidentellement de la grange et se fait capturer par des humains.

Lorsque le fermier accroche un panneau indiquant « Bienvenue aux acheteurs », les animaux craignent qu’il ne vende la grange à d’autres personnes. Ainsi, chaque fois que quelqu’un s’approche de la grange, ils utilisent des stratagèmes pour le faire fuir. Mais ils découvrent finalement que le nom de famille du fermier est Buyer et qu’il organise simplement une réunion de famille… qu’ils ont [accidentellement] fait fuir.

Lorsque le présentateur du journal Hilly Burford est écrasé en couvrant un énorme fromage en grains fabriqué par Otis, les animaux le remplacent à l’antenne et rencontrent un immense succès, allant jusqu’à prendre sa place. Mais Otis ne veut pas qu’ils le remplacent définitivement, alors ils tentent de convaincre Hilly de reprendre son travail.

Abby est ravie d’apprendre que sa cousine Veronica vient lui rendre visite à la ferme, mais il s’avère que Veronica, malgré son apparence gentille, utilise en réalité sa beauté pour manipuler les animaux afin qu’ils fassent tout pour lui plaire.

Lorsque Otis fait accidentellement exploser la grange, ils passent une audition pour « La ferme bling-bling », une émission de rénovation qui rénove des granges pour des familles méritantes.

Les animaux transforment la ferme en parc à thème du Far West afin de réunir l’argent de la caution du fermier (arrêté à cause des frasques d’Otis) et décident d’engager un acteur pour jouer le rôle du bandit. Mais au lieu d’un acteur, c’est un vrai bandit qui débarque pour piller la ville.

Pig écrit une lettre d’amour à sa pâtisserie préférée, mais Otis la trouve et croit qu’Abby l’a écrite pour lui.

Afin d’éviter d’aller au concert de « Brianna Texicanna » avec Abby pour pouvoir aller au bowling avec ses amis, Otis ment en disant qu’il doit célébrer la « Journée du plaisir animal heureux », une fête pendant laquelle tout le monde doit rester chez soi pour célébrer.

Les animaux se sentent désolés pour le fermier en voyant que tout le monde a oublié son anniversaire. Ils décident donc de lui organiser une fête et de lui dire que ce n’est qu’un rêve… mais le fermier se laisse emporter.

Lorsque Otis se blesse, Pip prend temporairement la tête de la ferme. À son rétablissement, Otis se rend compte que les autres pensent que Pip est un bien meilleur chef qu’il ne l’était. Blessé dans son orgueil, Otis décide de quitter la ferme pour aller diriger là où il sera vraiment utile… auprès d’une colonie de castors.

Otis est trop paresseux pour faire les corvées à la ferme, alors il crée un clone de lui-même pour s’en occuper. Mais le clone se révèle être une version beaucoup plus petite de lui. Et lorsque Mme Beady finit par capturer le clone, elle est bien décidée à l’emmener dans une émission de télévision pour prouver que les animaux peuvent parler.

Lorsque la responsabilité de surveiller les trois petits de la ferme — Joey le veau, Macy l’agneau et Boyle le poussin — retombe sur Otis, celui-ci les perd en les emmenant se promener dans la grande ville.

Lorsque Bernard, le cousin de Snotty Boy, séjourne chez les Beady et tourmente Snotty, celui-ci s’enfuit et tente de trouver refuge à la ferme. Les animaux doivent alors aider Snotty à se débarrasser de Bernard pour qu’il puisse partir.

Les animaux font appel au Dr Filly pour régler une dispute persistante entre Freddy et Peck, mais au lieu d’arranger les choses, le Dr Filly semble empirer la situation lorsque les autres animaux commencent à ne plus pouvoir se supporter. On découvre alors que le « Dr Filly » est en réalité un âne imposteur.

Lorsque les animaux partent en camping, Pip raconte autour du feu une histoire effrayante à propos d’une sorcière. Lorsqu’ils se perdent et tombent sur la maison d’une vieille femme remplie de friandises, Otis craint que cette femme ne soit réellement la sorcière de l’histoire de Pip.

Les animaux achètent un système de sécurité pour la ferme, mais il s’avère que ce système cause plus de problèmes qu’il n’en résout.

Otis se déguise en chef de télévision pour sauver Peck de la casserole après que la recette de Freddy pour un coq au tofu doit être préparée dans l’émission. Mais le chef insiste pour utiliser un vrai coq… et capture Peck.

Lorsque Pig fabrique ce qui semble être une colle permanente, les animaux essaient de la vendre pour gagner de l’argent. Mais ils réalisent vite que la colle explose deux heures après avoir été appliquée.

Les animaux découvrent un vieux coffre-fort dans la grange qui appartenait à l’ancien propriétaire d’Everett, Nebraska Schwartz. Everett ne se souvient plus de la combinaison pour l’ouvrir, alors Otis l’aide à revivre ses souvenirs passés et leurs aventures ensemble afin qu’Everett retrouve le code.

Otis est assommé et se réveille en croyant être le roi Cudenhotep. La seule façon pour qu’il redevienne normal est que quelqu’un le frappe de nouveau à la tête, mais Otis a des castors comme gardes du corps qui empêchent quiconque de s’approcher de lui.

Les animaux libèrent une baleine de spectacle d’un parc aquatique, mais Otis va avoir bien plus de problèmes lorsque la baleine commence à manger les animaux.

Duke veut un compagnon de jeu, mais aucun autre animal ne veut jouer avec lui. Les animaux convainquent donc le fermier de lui en offrir un. Mais tout tourne mal lorsque le fermier ramène à la ferme l’ennemi juré de Duke, Baxter. Baxter cause des ennuis avec le fermier tout en lui faisant croire que Duke est responsable de tout, ce qui met Duke dans de beaux draps.

Après être devenus les mascottes de l’équipe, les animaux doivent remplacer des joueurs de football blessés lors d’un match.

Les animaux font déclarer la ferme comme habitat protégé afin d’empêcher une autoroute de la détruire et déguisent Freddy en putois tacheté à trois doigts. Mais ils découvrent ensuite que cette espèce existe réellement, et une véritable femelle putois tacheté est envoyée à la ferme. Freddy tombe amoureux d’elle, mais les animaux réalisent que les femelles de cette espèce mangent les mâles après le mariage. La bande doit donc trouver un moyen de s’en débarrasser.

Dans le but de récolter le plus de bonbons possible à Halloween et de gagner un prix, Otis complète la collecte des animaux avec une poignée de bonbons prise dans une citrouille évidée qui, selon la légende, appartiendrait à Hockey Mask Bob… afin de récupérer ses bonbons.

Pig passe son temps avec son ami imaginaire, Mr. Dokipik, depuis des semaines, et ça rend les autres animaux fous. Puis un jour, Pig affirme qu’Otis a tué Mr. Dokipik, alors Otis doit se déguiser en Mr. Dokipik pour que Pig se sente mieux.

Les animaux se font arrêter lorsque la police les prend par erreur pour des bandits déguisés en animaux. Enchaînés les uns aux autres, ils tentent de s’échapper afin de pouvoir utiliser un ordinateur pour retrouver les vrais voleurs.

C’est la veille de Noël et le Père Noël vient rendre visite à la ferme, mais après que Freddy lui a transmis la “fièvre du furet”, les animaux doivent aller livrer tous les cadeaux eux-mêmes.

Bessy est constamment désagréable avec les animaux et pourtant on la voit rarement, alors les animaux se demandent ce qu’elle fait lorsqu’ils ne la voient pas et décident d’espionner ses faits et gestes.

Après que Freddy a été frappé par la foudre, il devient un génie et sait tout. Ils l’inscrivent donc à un jeu-questionnaire pour gagner un million de dollars. Mais ils se rendent compte que l’intelligence de Freddy n’est que temporaire et qu’il redevient stupide après un certain temps.

Après qu’Otis a accidentellement démantelé le corps de Peck avec un marteau, il reconstruit Peck en lui ajoutant des pièces robotiques afin qu’il puisse être très utile à la ferme. Mais les choses tournent mal lorsque les circuits de Peck surchauffent et qu’il devient incontrôlable.

Otis et la bande vont dans une salle d’arcade afin de gagner des tickets pour acheter une console de jeux. Mais Snotty Boy et ses amis veulent eux aussi la console, et ils doivent donc s’affronter pour voir qui réussira à obtenir le plus de tickets en premier.

Duke est ravi lorsque sa sœur Stamps vient lui rendre visite, mais il est choqué lorsqu’il découvre que Stamps est fiancée à son ennemi juré, Baxter.

Le fermier est amoureux d’une femme qui anime un rodéo et qui s’intéresse aux cavaliers de taureaux. Otis fait donc semblant d’être le taureau du fermier pour impressionner la femme. Mais, au rodéo, Otis rencontre un taureau bien plus grand qui le blesse, et le fermier doit alors monter ce grand taureau dangereux.

L’ancien meilleur ami d’Otis, nommé Eddie, revient et tente de se débarrasser de Pip, et Otis ainsi que ses amis doivent l’en empêcher.

Mme Pécore n’a pas d’autre choix que d’emménager avec les animaux de la ferme après avoir été expulsée de sa maison.

Les animaux escaladent une montagne pour atteindre la maison de Bigfoot après que Bigfoot a eu un accident.

Les animaux parviennent à jouer un tour à Mme Pécore pour la pousser à partir en vacances. Ils n’ont ainsi plus à s’inquiéter d’être découverts par elle, mais Otis souffre maintenant de symptômes de manque parce qu’il ne peut plus lui faire de farces.

Les clones Petit Otis et Petite Abby reviennent visiter la ferme, mais cela pose problème car ils ne dorment jamais, empêchant les animaux de dormir lorsqu’ils sont là. Pour les dissuader de revenir, les animaux tentent de créer des mini-clones supplémentaires afin que Petit Otis et Petite Abby aient des amis. Mais les choses tournent mal lorsque le propriétaire du Clone-a-torium prévoit d’utiliser ces clones pour révéler aux humains que les animaux peuvent parler, et Otis et ses amis doivent l’en empêcher.

Pip tombe amoureux d’une ânesse nommée Prunella, mais Bessy essaie sans cesse de les séparer, ce qui amène les autres à croire que Bessy est amoureuse de Pip.

Un groupe de corbeaux canadiens veut voler le maïs de la ferme, mais après plusieurs tentatives ratées, ils décident de donner aux animaux une fausse carte au trésor pour les distraire de la surveillance du maïs.

Le père clown de Snotty Boy vient lui rendre visite, ce qui déclenche un affrontement entre le faux père (Otis) et le véritable père.

Une ancienne vache des cavernes vient attaquer les animaux de la ferme ! Pendant ce temps, des scientifiques kidnappent Otis, pensant qu’il est réellement la Vache des Cavernes.

Otis et ses amis tentent d’attraper un leprechaun.

Otis et ses amis deviennent policiers après qu’un autre agent a été blessé, et ils tentent de résoudre une affaire de vol dans une boutique de donuts.

Otis trouve un œuf de poule géant et décide de le faire éclore afin qu’ils aient un cinquième joueur pour le polo. Mais la « poule » géante se révèle être un dinosaure ! Les animaux veulent aussitôt s’en débarrasser, mais Otis développe des sentiments paternels et supplie les autres de lui laisser une chance. Ils cèdent, mais le dinosaure grandit rapidement, devenant mille fois plus grand, et tombe amoureux de Mme Beady !

Les taupes sujettes de Pig (depuis l’époque où il fut empereur du peuple des taupes pendant 45 minutes) le retrouvent pour qu’il reprenne son rôle d’empereur et les défende contre Éric le Terrible, un ver à la langue acérée et insultante.

Otis invente une fausse information sur une invasion extraterrestre pour effrayer Mme Beady, mais cela attire par accident de véritables aliens décidés à conquérir la Terre. Il tente de les retenir à la ferme tout en cherchant leur point faible.