Lindsay Weir est une adolescente qui après avoir fait partie des grosses têtes, ne sait plus où elle en est. Dans cette année scolaire, au début des années 1980, dans un lycée du Michigan, elle se laisse entraîner et rejoint sur l'invitation de Daniel DeSario ce que les autres surnomme les Freaks, formés de Daniel, Kim Kelly, Nick Andopolis et Ken Miller, mais préfère le terme rebelle. Son affiliation avec les Freaks causent des soucis sa famille et à sa meilleure amie, Millie. Pendant ce temps, Sam, le frère de Lindsay, du genre intello et qui ne s'en cache pas, qui traine avec les Geeks Bill Haverchuck et Neil Schweiber, se démène pour trouver le courage non seulement de confronter Alan, tête brûlée qui l'intimide, mais néanmoins, il espère changer son statut en invitant Cindy, une pom-pom girl au bal.

Les parents de Lindsay et Sam partent pour une sortie le week-end, laissant leurs enfants seul à la maison. Les Freaks lui proposent de faire une fête dans la maison. Lindsay, d'abord réticente, accepte. Elle demande à Sam de ne pas dire aux parents, ce qu'il accepte. Mais il apprend que la soirée va être arrosée, puisque les instigateurs ont cotises pour acheter un tonnelet de bière. Paniqué, il demande à Neil et Bill de l'aider en achetant la bière sans alcool. Mais tout ne va pas se passer comme espérait Lindsay.

C'est Halloween, Sam, Neil et Bill, qui doivent lire un livre de Dostoievski pour un cours, décident de partir faire la tournée des maisons pour la dernière fois. Lindsay, quant à elle accepte de rester à la maison pour aider sa mère pour la distribution de friandises, jusqu'à ce que Daniel lui propose de se joindre à la bande afin de détruire des citrouilles dans des maisons, dont celle de Rosso et aller balancer quelques œufs. Elle décide d'abandonner sa mère, qui voit ses biscuits refusées, voir jetés dehors, car les parents des gamins ont peur. Tandis que Sam et ses amis, dont Harris qui s'est joint à eux, à la récolte de friandises, dont Alan a décidé de les voler après un simulacre de bagarre. Mais la virée entre les Freaks et Lindsay tournent court quand celle-ci balance avec Kim des œufs sur Sam, qui décide de rentrer chez lui, tout comme Lindsay, désolée, qui veut lui faire des excuses. Ce dernier ne l'a pas dénoncée, disant que les fautifs sont une bande de « guignols ».

Après s'être fait humilié en plein cours d'éducation sexuelle car ne connaissant rien au sexe et mal informé, Sam s'y intéresse. Daniel est menacé par Kowchevski, le professeur de mathématiques, de redoubler s'il ne réussit pas son examen. Lindsay lui propose de l'aider à réviser ses maths. Lors d'une pause, Sam demande conseil au Freak. Daniel lui confit un film pornographique que Sam visionne avec Neil et Bill. Si Neil a encaissé, Sam et Neil sont mal à l'aise.

Nick aimerait bien que le groupe de rock qu'il forme avec Daniel, Sean et Ken décolle. Mais après avoir entendu son ami disputer avec son père, qu'il veut le forcer à faire une carrière militaire, Lindsay, dans l'intention de l'aider, lui conseille de répéter plus ce qui conduit à la rupture du groupe.

Le lycée McKinley accueille Maureen, une nouvelle élève. Profitant du fait qu’elle ne connaît rien, Sam et les geeks sympathisent avec la jeune fille. Lindsay se faire faire une fausse carte d’identité afin d'assister à un concert donné dans un bar.

À peine que Nick et Lindsay se fréquentent que celui-ci lui fait des avances de plus en plus claires et insistantes qui mettent la jeune femme mal à l’aise. Les rêves de Sam partent en fumée quand leur professeur lui attribue Gordon, un garçon qui pue, comme partenaire de labo alors que son ami Bill hérite de Cindy, son objet de convoitise.

Lindsay ne sait plus quoi faire avec Nick, décidant de rompre, mais elle ne sait pas du tout comment s’y prendre. Le meilleur moyen d’approcher une pom-pom girl s’est d’être un joueur ou la mascotte de l’équipe. Quand celle du lycée se blesse, Sam saute sur l’occasion.

Sans cesse humilié par le Coach Fredericks ce qui l'exaspère, Bill pense être très bon au sport et ne demande qu’à essayer. Les parents de Lindsay commencent à s’inquiéter de ses fréquentations et décident de lire son journal intime.

Après avoir cassé la voiture de ses parents, Lindsay se voit interdire de fréquenter Daniel et les autres, ce n’est pas une si mauvaise chose, puisqu'elle retrouve ses anciens amis et rejoint le club de mathématiques. De son côté, Sam tente d’impressionner Cindy en changeant de look, mais la mode n'est pas son point fort.

Sam suspecte le père de Neal de tromper sa femme et bien qu’elle ne veule pas faire de fausses accusations, elle en parle tout de même à Bill puis au principal intéressé. Ensemble, ils mènent l’enquête pour savoir de quoi il en retourne. Au lycée, Ken craque pour Amy, joueuse de tuba faisant partie de l’orchestre du lycée.

Lindsay s’essaie à la marijuana avant de se rappeler qu’elle doit garder l’enfant de ses voisins. Se sentant incapable de s’en occuper, elle appelle Millie à la rescousse. En cours, Bill raconte qu’il est allergique aux cacahuètes. Ne croyant pas que c’est vrai, Alan en met dans son sandwich. Bill se retrouve alors hospitalisé d’urgence.

Nick trouve refuge chez les Weir après une dispute avec ses parents, au détriment de Lindsay dont la nouvelle est loin de faire l’effet escompté. Cindy, l’objet du désir de Sam, semble enfin l’avoir remarqué et suite à sa rupture avec son ancien petit ami et accepte d’aller à une fête avec lui.

Sortir avec une des filles les plus populaires du lycée et loin d’être ce que Sam avait imaginé car Cindy se révèle être égocentrique et dénuée d’intérêt. Il va devoir faire quelque chose de nouveau pour lui, qui est de rompre. Ken est perdu quand Amy lui dévoile un secret sur son anatomie qui change tout dans leur relation.

De peur de louper son interrogation et d’ainsi redoubler, Daniel déclenche l’alarme à incendie. Pris en flagrant délit, il écope d’une punition peu ordinaire. Il va devoir rejoindre le club d’audio-visuel où opère les geeks. Nick surprend tout le monde en prenant des cours de disco. À la suite de qualités remarquables de Lindsay, elle reçoit une invitation à un sommet d'enseignement à l'Université du Michigan se déroule pendant l'été. Toutefois, elle n'est pas sûr de savoir si elle veut ou non y participer.

Ne pouvant passer une journée sans être chahuté par les autres élèves, Sam décide de ne plus se laisser faire. Las d’être harcelé par ses parents, Kim invite Lindsay à dîner chez elle pour prouver à sa famille qu’elle ne fréquente pas que des mauvais garçons mais le dîner ne se passe pas comme prévu, tournant mal. Kim se réfugie chez les Weir. S'ensuit une scène entre Daniel et cette dernière, après l'avoir vu en compagnie d'une autre fille.

Kim et Lindsay écrasent par accident le chien de Millie. Se sentant coupable, Lindsay souhaite lui dire la vérité, ce qui est loin de plaire à Kim qui n’hésite pas à la menacer. Bill a découvert un vilain secret son professeur et compte bien s’en servir à son profit. Quant à Nick, il ne s’est pas encore détacher de Lindsay et sa première chanson à la guitare est une ballade dédiée à la belle.

Daniel ne supporte plus son quotidien et s’évade grâce à la musique. Lors d'un concert punk, il fait la rencontre d’une fille qui lui fait beaucoup d’effet. Neal ne sait plus quoi faire ou penser, dénoncer l’infidélité de son père ou faire comme si de rien n’était et ainsi, préserver le mariage de ses parents. Pour avoir aidé une fille qui avait été attaquée, Lindsay est mise en retenue.