La trêve entre Mexicains et Salvadoriens est rompue. Les escadrons de la mort s'entretuent dans les rues de Farmington. Claudette reçoit l'aide d'un agent des douanes pour mettre un terme à ces récentes vagues de violences. Vic, qui a obtenu auprès d'Aramboles des dossiers impliquant Pezuela, tente de faire pression sur ce dernier...

Dans la guerre qui oppose les Arméniens aux Mexicains, Pezuela ordonne la mort de Rezian. Vic et Shane sont dépassés par les événements qu'ils ont provoqués et leurs familles risquent de trinquer s'il arrive quoi que ce soit à Rezian...

Le plan de Vic Mackey visant à opposer les gangs arménien et mexicain passe à la vitesse supérieure. Shane rencontre Rezian, patron des Arméniens, et feint un marché avec lui. Rezian veut faire sortir des armes de l'entrepôt de la police. Shane refuse. Rezian menace de s'en prendre à la famille de Vic. Shane fait marche arrière et accepte à condition qu'il y mette le prix. Grâce à un système d'écoute, Vic et Ronnie ont suivi l'échange dans son intégralité. Quand les trois hommes se retrouvent, ils doivent gérer un casse-tête délicat...

Le ton monte à Farmington. Déterminés à récupérer la boîte contenant leurs documents secrets, les Mexicains incendient la planque de Rezian et abattent deux de ses hommes. La guerre est à deux doigts d'éclater, mais, dans un moment de clairvoyance, l'Arménien ordonne à Vic d'organiser une réunion avec les tueurs de ses hommes afin d'éviter un nouveau massacre. Rien ne va plus pour Mackey. Depuis leur violente dispute, Cassidy refuse d'adresser la parole à son père et cherche des explications concernant son comportement. Elle croit trouver des réponses chez Danni, la mère de son demi-frère. Son père est-il le meurtrier de Terry Crowley ?

Olivia Murray confie une mission à la Strike Team : retrouver Noelle, la fille de Martin Blez, un trafiquant de drogue qui est sur le point de blanchir son argent sale. Le prendre en flagrant délit lors d'un rendez-vous serait une chance de démanteler son cartel. Mais depuis la disparition de sa fille, l'homme massacre quiconque pourrait la détenir. Vic et ses collègues sont donc chargés de mettre au plus vite la main sur Noelle, sans divulguer le rôle joué par la police dans cette affaire. Claudette Wyms doit à nouveau faire face à Kleaven Gardner, un serial killer arrêté par ses soins : elle accepte une confrontation afin qu'il soit jugé. Voulant à tout prix éviter la peine de mort, le tueur n'hésite pas à défier Claudette et remet en cause la crédibilité de ses preuves, sous prétexte que les effets secondaires du traitement médical qu'elle suit peuvent entraîner des hallucinations. Persuadé que Lloyd est un jeune tueur en série, Dutch poursuit son enquête afin de percer le mystère de l'adolescent. Quant à Vic, il est confronté aux nouvelles frasques de Cassidy. Exclue de l'école, la jeune fille a également organisé une soirée au cours de laquelle elle a fourni des ecstasys et de la marijuana à son entourage

Tavon contacte Shane au sujet d'une vieille affaire traitée lorsqu'ils étaient aux Moeurs. En cavale depuis six ans, Gary Barba, qui avait tué sa famille à l'exception de sa petite fille, a repris contact avec elle. Terrorisée, l'adolescente n'accepte de rencontrer son père qu'en présence de Shane. Les magouilles de Vic s'enveniment. Aceveda le menace en effet de remettre à la justice la boîte contenant les dossiers compromettants. Il lui laisse vingt-quatre heures pour coincer Pezuela et mettre un terme à leur enquête clandestine. Mackey fait alors courir le bruit que le propriétaire du fameux carton est prêt à le vendre pour 100 000 dollars, et organise une rencontre entre les Mexicains et les Arméniens...

La pression monte. L'audience de Vic devant la commission a été avancée de deux semaines et la sentence est lourde : un renvoi sans retraite. Il ne lui reste plus que dix jours pour récupérer son insigne. La "Strike Team" est chargée d'enquêter sur le meurtre d'une prostituée, battue à mort par son souteneur. Sa copine de trottoir, une vieille connaissance de Mackey, ressurgit et le supplie de l'aider à retrouver le meurtrier. La mère de Lee, exige de Vic qu'il signe un acte de renonciation paternelle...

Trahi par Vic et Ronnie, Shane a décidé de faire cavalier seul. Il contacte Duo, un proxénète impliqué dans la mort d'une prostituée, et l'engage afin d'éliminer ses anciens coéquipiers. Ronnie, premier visé, échappe de peu à la fusillade. Le commissariat de Farmington déploie les grands moyens pour mettre la main sur son agresseur de flic, tandis que Shane tente de prendre de l'avance sur l'enquête pour éviter que son plan ne soit déjoué. Duo est vite appréhendé et balance Shane. Alors qu'il prend la fuite, son épouse, Mara, contacte celle de Mackey et lui apprend les magouilles de la «Strike Team", l'assassinat de Terry Crowley par Vic, les deux millions dérobés aux Arméniens... Du côté du cartel mexicain, Pezuela ordonne à Vic d'arrêter le prêtre Morton. Celui-ci autorise les dealers à revendre de l'héroïne et de la cocaïne dans sa mission en échange d'une part des bénéfices. Pezuela exige la fermeture de l'église Saint-Luc pour y construire un entrepôt. Entre-temps, le mafieux mexicain contacte Aceveda et lui propose ses services lors des élections municipales : la place de maire, en échange de futures faveurs.

Suite au départ de Vic et à la fuite de Shane, Claudette dissout la Strike Team. Mackey part à la poursuite de Shane et de sa famille, avec l'intention de se débarrasser du couple. Il retrouve chez son excoéquipier une ordonnance destinée à Jackson. Si l'enfant, âgé de 2 ans et atteint de la coqueluche, ne prend pas rapidement ses médicaments, sa santé risque d'empirer au fil des heures. Vic y voit un excellent moyen de pister son ennemi. Aceveda, qui a accepté l'offre de Pezuela pour la direction de sa campagne électorale, voit d'un mauvais oeil les directives de celui-ci. Le mafieux mexicain lui présente Guillermo Beltron. Ancien secrétaire de la garde présidentielle et écarté pour corruption sous la présidence de Vincente Fox, il est devenu le chef de la sécurité du cartel de Guerrero. Olivia veut absolument coincer les deux hommes mais Aceveda, qui risque gros, pose des conditions drastiques. Toujours tourmenté par l'affaire de Lloyd, Dutch invite Rita, la mère de l'adolescent, pour lui faire part de sa propre version des faits. Billings tente de se débarrasser d'un délinquant sexuel, fraîchement installé dans le quartier où vit sa famille. Tous les moyens sont bons pour le faire disparaître... et devenir le héros de ses enfants.

Toujours à la recherche de Shane, Vic Mackey et Ronnie rendent visite à la mère de Mara, mais celle-ci est sans nouvelles de sa fille depuis des mois. Mackey profite de ses relations avec la pègre pour mettre à prix la tête de son ex-coéquipier : 10 000 dollars à celui qui le retrouvera. Le doute s'installe chez Ronnie. Le flic a peur d'être condamné à perpète et veut fuir le pays avec ses proches tant qu'il en est encore temps. Mais Vic le persuade de continuer et lui promet de lui assurer une porte de sortie.

L'étau se resserre de manière sensible autour de Vic. Claudette Wyms semble déterminée à le coincer. Mais, avant cela, elle doit réunir toutes les preuves nécessaires à son arrestation. Afin de collecter les 100 000 dollars qu'il doit livrer à Shane, Mackey tente d'accéder aux rouages du cartel mexicain. Son double jeu fonctionne à merveille. Vic convainc Guillermo Beltran de lui laisser carte blanche : il décroche un nouveau marché avec une bande rivale tout en prenant un sérieux pourcentage. Après une longue réflexion, Corrine, l'épouse de Mackey, accepte finalement de coopérer avec Claudette Wyms. Équipée d'un micro, elle se rend au point de rendez-vous fixé par Shane afin d'y récupérer l'argent déposé par son mari. A la surprise générale, ce n'est pas Vic mais Ronnie qui s'y pointe. Parallèlement, Ronnie et Julien s'occupent d'une nouvelle affaire de meurtre : Cardell Rhodes, un joueur de football, a été retrouvé mort à proximité de son campus universitaire. Julien, qui avait entraîné l'adolescent durant des années, prend cette enquête particulièrement à coeur.

Comprenant qu'il risque d'être pris par le temps, Vic tente une nouvelle manoeuvre pour se sortir de l'impasse. Il décide d'avancer de quelques jours la livraison de drogue du cartel mexicain afin de piéger plus rapidement Guillermo Beltran. Pendant ce temps, Corrine aide une nouvelle fois Claudette Wyms à coincer son époux : mise sur écoute, elle prévoit un rendez-vous fictif avec Shane et demande à Vic d'apporter une voiture ainsi que les 100000 dollars à lui remettre. Mackey se rend au lieu de rendez-vous et repère rapidement le dispositif de surveillance établi par la police. Parallèlement, Shane est contraint de braquer de petits dealers pour récupérer un peu d'argent. Mais l'ancien flic est piégé par deux hommes arrêtés par son service quelques mois plus tôt. Marta débarque en pleine bagarre, tue une jeune femme et se brise la clavicule. Vic tente de sauver sa peau et se rend chez Olivia Murray. Il lui propose un marché : son immunité totale en échange de Beltran. Malheureusement, Ronnie ne fait pas partie du deal...

Protégé par une immunité totale assurée par les fédéraux, Vic doit maintenant honorer sa part du contrat et leur livrer Guillermo Beltran. Lors de la livraison de drogue, le caïd du cartel mexicain fait faux bond à Mackey. Seuls ses hommes de main sont présents. Déçue une nouvelle fois par sa nouvelle recrue, Olivia Murray lui interdit de conclure l'affaire. Pendant ce temps, Dutch rend visite à Corrine et lui apprend que son époux avait également requis, auprès des fédéraux, l'immunité pour sa famille. Effrayée à l'idée que Vic apprenne la vérité sur sa collaboration avec Wyms, elle demande à être placée sous protection policière. Toujours en cavale, Shane et Mara rentrent finalement chez eux pour préparer leur fuite à l'étranger, mais une voisine avertit la police de leur retour. Lorsque les agents débarquent, il est déjà trop tard... Rita, la mère de Lloyd, a disparu. L'adolescent accuse Dutch de l'avoir sauvagement assassinée. Tout s'envenime lorsque des vêtements tachés de sang, appartenant à la victime, sont retrouvés devant le domicile de l'inspecteur. Le capitaine Claudette Wyms écarte alors son ancien coéquipier de l'enquête.