Jim Phelps se fait passer pour un joueur de billard afin de neutraliser un réseau de jeux illégaux.

Collins, un physicien spécialisé dans le nucléaire, a caché assez de plutonium pour construire une douzaine de bombes atomiques. Pour récupérer le métal radioactif, l'équipe de Mission Impossible persuade le scientifique qu'il vit en l'an 2000 et que la Terre vient d'être ravagée par 28 ans de guerre nucléaire.

Charles Rogan détient la clé d'un coffre contenant cinq millions de dollars : l'argent doit servir à renverser le gouvernement d'un petit pays, le Camagua. Phelps et Barney prennent l'identité de responsables militaires du Camagua et font emprisonner Rogan.

Pour libérer un agent américain, fait prisonnier par le syndicat du crime, Phelps et ses agents persuadent Joe Epic, le chef des malfrats, que sa femme a été l'amante de ses rivaux. La guerre est déclarée entre les différentes familles du milieu.

L'équipe de Mission Impossible convainc Gordon Holt, un agent double, qu'il a été contaminé lors de la livraison à un groupe de terroristes d'une arme biologique volée. Après avoir enfin localisé leur repaire, l'agent Mimi Davies se fait passer pour la petite amie de Holt.

Jim a pour mission de s'emparer de la plus grosse cargaison de cocaïne jamais produite aux USA. Pour les besoins du plan, Mimi Davis se change en une envoûtante serveuse.

Phelps se fait passer pour un meurtrier. Il est pris en charge par une organisation criminelle qui aide des truands recherchés par la police à quitter le pays, après avoir volé leur argent. Pour supporter le lavage de cerveau que subissent les "clients" de l'organisation, Phelps se fait hypnotiser à distance par ses agents.

Phelps se fait passer pour le responsable d'un studio hollywoodien. L'agent veut mettre sur pied un film racontant fidèlement le meurtre jamais élucidé qui s'est déroulé ici même quelques années plus tôt.

Phelps mène une enquête parallèle à celle d'un juge d'instruction corrompu, pour prouver la culpabilité d'un patron du syndicat du crime, Sam Dexter, accusé du meurtre de sa petite amie.

Jérôme Cooper, un scientifique aux idées extrémistes, menace de larguer une bombe atomique sur une grande ville américaine si plusieurs membres du gouvernement ne sont pas remplacés par des hommes qui partagent ses points de vue. Phelps et Mimi tenteront de détruire l'endroit où est stockée la bombe.

Jim Phelps est enlevé. Ses ravisseurs demandent une forte rançon pour le libérer. Barney, Casey et Willy contre-attaquent : ils volent une lettre qui prouve la culpabilité du patron du syndicat du crime dans plusieurs affaires crapuleuses.

Jim Phelps se fait passer pour un champion d'échecs. Il a pour mission de neutraliser Peter Cordel, un joueur génial qui est accusé de plusieurs crimes.

L'équipe de Mission Impossible est chargée de mettre un terme à la carrière de Leo Ostro. Phelps et Casey s'infiltrent parmi les truands et font miroiter à Ostro une nouvelle "affaire" encore plus juteuse.

Hannah O'Connel, une criminelle très superstitieuse, s'évade de prison et se réfugie dans un petit pays des Caraïbes. Pour lui faire avouer où se trouve l'or qu'elle a caché quelques années plus tôt, Phelps et ses agents lui organisent une grande fête vaudou.

Eve Vayle, a provoqué la mort de son mari, Johnny, dans un accident d'avion. Elle découvre dans les papiers de ce dernier des documents secrets appartenant à la pègre. Jim et son équipe sont chargés de l'en délester.

Nicola Varsi, un agent d'un pays de l'Est arrêté sur le sol américain, demande l'asile politique. Mais l'équipe de Mission impossible doute du caractère pacifique de ses intentions.

Phelps et ses équipiers jettent leur dévolu sur John Bachman, un truand qui a accès aux registres informatiques du syndicat du crime. Déguisés en membres d'une secte très secrète, les agents persuadent Bachman qu'ils ont trouvé la recette de l'immortalité.

Paul Mitchell, un organisateur de combats de boxe lié au syndicat du crime, devient la cible de l'équipe de Mission Impossible quand l'un de ses boxeurs est mystérieusement abattu.

Phelps et ses agents ont pour mission de récupérer un stock de trois tonnes de drogue qui appartient à l'organisation de Sam Hibbing. Pour s'infiltrer parmi les truands, Casey prend l'identité de la fille du chef, une droguée notoire

Les forces de Mission Impossible doivent neutraliser un mouvement terroriste qui s'apprête à lancer une attaque contre le gouvernement.

Van Cleve et Matthey Royce ont volé dans un musée d'Amérique Centrale cinq millions de dollars d'objets d'art pré-colombiens, et ont rapporté leur butin aux Etats-Unis.

Barney s'infiltre dans une bande de malfrats qui viennent de voler les bijoux inestimables d'un petit pays européen. Jean Cole, la chef des truands, tombe follement amoureuse de l'agent.