Danny doit affronter un nouveau fantôme très puissant : Le Roi des végétaux, un fantôme qui peut se régénérer et produire des grosses masses de plantes sauvages. En plus, il est tellement fort que Danny n'arrive pas à le vaincre. Mais grâce à Glace Pilé, Danny pourra développer son nouveau pouvoir de fantôme. La Cryogénie, un pouvoir permettant de jaillir de la glace et des boules de neige et c'est avec ce pouvoir que Danny est de classe 10/10 et le rend aussi puissant que les autres fantômes auxquels il a eu affaire. Mais ce pouvoir sera-t-il suffisant pour que Danny réussit à sauver Amity Park du monstre végétal ?

Danny aide à tirer une épine de la du derrière de Glace Pilé. Une créature polaire semblable à l'abominable homme des neiges qui vit dans le secteur le plus froid du Royaume des Fantômes. Et pour lui montrer sa gratitude, il lui confie l'infi-carte, pouvant mener son utilisateur dans toutes les issues du Royaume des Fantômes. Mais Vlad Plasmius a concocté un plan pour s'emparer de la carte.

Vlad libère accidentellement Vortex, un puissant fantôme qui contrôle la météo comme la pluie et le beau temps. Danny a subi une partie des pouvoirs de Vortex. Vlad lui demande de l'aide pour vaincre Vortex, mais il tellement puissant qu'il répand un climat catastrophique sur le monde entier. Danny pourra-t-il arrêter tous ces désastres avant qu'il ne soit trop tard ?

Un nouveau fantôme est arrivé à Amity Park : Amorpho, un fantôme qui peut prendre la forme de n'importe qui et commence à embêter Danny Fantôme et Danny commence à perdre soudainement et mystérieusement ses pouvoirs. Amorpho pourra-t-il quitter les lieux ?

Vlad Masters pour sa candidature pour maire d'Amity Park en rejetant le premier maire. Danny doit empêcher les nouvelles lois d'être appliquées par le nouveau maire : Le Nasty Burger a été démoli afin de créer un nouveau restaurant le "Mc Masters", les appareils de Tucker ont été confisqués, un nouveau code vestimentaire a été appliqué, la surveillance et la sécurité fut chargée par des policiers impitoyables et Les Hommes en Blanc remplacent Danny pour chasser les fantômes. Un problème : Vlad avait de multiples raisons de convaincre la ville que Danny était un mauvais fantôme. Aidé de ses meilleurs amis, Danny doit être plus futé que Vlad et s'il réussit, le maire Vlad peut ruiner sa carrière.

Comme on sait que le fantôme des cartons est un fantôme très facile à battre, il repart une 9e fois pour le Royaume des Fantômes, espérant de trouver une boîte vraiment terrifiante. La boîte de Pandore, la légende dit que cette boîte renferme les pires malveillances de l'univers juste dans une petite boîte légère. En se promenant sur l'île de Skulker, il le prend pour un inconscient. Il retourne à Amity Park pour y semer la terreur avec pleines de choses horribles. Danny pourra- t-il ramener Pandore avant qu'il soit trop tard.

Nocturne est un fantôme des rêves qui contrôle tous les rêves. Après son dernier combat avec Danny Fantôme, il parcourt le reste de la ville même Vlad Masters n'a rien pu faire pour se défendre. Pour vaincre Nocturne une bonne fois pour toutes bien qu'il soit affaibli, Danny doit entrer dans son rêve. Pour cela, il doit avoir l'aide de Sam, Jazz et Tucker.

Dannie Fantôme est de retour à Amity Park, mais Vlad court toujours et est prêt à tout pour la reprendre sa fille bien-aimée. Pour cela, il appelle Valérie pour lui font confier une mission. Croyant qu'elle doit éliminer Danny Fantôme, Vlad lui dit que Dannie Fantôme est un fantôme très dangereux qui ne fait que s'attaquer à lui. Danny pourra-t-il résonner Valérie pour la dire que Vlad lui a menti ?