L'agent Dale Cooper est assis dans la Loge noire en compagnie de Laura Palmer qui lui annonce qu'ils se reverront 25 ans plus tard, puis fait un geste avec ses mains. De nos jours. Les 25 années se sont écoulées. Un Dale Cooper plus âgé se tient face à un homme ressemblant au Géant, « Le pompier ». Celui-ci demande à Cooper de prêter attention au son d'un phonographe posé près d'eux. Il lui dit : « Maintenant, il est dans notre maison » et « Pour l'instant, tout ne peut être dit à haute voix ». Le géant lui demande aussi de mémoriser le nombre 430 ainsi que les prénoms "Richard" et "Linda", « d'une seule pierre, deux oiseaux ». Il lui annonce également qu'il est très loin, puis Dale Cooper disparaît. Pendant ce temps, à Twin Peaks, le Dr. Lawrence Jacoby se fait livrer une cargaison de pelles. À l'hôtel du Grand Nord, Benjamin Horne, après avoir refusé de rembourser une cliente dont le séjour a été perturbé par une moufette, présente son frère Jerry à sa nouvelle secrétaire, Beverly. Benjamin s'entretient ensuite avec son frère et lui reproche de consommer beaucoup trop de marijuana, drogue que Jerry trafique maintenant légalement. Au poste de police, la secrétaire Lucy Brennan, mariée à l'adjoint Andy Brennan, est dérangée par un homme pressé qui souhaite parler au shérif Truman. Quand elle lui demande à quel Truman il voudrait parler, l'homme lui dit qu'il ne sait pas. Il lui laisse une carte de visite, puis part. Hawk, l'adjoint en chef du shérif, reçoit un appel de la Femme à la bûche, gravement malade et fragile. Elle lui annonce que sa bûche a un message pour lui : quelque chose, qui est liée à la disparition de Dale Cooper, s'avère manquant, et la clé de l'énigme est en lien avec son héritage. Hawk emmène plusieurs dossiers dans la salle de conférence pour les fouiller à l'aide d'Andy et de Lucy. Dans la pièce d'un entrepôt à New York, un dénommé Sam Colby, assis sur un canapé, est payé pour surveiller un cube en verre éclairé par des projecteurs. Ce cube dispose d'une fenêtre ronde et d'un tube transparent traversant le mur arrière et donnant vue sur la ville. Sam change aussi les cartes mémoires de caméras de surveillance qui filment en continu la boîte transparente. Il les répertorie et les range dans un placard. Tracey, une jeune fille apportant du café, fait la connaissance de Sam. Le garde lui annonce qu'elle ne peut pas rentrer dans la salle où travaille Sam. Le lendemain, Tracey revient avec un double café. Profitant de l'absence du garde de sécurité, Sam fait néanmoins pénétrer Tracey dans la pièce. Il lui explique qu'il ne sait pas à qui appartient le bâtiment et que son travail consiste seulement à regarder le cube "pour voir si quelque chose apparaît à l'intérieur". Sam et Tracey finissent par faire l'amour sur le canapé, devant la boîte en verre. Soudain, le cube se met à noircir de l'intérieur, et de la noirceur apparaît une entité humanoïde, sans visage et à la silhouette trouble, nommée « L'Expérience ». Celle-ci s'agite, s’éjecte de la boîte, la brise et massacre le jeune couple. Dakota du Sud, la nuit. Dale Cooper, cheveux longs et yeux noirs, débarque en auto près d'une maison. Il s'agit d'un doppelgänger, sombre double de l'agent du FBI et possédé par l'entité démoniaque BOB. De la maison sort un garde, Robby, qui cherche à l'intercepter. Mais il est assommé par le sombre double de Cooper qui entre dans la maison. L'endroit est occupé par Otis, un homme moustachu qui l'appelle « Mr. C », ainsi que par un homme mince en salopette, un petit homme handicapé dans une chaise roulante et une certaine Buella. Mr C. demande à cette dernière si Ray Monroe et Darya sont dans les parages. Buella va les chercher dans la pièce d'à côté. Tous deux partent avec lui pour une tâche non spécifiée. Dans le même État, à Buckhorn, une femme, Marjorie Green, traverse un couloir d'un immeuble avec son chien Armstrong, jusqu'au moment où elle remarque une odeur nauséabonde provenant de l'appartement fermé à clé d'une certaine Ruth Davenport. Marjorie Green appelle alors la police. Au moment où les officiers Olson et Douglas s'apprêtent à appeler un serrurier, Marjorie Green leur affirme que Hank Fillmore, l'homme d'entretien, possède les clés de l'appartement en question. Confus, ce dernier croit comprendre qu'ils sont là pour l'interroger sur quelque chose qu'il aurait fait. Marjorie Green, femme distraite et qui semble avoir des problèmes de mémoire, leur montre qu'elle est finalement en possession des clés. En pénétrant dans l'appartement, les deux policiers trouvent dans la chambre un corps mort de femme à la tête perforée, couché dans un lit recouvert d'une couverture et d'un drap. Le détective Dave Macklay et la légiste Constance Talbot arrivent sur les lieux. En ôtant la couverture, ils découvrent qu'il s'agit de deux cadavres incomplets : la tête de Ruth Davenport placée près du corps décapité d'un homme non identifié. Les empreintes retrouvées sur la scène du crime appartiennent à William Hastings, le principal d'une école. Il est rapidement arrêté en présence de sa femme, Phyllis. Dans la salle d'interrogatoire, face au détective Don Harrison et le chef de la police Mike Boyd, Hastings explique à Macklay que Ruth Davenport était la libraire de l'école. Ne possédant pas d'alibi et bafouillant tout en essayant de livrer son emploi du temps, il est emmené dans sa cellule. Là, Macklay, lui annonce que Ruth Davenport a été retrouvée assassinée et que son ADN est partout sur le lieu du crime. Hastings demande alors qu'on appelle sa femme. Macklay et Harrison arrivent ensuite chez les Hastings avec un mandat et découvrent à l'intérieur du coffre d'Hastings un morceau de chair. « Le Pompier » regarde le phonographe silencieux.

En prison, William Hastings reçoit la visite de sa femme Phyllis. Il tente de la convaincre qu'il n'est pas responsable de la mort de Ruth Davenport, mais lui révèle qu'il a rêvé de son meurtre. Refusant de le croire, sa femme lui dit qu'elle sait qu'il l'a tuée mais aussi qu'elle est au courant de sa liaison avec la morte. William Hastings lui reproche de le tromper avec leur avocat, George Bautzer. Après avoir quitté son mari, elle croise à la sortie du poste de police Bautzer, venu représenter Hastings, et lui annonce que son mari sait pour leur liaison et qu'ils peuvent se voir plus tard. Alors que Hastings pleure dans sa cellule, une étrange entité fantomatique figée se tient dans une autre près de la sienne. Hastings ne la voit pas pas celle-ci disparaît soudainement. En rentrant chez elle, Phyllis est assassinée froidement par le double Mr C., avec une arme à feu appartenant à Bautzer. Avant de la tuer, il lui dit qu'elle a suivi la nature humaine avec perfection. Dans le Dakota du Sud, en déjeunant dans un restaurant avec Ray Monroe, Darya et Jack un autre associé, le doppelgänger de Cooper - qui mange du maïs à la crème, nourriture des esprits de la Loge noire - rappelle à Ray, qui lui demande s'il est anxieux à propos du jour suivant, qu'il doit lui donner une information détenue par la secrétaire de William Hastings. Plus tard, le doppelganger tue Jack après qu'il lui ait donné les clés d'une voiture,. La nuit tombée, Mr C. arrive dans un motel où l'attend Darya, qui raccroche rapidement le téléphone lorsqu'elle l'aperçoit. Elle lui dit qu'elle téléphonait à Jack et que Ray a été emprisonné. Après avoir emprunté son pistolet, il lui révèle qu'il a tué Jack. Démasquée, Darya tente de s'enfuir mais elle est neutralisée par le double maléfique de Cooper. Il lui dévoile un enregistrement de son appel récent où elle a parlé avec Ray, tous les deux contactés par l'agent Phillip Jeffries (David Bowie dans Twin Peaks: Fire Walk with Me) qu'il leur a demandé de l'assassiner. Puis il lui annonce qu'il va la tuer. Il tente de la faire parler, en lui demandant qui les a payés pour le décimer et si elle sait si Ray possède l'information et des coordonnées détenues par la secrétaire de Hastings. Elle lui réplique qu'elle ne connait pas le commanditaire, qu'elle et Ray se partagent seulement 500,000 $ s'ils le tuent et que la secrétaire aurait parlé à Ray. Il lui avoue qu'il est supposé retourner dans la Loge noire le lendemain mais qu'il a un plan pour contrer son retour. Il lui montre une carte à jouer avec un étrange symbole noir dessus, qui n'est d'autre que le pétroglyphe de la grotte de Twin Peaks, et lui explique que c'est ce qu'il veut. Alors qu'elle tente à nouveau de fuir, il la frappe au visage et l'abat violemment. Il tente ensuite de contacter Jeffries mais la voix ne lui dit seulement qu'elle sait qu'il a rencontré le Major Garland Briggs et qu'elle a appelé pour lui dire au revoir. Elle lui rappelle qu'il rentre demain, qu'elle sera avec BOB puis raccroche. Le doppelgänger de Cooper pénètre dans une base de données du FBI et télécharge des fichiers sur la prison fédérale de Yankton où Ray est prisonnier. Il va dans la chambre d'à côté où il retrouve une complice, Chantal Hutchens, lui demande de se débarrasser du cadavre de Darya et de le rejoindre dans quelques jours avec son mari. À Las Vegas, Duncan Todd, un autre associé du doppelgänger de Cooper, tend de l'argent à son employé, Roger. Il lui demande de dire à une femme non spécifiée qu'elle a le job. Roger le questionne à propos du mystérieux commanditaire à qui l'argent appartient mais Todd lui annonce qu'il ne doit jamais affaire avec quelqu'un comme lui. Pendant ce temps, dans le salon de la Loge noire, l'agent Dale Cooper est assis près du manchot, alias MIKE, qui lui demande s'il s'agit du passé ou du futur avant de lui annoncer que quelqu'un est là. Il s'agit d'une Laura Palmer âgée, toujours assise dans le même fauteuil. Elle veut savoir s'il la reconnait et il lui demande si elle est bien Laura Palmer. Comme dans le premier rêve qu'il a fait d'elle il y a 25 ans, elle lui répond qu'elle a l'impression qu'elle la connait mais que parfois ses bras se tordent dans son dos. Il lui redemande si elle est bien Laura Palmer, ce qu'elle confirme et lui annonce qu'elle est morte mais qu'elle vit toujours. Elle enlève son visage, révélant une intense lumière à l'intérieur et le remet. Alors qu'il cherche à savoir s'il peut partir, elle se lève du fauteuil, se dirige vers lui, l'embrasse et murmure à son oreille comme il y a 25 ans. Soudainement, elle crie, tremble, s'envole et disparaît. Les rideaux rouges se lèvent pour révéler un cheval blanc et les ténèbres. Cooper est une seconde fois face à MIKE. Il lui redemande s'il s'agit du passé ou du futur avant de le guider hors du salon. Dans une autre pièce, il lui présente « Le Bras », une forme évoluée de L'homme venu d'un autre endroit, un arbre squelettique et électrique parlant orné d'un cerveau humain. L'arbre lui annonce que s'il veut retourner sur Terre, son doppelgänger doit retourner dans la Loge noire. Il lui dit notamment « Le temps et le temps à nouveau », répète plusieurs fois BOB, lui dit de se souvenir des chiffres 253 et lui demande de partir. Cooper suite MIKE hors de la pièce. MIKE disparaît et Cooper erre dans les couloirs labyrinthiques de la Loge noire. Dans une autre pièce, il rencontre Leland Palmer, assis dans un fauteuil, qui l'implore de retrouver sa fille Laura. La Loge noire se déforme brusquement. MIKE suggère que quelque chose ne va pas et « Le Bras » mentionne son double maléfique. Toujours perdu dans des couloirs identiques, Cooper ouvre un rideau où il aperçoit son doppelgänger en train de conduire. Le double maléfique du « Bras » apparaît, hurle « PAS EXISTANT ! » et expulse Cooper hors de la Loge noire, tombant dans le sol qui s'est ouvert sous ses pieds. Il est d'abord propulsé à l'intérieur du cube en verre à New York, juste avant que Sam Colby et Tracey Barberato ne soient tués, puis chute ensuite dans l'espace. A Twin Peaks, en pleine nuit, Hawk parcoure la forêt des environs. La Femme à la bûche l'appelle et lui dit que « les étoiles tournent et le temps se présente tel qu'il est ». Elle lui propose de venir plus tard chez elle pour manger une tarte et boire du café. Hawk arrive à Glastonbury Grove, l'entrée de la Loge noire, où des rideaux rouges apparaissent et disparaissent furtivement. Sarah Palmer regarde à la télévision un documentaire sur des lions mangeant un buffalo Africain. Au Bang Bang Bar, le relais de la ville, Shelly, aujourd'hui mère de famille, boit avec ses amies Hannah et Renée. Red, un dealer, lui fait un clin d’œil alors que Jean-Michel Renault, barman comme son frère décédé Jacques, sert des clients. James Hurley, accompagné de son ami Freddie Sykes, entre dans le bar et observe de loin Renée...

Dale Cooper atterrit dans un immeuble au milieu d'une mer violette. Il y pénètre à l'intérieur grâce à une fenêtre ouverte. Il rencontre Naido, une femme sans yeux assise devant un feu de cheminée. Il lui demande où ils sont mais elle ne peut pas parler. Alors qu'un bruit violent et menaçant se fait entendre à l'extérieur de la pièce, elle lui ordonne de rester silencieux. Il remarque un mécanisme au mur et l'examine mais elle le retient pour l'empêcher de l'approcher. Fuyant le bruit de plus de plus en métal brutal, ils grimpent une échelle pour atteindre le toit flottant de la boîte où ils sont qui flotte dans l'espace. Actionnant un levier d'une cloche géant, elle s'électrocute et tombe dans le vide. Témoin de sa chute, Cooper remarque la tête de Garland Briggs qui lui dit « Blue Rose ». Cooper redescend l'échelle et voit une autre femme à la place de Naido, toujours devant le feu de cheminée. Il aperçoit l'heure de sa montre, 2:53, puis le mécanisme s'allume. Au même moment, son doppelgänger roule sur une route et se sent mal soudainement. L'allume-cigares de sa voiture produit de l'électricité. Le mécanisme électrique s'avère être un portail pour revenir sur Terre. Alors que le bruit résonne toujours aussi violemment, la femme dit à Cooper « Quand vous arriverez là-bas, vous verrez que vous y êtes déjà ». Alors qu'il est aspiré par le portail, son double maléfique fait un malaise, perd le contrôle de sa voiture et se crashe. Alors qu'il voit l'allume-cigares s’électriser, censé le téléporter dans la Loge noire, et les rideaux rouges apparaître devant sa voiture, il se retient de vomir. Pendant ce temps, à Las Vegas, à l'intérieur d'une maison à vendre, Dougie Jones, un autre double de Cooper, prend du bon temps avec Jade, une prostituée. Elle remarque sa bague verte à son doigt et son bras blessé. Alors qu'elle va se doucher, il se lève du lit et s'écroule. Il rampe vers le salon où une prise électrique produit également de l'électricité. Alors que le doppelgänger essaye de ne pas vomir en mettant la main devant la bouche, Jones vomit et se retrouve dans la Loge noire. Le double maléfique vomit finalement du garmonbozia et s'évanouit. Les rideaux rouges disparaissent. Il reste sur Terre contrairement à Dougie Jones. Dans la Loge noire, Dougie Jones, assis sur un fauteuil, est face à MIKE qui lui annonce qu'il a été créé pour un unique but qui est désormais atteint. Les mains de Jones rétrécissent, la bague vert tombe et une flamme noire remplace sa tête humaine. Une petite orbe dorée flotte également et la flamme se transforme en un étrange objet sphérique grisâtre. Ce dernier s'électrise devant MIKE qui se protège avec son bras pour reproduire l'orbe dorée. Celle-ci fait disparaître l'objet sphérique dans une fumée et retombe sur le fauteuil dans une plus petite taille. MIKE la récupère ainsi que la bague verte, qu'il dépose sur son piédestal doré. À Las Vegas, Cooper a pris la place de Dougie Jones et il est retrouvé allongé près de la prise électrique par Jade qui le prend pour Dougie. Amnésique et atteint de catatonie, Cooper a perdu la mémoire et ses souvenirs. Deux hommes, Jake et Gene, tentent de l'assassiner en posant notamment une bombe sous sa voiture, sous les yeux d'un petit garçon dont la mère est une junkie. Alors que Jade s'occupe de Cooper, ce dernier fait tomber dans la voiture de celle-ci l'ancienne clé de sa chambre au Grand Nord à Twin Peaks, unique objet du passé qu'il possède. Jade le dépose devant le Silver Mustang Casino et lui donne 5 $ pour qu'il appelle les secours. Quand elle lui dit de sortir de sa voiture, il se rappelle de Laura qui lui a dit qu'il pouvait sortir. Dans le casino, perdu, un agent de sécurité lui conseille d'échanger son billet contre des pièces pour jouer aux machines à sous. Remarquant un joueur hurler « HELLO ! » à chaque fois qu'il gagne le jackpot, Cooper l'imite et il est guidé par des visions hallucinatoires de la Loge noire situées au-dessus de plusieurs machines à sous où il gagne à chaque fois le jackpot. Pendant ce temps, dans le commissariat de Twin Peaks, Hawk, Lucy et Andy sont incapables de trouver ce qui manque en fouillant des dossiers et donc de résoudre l'énigme posée par la Femme à la bûche. Le docteur Jacoby dore ses pelles dorées avec des bombes de peinture. À Philadelphie, au FBI, l'Agent Tamara Preston débriefe Albert Rosenfield et Gordon Cole à propos du meurtre des deux jeunes personnes devant la boîte en verre au moment où Cole est informé que Cooper aurait été retrouvé dans le Dakota du Sud, arrêté par la police après son accident de voiture...

Continuant à toucher le jackpot Silver Mustang casino, surnommé « Mr. Jackpots » par une clocharde tentant elle aussi de gagner des sous aux machines à jeux, Cooper rencontre un couple d'amis de Dougie Jones, les Shaker. Ils leur informent où vit Dougie Jones avant que Cooper ne soit emmené dans le bureau du superviseur Burns qui lui remet tout l'argent gagné. Ramené à la maison de Dougie Jones en limousine, sa femme Janey-E, inquiète de sa disparition, le gifle et lui demande où il a passé ses trois derniers jours, lui reprochant d'avoir manqué l'anniversaire de son fils Sonny Jim. Furieuse contre Cooper, croyant qu'il s'agit de son mari, son caractère change soudainement lorsqu'elle découvre l'argent gagné au casino qui pourrait rembourser leurs dettes. Le lendemain, dans la salle à coucher des Jones, il aperçoit MIKE qui lui annonce que lui ou son double maléfique, emprisonné après son accident de voiture, doit mourir. Cooper observe minutieusement son reflet dans le miroir de la salle de bain puis fait connaissance avec Sonny Jim lors du petit déjeuner. À Twin Peaks, le shérif Frank Truman, frère d'Harry, est mis au courant à propos de l'énigme de la Femme à la bûche et Bobby Briggs, travaillant aujourd'hui pour la police, après avoir pleuré en tombant sur une photo de son ex Laura Palmer parmi des preuves, lui annonce que Cooper est la dernière personne à avoir vu son père vivant, un jour avant sa mort. Wally « Brando », le fils d'Andy et de Lucy, tous les deux mariés entre temps, rend visite au Shérif pour présenter ses vœux de guérison pour son frère malade, Harry. Dans le Dakota du Sud, à Buckhorn, Constance Talbot informent détective Macklay et le chef Mike Boyd que les empreintes du cadavre sans tête sont protégées par une base militaire. À New York, Gordon Cole passe voir Denise Bryson, devenue cheffe du FBI, pour lui annoncer que Cooper a été retrouvé avant de rencontrer son doppelgänger en prison dans le Dakota du Sud. En prison, alors que de la cocaïne une mitrailleuse et une patte de chien ont été retrouvés dans le coffre de sa voiture, ce dernier annonce à Cole, Rosenfield et Preston qu'il travaillait sous couverture pour l'agent Phillip Jeffries, qui est introuvable depuis de nombreuses années, et qu'il était sur le point de rendre visite à Cole pour le débriefer. Cole et Rosenfield s'interrogent sur le comportement étrange de ce qu'ils croient être le vrai Cooper. Rosenfield lui confie qu'il a autorisé à l’époque Jeffries de donner à Cooper une information à propos d'un homme de Columbia, après que ce dernier lui ait dit qu'il en avait urgemment besoin. Une semaine plus tard, l'homme en question, sans identité, a été retrouvé mort. Après avoir classifiée cette nouvelle affaire « Blue Rose », ils décident de contacter la seule personne, proche de Cooper, qui pourrait les aider, son ancienne assistante, Diane...

À Las Vegas, Gene et Jane informent Lorraine, une femme qui les a engagés pour tuer Jones, à propos de l'absence de ce dernier à Rancho Rosa malgré sa voiture toujours présente devant la maison. Furieuse, elle envoie le chiffre 2 à un destinataire nommé « ARGENT » situé à Buenos Aires, en Argentine. Plus tard, alors qu'une bande de voyous tentent de voler la voiture de Jones, celle-ci explose et les tue sous les yeux du petit garçon, le fils de la junkie, venu l'examiner juste avant l'explosion. Chez les Jones, alors qu'ils quittent leur maison, Janey-E informe Cooper, toujours amnésique et léthargique, en lui disant qu'il a gagné 425 000 $ au casino. En regardant Sonny Jim, il s'émeut aux larmes. Remarquant que sa voiture n'est pas chez eux Janey-E emmène Cooper à la compagnie d'assurances où travaillait son mari Dougie. Il est troublé notamment par la gigantesque statue d'un cow-boy tenant un revolver, située devant le bâtiment, mais se réjouit aussi par l'odeur du café lorsque Phil Bisby, un collègue de Dougie Jones, en apporte pour une réunion où il y rencontre d'autres associés de Jones dont Darren, Rhonda, Frank et Anthony Sinclair. Ce dernier, alors qu'il débriefe un cas d'incendie volontaire d'un client à leur boss Bushnell Mullins, est accusé de mentir par Cooper, après avoir vu une lumière verte éblouir le visage de Sinclair. Dans son bureau, Mullins demande des explications à Cooper et lui confie plusieurs rapports d'enquêter qu'il doit étudier pour le lendemain. Au Silver Mustang Casino, où Cooper a gagné une forte somme d'argent, les frères Mitchum, deux malfrats, battent et renvoient le superviseur Burns avant de le remplacer par Warrick, son bras droit. Ils leur demandent de les appeler si Cooper est de retour. À une station de lavage, un garagiste annonce à Jade qu'il a trouvé une paire de clés d'un hôtel situé à Twin Peaks dans sa voiture, auparavant oubliée par Cooper. Remarquant une adresse, Jade la dépose dans une boîte aux lettres. Dans le Dakota du Sud, à Buckhorn, lors d'une autopsie, la légiste Constance Talbot informe les détectives Macklay et Harrison qu'elle a trouvé une bague de fiançailles appartenant à un certain Dougie Jones, offerte par sa femme Janey-E, dans l'estomac du corps décapité non identifié, mort par décapitation et dont l'identité est protégée par l'armée. En prison, en s'observant dans le miroir, le doppelgänger de Cooper aperçoit BOB. Autorisé à passer un coup de fil, en tapant un numéro, il cause le dérèglement du système de sécurité et déclenche toutes les alarmes, sous les yeux inquiets du directeur Murphy. À son mystérieux interlocuteur, il lui annonce que « La vache a sauté par-dessus la lune ». En raccrochant, tout redevient normal. À Twin Peaks, Rebecca, la fille de Shelly, lui rend visite au Double R pour lui demander de l'argent pour payer sa drogue, et la quitte pour rejoindre son petit ami junkie, Steven, viré auparavant par Mike Nelson, le meilleur ami de Bobby Briggs et aujourd'hui le patron d'une petite entreprise. Au poste de police, Hawk et Andy continuent à cherche ce qui manque et qui pourrait expliquer la disparition non élucidée de Cooper. Au Bang Bang Bar, Richard Horne, le fils d'Audrey, se fait remarquer pour son comportement violent envers deux filles, Charlotte et Elizabeth. Alors que Federico, un employé du relais, lui demande de s'en aller, l'adjoint Chad Broxford, proche du shérif Truman, le protège et lui donne un pot-de-vin. Frank Truman est visité par sa femme Doris, venu lui reprocher son manque de considération envers son père. Le Dr. Jacoby, sous le nom de « Dr. Amp », répand sur Internet des vidéos de théories conspirationnistes dans le but de vendre ses pelles dorées, comptant parmi ses spectateurs Jerry Horne et Nadine Hurley. Au Pentagone, le colonel Davis est informé par le lieutenant Cynthia Knox que l'ADN du corps décapité appartiennent au Major Garland Briggs, disparu depuis de nombreuses années - la seizième correspondance retrouvée en 25 ans... Davis lui informe que si le corps est bien celui de Briggs, le FBI doit être informé. De son côté, l'agent Preston analyse les empreintes du double maléfique de Cooper avec ceux de 1989 de l'agent Cooper. À Buenos Aires, une mystérieuse boîte noire, bipée par le message de Lorraine, se transforme soudainement en petite pépite d'argent. Le soir tombé, en quittant la compagnie d'assurances avec ses rapports d'enquête, Cooper observe longuement et silencieusement la statue de cow-boy...

Jones/Cooper est ramené chez sa femme par des policiers lorsqu'il est découvert dans son état second devant la statue géante du cow-boy. Elle reçoit des photos de son mari avec la prostituée Jade et s'énerve contre lui en lui reprochant ses dettes et son infidélité. Guidé par des petites lumières sur les pages des dossiers que lui a confiés son patron, il dessine dessus des symboles cryptiques, des échelles et des escaliers. Son boss est troublé en les découvrant et le remercie pour l'aide apporté à travers ses dessins qui lui ont transmis une information inconnue. Cooper a une nouvelle hallucination du manchot/MIKE qui lui demande de se réveiller et de ne pas mourir. Janey-E rencontre les deux maîtres-chanteurs qui veulent que son mari rembourse sa dette de jeu et leur donne seulement la moitié de la somme due, 25 000$ au lieu des 52 000$ demandés. Toujours à Las Vegas, un homme mystérieux, Duncan Todd, reçoit un message, symbolisé par les rideaux rouges de la Loge noire, sur son ordinateur et sort une enveloppe marquée d'un point noir de son coffre-fort. Plus tard, un tueur à gages de petite taille, Ike « Le Pic » Stadtler, la reçoit, contenant les photos de Dougie Jones et d'une autre femme, Lorraine, associée à deux autres assassins qui ont posé une bombe sous la voiture de Jones sous ses ordres. Il l'assassine dans son bureau et deux de ses collègues avec un pic à glace. Albert Rosenfield retrouve Diane, la secrétaire et assistante de Cooper, dans un bar. A Twin Peaks, Richard Horne, le fils d'Audrey, a rendez-vous avec son fournisseur de drogues, Red. Humilié d'être comparé à un « gamin », Horne prend la fuite et renverse un petit garçon sous les yeux de sa mère. Carl Rodd, propriétaire du camping La Grosse Truite, est témoin de l'accident et réconforte la femme endeuillée tenant dans ses bras son enfant mort. Dans les toilettes du commissariat, Hawk fait tomber une pièce dans une cabine, qui le mène à découvrir le logo en métal d'une manufacture symbolisée par le chef des Nez-Percés. Remarquant que deux vis manquent à la porte de la cabine, il la démonte et trouve à l'intérieur plusieurs pages écrites, qui semblent appartenir au journal de Laura Palmer. L'énigme de la femme à la bûche est ainsi sur le point d'être résolue...

Hawk et Frank Truman examinent les quatre pages déchirées retrouvées - une reste introuvable - qui appartiennent au journal intime de Laura Palmer qu'elle avait confié à son ami Harold Smith. Une décrit notamment l'un de ses rêves (issu du film Twin Peaks: Fire Walk with Me) où Annie Blackburn, la sœur de Norma dont Dale fut autrefois amoureux, lui annonce que le bon Cooper est prisonnier de la Loge noire. Le shérif Truman, après avoir reçu des nouvelles de son frère malade Harry, appelle le Docteur Hayward, qui lui raconte le jour où il a emmené Cooper à l'hôpital après son retour de la Loge noire avec Annie. Il l'a notamment aperçu à la sortie des soins intensifs, où Audrey Horne fut plongée dans le coma suite à l'explosion de la banque, avant qu'il ne disparaisse. La Lieutenant Knox, à la demande d'un colonel du Pentagone, arrive à Buckhorn pour voir le corps décapité. Elle découvre que le corps est celui du Major Garland Briggs, disparu 25 ans plus tôt. Le corps n'a pas vieilli, semblant celui d'un quadragénaire. Cole et Rosenfield rendent visite à Diane pour la convaincre de rendre visite au doppelgänger de Dale en prison, dans le Dakota du Sud. Bouleversée par la conversation qu'elle a avec lui, elle affirme à Cole qu'il n'est pas Dale Cooper. Son double maléfique fait également du chantage au directeur de la prison Dwight Murphy pour qu'il les relâche, lui et son associé Ray Monroe. Les deux hommes s'évadent à la nuit tombée. A Twin Peaks, Andy Brennan rencontre le propriétaire du camion qui a tué le petit garçon. Celui-ci, à la fois effrayé et inquiet, lui propose un rendez-vous pour parler loin de chez lui. Brennan accepte et l'attend mais le fermier ne vient pas. Au Bang Bang Bar, le barman, Jean-Michel Renault, est impliqué dans un réseau de jeunes prostituées. A Las Vegas, à son travail, Dougie Jones/Cooper reçoit la visite de trois policiers, les Fusco, qui le questionnent à propos de sa voiture détruite par une explosion. En sortant du bâtiment, lui et Janey-E sont attaqués par le tueur à gages Ike « Le Pic » Stadtler, avant que Dale ne le désarme rapidement, retrouvant soudainement ses réflexes d'agent fédéral. A l'Hôtel du Grand Nord, Benjamin Horne et sa secrétaire Beverly essaient de localiser d'étranges bruits dans les murs de son bureau. Beverly lui remet l'ancienne clé de la chambre de Dale, que Jade a postée à Las Vegas après l'avoir trouvée dans sa voiture, quand elle a déposé Jones/Cooper au casino. Beverly retourne ensuite chez elle, où l'attend son mari gravement malade... Au Double R, un homme paniqué rentre et demande aux clients si quelqu'un a vu un certain Bing avant de prendre la fuite.

Le doppelgänger de Cooper demande à Ray Monroe de lui donner la mystérieuse information. Monroe l'abat et aperçoit plusieurs fantômes en haillons qui se regroupent autour de son corps pour le recouvrir de son propre sang. Son ventre s'ouvre et il en sort un orbe contenant le visage de BOB. Effrayé, Monroe s'enfuit et appelle Phillip Jeffries pour lui dire qu'il a peut-être réussi à tuer le double maléfique de Cooper, ignorant qu'il est en fait toujours vivant. Le 16 juillet 1945, à White Sands, au Nouveau-Mexique, une bombe atomique explose en plein désert. Des fantômes crasseux hantent une épicerie en fumée. « L'Expérience » flotte dans l'air et vomit un fluide grisâtre composé d'œufs transparents : un globule comporte notamment le visage de BOB. Dans une immense tour située au milieu d'un océan violet, une femme, Señorita Dido, écoute la musique d'un phonographe. Près d'elle, une cloche géante émet un bruit périodique. « Le Pompier » entre dans la pièce, inspecte la cloche et éteint le mécanisme de celle-ci. Il regarde la projection d'un petit film sur un écran de cinéma, qui n'est d'autre que la scène de l'explosion atomique, des spectres dans l'épicerie et la probable naissance de BOB, vomit par « L'Expérience ». Puis il lévite, une lumière dorée émane de sa tête et forme à son tour un orbe d'or. Elle atterrit dans les mains de Dido, témoin de la lévitation, qui aperçoit à l'intérieur de celle-ci le visage de Laura Palmer. Elle embrasse l'objet et le place dans une machine volante, similaire à un tube pneumatique. Celle-ci éjecte l'orbe dans l'écran, qui affiche la Terre, pour l'envoyer dans le Nord de l'Amérique. 11 ans plus tard, le 5 août 1956, dans le désert du Nouveau-Mexique, en pleine nuit, une créature ailée sort d'un œuf qui éclot. Un homme à la peau charbonneuse, surnommé « L'Homme des bois », descend sur Terre, demande du feu à un couple d'automobilistes qui prennent la fuite, puis il pénètre ensuite dans une station radio. Il tue la réceptionniste et maîtrise le disc jockey pour passer un message à l'antenne. Il répète au micro plusieurs fois l'incantation suivante : « Ceci est l'eau et ceci est le puits. Buvez entièrement et descendez. Le cheval est le blanc des yeux et le noir interne ». Les auditeurs, dont un garagiste, une serveuse et une adolescente revenue d'une promenade avec un garçon amoureux d'elle, s'endorment profondément. La créature ailée s'immisce dans la chambre de la jeune fille inconsciente et entre dans sa bouche. L'homme des bois tue le disc-jockey, quitte la station radio et s'enfonce dans la nuit où l'on entend le hennissement d'un cheval...

Le doppelgänger de Cooper arrive dans une ferme où l'attendent deux complices meurtriers, un couple, Hutch et Chantal, qui ont tué les fermiers. Avant de repartir, il se fait soigner par la femme et son époux lui donne des armes et des munitions. Le double maléfique de Cooper envoie également un SMS crypté à Diane et appelle Duncan Todd pour lui rappeler qu'il doit accomplir une certaine mission pour lui. Il demande enfin au couple de tuer le directeur de prison Murphy avant de leur proposer un autre double contrat à Las Vegas. Suite à la tentative d'assassinat de Dougie Jones, la police de Las Vegas ne trouve rien du tout le concernant avant 1997 qui pourrait clairement l'identifier ː aucun passeport ni certificat de naissance. L'un des détectives Fusco conserve une tasse de café touchée par Cooper/Dougie pour prélever ses empreintes et son ADN. Le tueur à gages Ike « Le Pic » Stadtler, après avoir laissé un message vocal à un certain « J.T. » est également arrêté par les Fusco dans son motel. À Twin Peaks, chez les Horne, Sylvia, la femme de Benjamin et mère d'Audrey, retrouve son fils Johnny gravement blessé à la tête, après qu'il a foncé lui-même dans un mur, alors que Jerry, le frère de Benjamin, est victime d'hallucinations dans la forêt. Le Shérif Frank Truman et ses adjoints Hawk et Bobby Briggs rendent visite à la mère de ce dernier pour parler de Dale Cooper. Elle leur annonce que son mari, le Major Garland Briggs, lui avait prédit dans le passé leur arrivée, peu avant sa mort. Elle leur donne un petite cylindre métallique, caché depuis de longues années dans un fauteuil, et ils découvrent en le cassant deux papiers contenant des instructions précises dont le « Palais de Jack Rabbit », un endroit fréquenté autrefois par Bobby enfant, deux dates, une heure et le nom de Cooper écrit deux fois parmi des chiffres. Dans le Dakota du Sud, à Buckhorn, les agents Cole, Rosenfield et Preston examinent le corps décapité de Garland Briggs et découvrent la bague de fiançailles de Dougie Jones, gravée par sa femme Janey-E, retrouvée dans son estomac. Preston interroge William Hastings - sa secrétaire a été tuée dans l'explosion de sa voiture et son avocat a été arrêté pour le meurtre de la femme de ce dernier, tuée par le doppelgänger de Cooper - qui lui explique que lui et Ruth, la femme décapitée, tenaient ensemble un blog, intitulé « la Quête de la Zone », consacré à leur fascination commune : les univers parallèles. Ils ont réussi à pénétrer dans une autre dimension où ils ont rencontré le Major Garland Briggs où il a hiberné de longues années. Hastings explique également que Briggs voulait sortir de cette réalité alternative et qu'il devait leur donner des coordonnées détenues dans une base de données militaires sécurisée. En lui transmettant les chiffres voulus par Briggs, inscrits sur le bras de Ruth Davenport, Hastings l'a vu flotter, dire deux fois Cooper avant d'assister à la disparition de sa tête. Avant de se réveiller soudainement dans sa maison, il a également été témoin de la mort de Ruth et raconte à Preston que le Major n'était pas tout seul dans cette Zone. À l'Hôtel du Grand Nord, à Twin Peaks, Benjamin Horne et sa secrétaire Beverly tentent toujours de localiser les étranges bruits dans les murs de son bureau et il lui refuse un baiser. Au Bang Bang Bar, alors qu'elle parle avec une amie, une jeune fille, Ella, est prise de démangeaisons et dévoile d'inquiétantes rougeurs sous ses aisselles...

À Twin Peaks, Richard Horne rend visite à Miriam Sullivan, l'unique témoin qui l'a vu prendre la fuite lorsqu'il a renversé le petit garçon. Elle lui annonce qu'elle a écrit au Shérif Truman pour le dénoncer. Horne pénètre dans la caravane et l'attaque sauvagement. Avant de partir, il allume le gaz et une bougie puis il appelle l'adjoint Chad Broxford, un policier véreux, pour lui demander d'intercepter cette lettre avant qu'elle n'arrive au commissariat, ce qu'il fait aussitôt. Horne débarque ensuite chez sa grand-mère Sylvia et l'agresse violemment pour lui voler tout son argent sous les yeux impuissants de son fils Johnny, enfermé dans une camisole en raison de son comportement dangereux. Elle appelle ensuite son ex-mari Benjamin - dont le frère Jerry est toujours perdu dans la forêt - pour lui demander de la dédommager tout ce que leur petit-fils lui a dérobé. Au camping « La Grosse Truite », le propriétaire, Carl Rodd, assiste à une dispute entre Steven Burnett et sa femme Rebecca, la fille de Shelly Johnson, qu'il violente. Le Docteur Lawrence Jacoby continue à partager sur Internet ses vidéos de théories conspirationnistes, visionnées notamment par Nadine Hurley devenue propriétaire d'un magasin de rideaux. A Las Vegas, les deux frères Mitchum sont informés par un journal télévisé que le tueur à gages Ike « Le Pic » Stadtler a été arrêté par la Police et reconnaissent toujours à la télévision « Mr. Jackpot », qui n'est d'autre que Dougie Jones / Dale Cooper. Janey-E Jones s'aperçoit que ce dernier a perdu beaucoup de poids, le séduit et lui fait l'amour. Duncan Todd demande à Anthony Sinclair, un collègue corrompu de Dougie Jones, de le piéger en manipulant les malfrats Mitchum en leur faisant croire que Jones leur a refusé de les indemniser environ de 30 millions de dollars suite à l'incendie criminel d'un de leurs hôtels. Un plan qui devrait les pousser à éliminer eux-mêmes Dougie Jones. Les deux frères le croient et souhaitent rencontrer Jones en personne, accusé par Sinclair d'avoir préparé une vendetta personnelle contre eux. Dans le Dakota du Sud, Cole et Preston assistent à un dîner romantique entre Rosenfield et la légiste de Buckhorn, Constance Talbot. Dans sa chambre d'hôtel, en ouvrant la porte à Rosenfield, Cole a une vision de Laura Palmer en pleurs - une scène issue du film Twin Peaks: Fire Walk with Me. Rosenfield lui annonce que le FBI a localisé un message de Diane envoyé à un destinataire non identifié - le doppelgänger de Cooper -, qui lui annonce que William Hastings a été arrêté et qu'il s'apprête à les guider vers un site. Preston leur montre une photo du double maléfique de Cooper devant la boîte en verre, retrouvée dans une carte mémoire d'une des caméras fixées sur le cube, dans l'immeuble de New York où sont morts Sam Colby et Tracey Barberato. La Femme à la Bûche appelle Hawk et lui affirme qu'un mystérieux cercle est presque complet et que « Laura est l'unique »...

À Twin Peaks, trois garçons jouent à se lancer une balle de Baseball. L'un d'entre eux, en allant la récupérer, découvre Miriam Sullivan, ensanglantée et gravement blessée, au bord d'une route. Becky reçoit un appel concernant Steven, son mari, qui la trompe avec Gersten Hayward, la petite sœur de Donna. Elle s'empare d'une arme à feu, contacte sa mère, Shelly, pour lui demander de lui prêter sa voiture et s'enfuit aussitôt avec, blessant sa mère dans sa fuite. Témoin de l'incident, Carl Rodd lui propose de la conduire en ville. Sur la route, Shelly appelle Norma et lui demande ce qu'elle doit faire. Suivant son conseil, elle appelle son ex-mari, Bobby Briggs, devenu shérif-adjoint et père de Becky, et lui explique la situation. Becky pénètre dans un immeuble et ouvre le feu sur la porte de l'appartement vide de Gersten qui se cache dans les escaliers avec Steven. Au Double R, ses parents lui conseillent de le quitter définitivement, ce qu'elle refuse par amour. Alors que que la mère et la fille se réconcilient sous les yeux de Norma, Shelly aperçoit Red, un dealer influent, et l'embrasse devant Bobby, embarrassé et choqué de la voir avec son amant. Soudainement, un coup de feu retentit devant le Double R, tiré par un enfant dans la voiture de ses parents. Alors que son coéquipier Jesse Helcomb s'occupe de cette famille et gère le carambolage, Briggs s'approche d'une voiture où se trouve une mère de famille en colère klaxonnant hystériquement, accompagnée de son enfant malade pris de vomissements. Au poste de police, enquêtant sur la destination donnée par le Major Briggs, située dans les montagnes de Blue Pine, Hawk montre à Truman un étrange symbole noir dessiné sur une ancienne carte des montagnes de la vie, également inscrit dans le message retrouvé de Briggs et sur une carte à jouer du doppelgänger de Cooper. Truman lui demande sa signification mais Hawk refuse de la lui donner, prétextant qu'il ne doit rien savoir pour son bien. Sachant qu'ils ont découvert quelque chose, la Femme à la Bûche les appelle pour leur dire que l'endroit exact décrit par le Major Briggs qu'ils recherchent est symbolisé par un feu. À Buckhorn, dans le Dakota du Sud, Cole, Rosenfield, Preston et Diane, accompagnés du détective Macklay et de William Hastings, arrivent à l'endroit où Hastings dit avoir rencontré le Major Briggs. Cole et Rosenfield entrevoient de loin un mystérieux bûcheron mais il disparaît brusquement. En s'approchant d'une maison, Cole lève les yeux et aperçoit un gigantesque tourbillon dans le ciel, tout en voyant plusieurs bûcherons sur des escaliers. Levant les bras vers le ciel pour être téléporté, Rosenfield le retient juste à temps. Alors qu'ils découvrent le corps sans tête de Ruth Davenport, Diane distingue un homme des bois fantomatique pénétrer dans la voiture de police où se trouve Hastings mais elle ne prévient pas les policiers. Hastings meurt soudainement, la tête explosée par l'entité surnaturelle. Plus tard, alors que la main de Cole tremble sans raison, Rosenfield lui expose à l'aide d'une photo prise les numéros retrouvés sur un bras de la morte et lui affirme qu'ils peuvent les guider vers une petite ville vers le Nord. Cole et Rosenfield annoncent à Diane, Preston et Macklay qu'ils ont vu ensemble un bûcheron et Diane leur explique l'avoir également vu sortir de la voiture de police après la mort de Hastings. Alors que Rosenfield la soupçonne de cacher quelque chose, après l'avoir vue en train de mémoriser les chiffres inscrits sur le bras de Ruth Davenport, Cole leur détaille l'apparence des autres bûcherons barbus et crasseux hallucinés lors de sa vision. À Las Vegas, Bushnell Mullins, le patron de Dougie Jones, explique au Cooper toujours en état de catatonie que ses symboles dessinés sur les dossiers ont révélé la corruption de la police de la ville aussi bien que le crime organisé. Les Frères Mitchum souhaitant rencontrer Jones en personne pour se venger, Mullins demande à Cooper de leur donner un chèque d'indemnisation de 30 millions de dollars suite à la découverte que l'incendie de leur hôtel était en fait accidentel et non criminel. Alors que son patron le raccompagne vers une limousine censée l'emmener chez les deux malfrats, Cooper aperçoit MIKE dans la Loge noire à l'entrée d'une boulangerie et ressort quelques minutes plus tard avec une boîte en carton carrée. En attendant Cooper dans le désert, Bradley Mitchum explique à son frère qu'il a fait un rêve prémonitoire qui n'était autre que leur rencontre avec Dougie Jones. Sur le point de le tuer, Bradley explique à Rodney que Jones n'est pas leur ennemi et qu'ils ne peuvent pas le tuer, que la boîte que porte Cooper contient uniquement une tarte aux cerises, comme il l'a vu dans son rêve, ce qui s'avère exact. En le fouillant, les Mitchum découvrent le chèque de 30 millions de dollars qui recouvrent leur perte d'argent et, fous de joie, emmènent Cooper à dîner dans un restaurant. Cooper semble reprendre lentement connaissance en savourant des parts de tarte aux cerises...

Dans le Dakota du Sud, dans un hôtel à Buckhorn, Cole et Rosenfield proposent à l'agent Preston de rejoindre l'unité spéciale des agents spécialisés dans les affaires codifiées sous le terme « Blue Rose », ce qu'elle accepte sans hésiter. Rosenfield lui explique que Cole a proposé à l'agent Phillip Jeffries (David Bowie dans le film Twin Peaks: Fire Walk with Me) de diriger cette section qui enquêtait sur les affaires mystérieuses non résolues du Projet Livre Bleu, une commission mise en place par l'US Air Force pour enquêter sur des phénomènes paranormaux liés aux OVNI et fermée en 1970. Les autres agents impliqués dans son équipe étaient Dale Cooper, Chester Desmond (Chris Isaak dans le film Twin Peaks: Fire Walk with Me) et Rosenfield lui-même. Jeffries, Desmond et Cooper sont aujourd'hui tous les trois portés disparus et introuvables. Lorsque Diane les rejoint, Rosenfield lui propose d'avoir une place plus importante dans leur investigation sur la disparition de Cooper. Cole et Rosenfield l'espionnent également depuis qu'ils ont découvert qu'elle envoyait des SMS à quelqu'un de non identifié qui lui demande notamment s'ils sont déjà à Las Vegas ce qu'elle répond par la négative. Toujours dans l'hôtel, alors que Cole flirte avec une Française et que Rosenfield le débriefe sur le dernier message envoyé de Diane, cette dernière découvre que les coordonnées retrouvées sur le bras de Ruth Davenport mènent à Twin Peaks. Les Hutchens, les complices du double maléfique de Cooper, assassinent Dwight Murphy, le directeur de prison, devant chez lui. Son corps est découvert par son fils. À Las Vegas, Sonny Jim Jones entraîne Dale Cooper, toujours en état de catatonie, dans un jardin pour tenter de lui lancer une balle de baseball. À Twin Peaks, alors que Jerry Horne semble fuir quelque chose en courant dans une clairière, Sarah Palmer, devenue dépressive et alcoolique depuis la mort de son mari et de sa fille, se fait remarquer dans une épicerie en annonçant l'arrivée de plusieurs hommes dans la ville avant de quitter précipitamment le magasin. Hawk lui rend aussitôt visite et s’aperçoit qu'elle est nerveuse. Il entend notamment des bruits inquiétants dans sa maison. Elle lui dit qu'ils proviennent de sa cuisine mais elle refuse de le laisser entrer chez elle. Au camping « La Grosse Truite », Carl Rodd, le propriétaire, offre 50 dollars à Kriscol, un résident pauvre, lui demande de ne plus donner son sang pour vivre et qu'il ne doit pas le loyer du mois. Au Grand Nord, shérif Frank Truman rend visite à Benjamin Horne et l'informe du délit de fuite de son petit-fils Richard, recherché après avoir renversé le petit garçon, et de la tentative de meurtre sur Miriam Sullivan, la seule témoin à l'avoir reconnu, depuis hospitalisée. Il tente d'expliquer au shérif que Richard n'a jamais eu de père avant de prendre des nouvelles de son frère malade, Harry. En guise de mémento, il demande à Frank Truman de donner à son frère la clé de la chambre de Dale Cooper qu'il occupait lorsqu'il enquêtait sur le meurtre de Laura Palmer. Benjamin Horne se remémore également son enfance au côté de son père, qui lui a offert un vélo mémorable, et demande à sa secrétaire Beverly d'appeler l'hôpital où se trouve Miriam Sullivan pour annoncer qu'il paye tous ses frais médicaux. Dr. Jacoby enregistre toujours ses vidéos de théories conspirationnistes, sous le nom de « Dr. Amp », visionnées par Nadine Hurley. Audrey Horne est aujourd'hui mariée à Charlie. En se disputant avec lui, son mari prétextant qu'il est trop occupé, elle lui demande de l'accompagner au Bang Bang Bar pour rechercher un certain Billy, qu'elle affirme aimer. Elle a notamment rêvé de lui où il saignait de la bouche et du nez. Paniquée, elle lui demande néanmoins d'appeler Tina, la dernière personne a avoir vu Billy. En lui téléphonant, il reçoit de mauvaises nouvelles le concernant mais refuse de les dire à Audrey. Au Bang Bang Bar, deux jeunes femmes, Abbie et Natalie, parlent de leur amie Angela, amoureuse d'un garçon, Chuck, qui a été aperçu avec une autre fille, Mary. Un homme, Trick, les rejoint et leur raconte qu'une voiture a failli le renverser en venant au relais de la ville.

À Las Vegas, les frères Mitchum, accompagnés de Cooper et de leurs assistantes Candie, Mandie et Sandie, arrivent dans le bureau de Bushnell Mullins afin de lui offrir des cadeaux pour le remercier de les avoir remboursés. Ils achètent également une nouvelle voiture pour la femme de Dougie Jones ainsi qu'une aire de jeux pour Sonny Jim, le fils de Dougie et Janey-E. Se cachant dans son bureau, Anthony Sinclair appelle Duncan Todd qui lui donne un jour pour tuer Dougie Jones. Sinclair demande à un policier véreux, le détective Clark, de lui donner un poison pour l'éliminer. Alors qu'ils sont tous les deux en train de boire un café à la terrasse d'une cafétéria, il en profite pour le verser dans la tasse de Cooper, parti observer une part de tarte aux cerises. Au dernier moment, Sinclair se ravise et verse le café empoisonné dans un urinoir. Après s'être excusé en larmes auprès de Cooper, il confesse à Bushnell Mullins qu'il est corrompu et lié à Duncan Todd, mais également prêt à témoigner contre lui et Clark. Les détectives Fusco apprennent que les empreintes de Dougie Jones appartiennent à un agent du FBI ainsi qu'à un détenu emprisonné dans le Dakota du Sud. Mais l'un des frères Fusco, sans se soucier de l'importance des expertises, les jettent à la poubelle... Après avoir tué Dwight Murphy, les Hutchens sont sur la route, pour honorer un nouveau contrat. Dans le Montana, le doppelgänger de Dale Cooper arrive dans un entrepôt nommé « La Ferme », surveillé par des caméras et occupé par une bande d'hommes menée par Renzo. Il exige de voir Ray Monroe. Un des occupants, Muddy, lui explique qu'il doit d'abord défier Renzo au bras de fer. S'il perd, il lui appartiendra comme tous les autres hommes et s'il gagne, il deviendra leur nouveau leader et il pourra faire parler Monroe. Gagnant le duel, le faux Cooper frappe mortellement Renzo au visage. Seul avec Monroe, alors que leur confrontation est regardée par le gang de Renzo et Richard Horne sur un écran géant, il lui tire dans la jambe et lui demande qui l'a engagé pour le tuer. Monroe lui révèle qu'il s'agit de l'agent du FBI Phillip Jeffries, qui souhaitait s'emparer de quelque chose à l'intérieur de Cooper. Jeffries lui a également remis la bague verte, ornée du symbole recherché par « Mr. C », qu'il était censé lui passer au doigt après l'avoir tué. Monroe lui donne aussi des coordonnées appartenant à la secrétaire de Hastings ainsi que la dernière localisation de Jeffries, le « Dutchman's ». Avant de le tuer, le doppelgänger lui ordonne de se mettre la bague au doigt. Après lui avoir tiré dans la tête, la bague s'évapore et réapparaît dans la Loge noire, suivie du corps de Monroe. MIKE la récupère et la dépose sur son piédestal doré. À Twin Peaks, au Double R, Shelly reçoit un appel de sa fille, Becky, qui lui affirme que son époux Steven est absent depuis deux jours. Sa mère l'invite à la rejoindre au restaurant pour manger. Bobby Briggs arrive également pour rendre visite à Ed Hurley et Norma, tous les deux assis à une table, et leur annonce qu'il a retrouvé quelque chose appartenant à son père. Leur dîner est interrompu par Walter Lawford, businessman et compagnon de Norma. Gérant la franchise de la marque Double R, avec l'accord de Norma, il lui détaille la progression financière de cette dernière. Il tente de la convaincre d'augmenter le prix de ses tartes ainsi que rebaptiser le restaurant de Twin Peaks « Le Double R de Norma ». Assis à une autre table avec Bobby, Ed, toujours amoureux de Norma, les observe de loin. Le docteur Jacoby rend visite à Nadine Hurley, après avoir remarqué une de ses pelles dorées exposée dans la vitrine de son magasin de rideaux. Folle de joie, Nadine le remercie pour ses vidéos et pour ce qu'il a fait pour elle. Ils se remémorent ensemble leur dernière rencontre, sept ans plus tôt, dans un supermarché durant une tempête. Sarah Palmer, seule chez elle, regarde en boucle une séquence de match de boxe à la télévision tout en buvant de l'alcool. Audrey Horne supplie son mari, Charlie, de lui révéler ce que Tina lui a dit à propos de Billy, ce qu'il refuse. Il lui conseille d'aller au Bang Bang Bar pour vérifier s'il y est. Troublée, elle lui avoue qu'elle ne sait plus qui elle est et qu'elle ne se reconnait plus du tout. Elle s'effondre en larmes face à son mari indifférent. Au Bang Bang Bar, James Hurley interprète sur scène Just You, une chanson qu'il a enregistrée dans le passé avec sa petite amie Donna Hayward et Maddy Ferguson, la cousine de Laura Palmer. A une table, Renée, une amie de Shelly, est émue aux larmes en l'écoutant. Dans sa station-service, le « Big Ed's Gas Farm », Ed Hurley, déprimé et seul, boit du café et brûle un morceau de papier.

Dans le Dakota du Sud, à Buckhorn, Gordon Cole contacte le poste de police de Twin Peaks où Lucy le met en relation avec le Shérif Frank Truman. Ce dernier lui explique que son adjoint Hawk a retrouvé les pages déchirées du journal intime d'une certaine Laura Palmer, où cette dernière suggérait l'existence de deux Dale Cooper. De son côté, Albert Rosenfield détaille à Preston la première affaire classée « Blue Rose ». Cole et Phillip Jeffries ont tous les deux enquêté sur une femme, Lois Duffy, qui, avant de se suicider, aurait tué son double qui, avant de mourir, aurait murmuré « Je suis comme la Blue Rose ». Après avoir convoqué Diane, Gordon Cole lui demande si, lors de la dernière fois qu'ils se sont vus, Dale Cooper lui aurait parlé du Major Garland Briggs, ce qu'elle confirme. Rosenfield la débriefe sur la bague de fiançailles de Dougie Jones, offerte par sa femme Janey-E, et retrouvée dans l'estomac du corps sans tête de Briggs. Elle reconnait les noms inscrits dessus : Janey-E n'est autre que sa demi-sœur, qu'elle déteste et qu'elle n'a plus vue depuis des années, entre-temps mariée à un certain Douglas Jones et vivant à Las Vegas. Preston appelle le FBI de Las Vegas où Cole informe les agents Wilson et Randall Headley que les Jones doivent être recherchés pour double homicide. Après avoir expliqué à Preston et Rosenfield ce que le Sherif Truman lui a exposé, à savoir l'existence de deux Cooper, Cole leur raconte qu'il a rêvé de l'actrice Monica Bellucci. À Paris, à une terrasse de café, elle a souhaité le rencontrer pour lui parler brièvement. Cooper est présent mais Cole ne peut pas voir son visage. Elle lui dit que « Nous sommes comme le rêveur qui rêve et ensuite vit à l'intérieur du rêve » tout en lui posant ensuite la question suivante « Mais qui est le rêveur ? ». Suivant son regard, il se retourne et se voit lui-même, le 16 février 1989, le jour où Cooper lui évoque un de ses rêves étranges, mais aussi le retour furtif de l'agent Phillip Jeffries, disparu depuis des années, dans son bureau. Devant Cole, Jeffries lui a pointé du doigt Cooper en lui demandant « Qui croyez-vous qu'il soit ? » - une scène issue du film Twin Peaks: Fire Walk with Me. À Twin Peaks, au poste de police, Bobby Briggs, Andy, Hawk et Frank Truman arrêtent l'adjoint Chad Broxford, policier ripoux et complice de Richard Horne. Briggs les guide ensuite dans la montagne vers le « Palais de Jack Rabbit », l'endroit cité par son Père dans les messages qu'ils ont retrouvés. Dans les environs, ils découvrent une créature allongée, nue et sans yeux, Naido. Alors qu'ils observent un tourbillon qui s'est soudainement formé dans le ciel, Andy est téléporté dans ce portail après avoir tenu la main de la femme inconsciente. Dans un univers parallèle, il se retrouve assis face au Géant qui se présente comme « Le Pompier ». Muet et immobile, Andy lève les yeux vers un écran circulaire. Il assiste alors à une succession d'images dont la naissance de BOB vomi par « L'Expérience », la station-service en feu occupée par les Spectres, « L'Homme des bois » demandant du feu, une lycéenne en train de pleurer - scène issue du pilote de la série, la lycéenne venait d'apprendre la mort de Laura -, le visage de Laura Palmer entouré par deux anges, Naido, Dale Cooper et son double maléfique, un téléphone, lui-même et sa femme Lucy ainsi qu'un poteau électrique où est inscrit le chiffre 6 avant de revenir sur Terre où l'attendent Bobby Briggs, Hawk et Truman. Portant dans ses bras la créature, il leur informe qu'elle doit être protégée car elle est importante. Elle est alors enfermée dans une cellule du poste de police, près des cellules de Broxford et d'un ivrogne défiguré. James Hurley est aujourd'hui garde de sécurité à l'Hôtel du Grand Nord où il travaille avec un jeune coéquipier nommé Freddie Sykes. Ce dernier ne se sépare jamais d'un gant de jardinage vert, qui lui aurait donné une force surhumaine, qu'il considère comme une partie de lui et qu'il ne peut plus enlever sans se mettre à saigner. Il raconte son histoire à Hurley : alors qu'il vivait encore à Londres, un soir alors qu'il se promenait, il a été aspiré par un tourbillon dans le ciel et téléporté dans un autre monde où il a rencontré « Le Pompier », qui lui a dit que ce gant lui donnerait une force inimaginable et lui a également conseillé de se rendre à Twin Peaks pour accomplir sa destinée. Intrigué par son récit, Hurley se rend ensuite dans la chaudière de l'Hôtel où il entend le même bruit incessant également entendu par Benjamin Horne et sa secrétaire Beverly. De son côté, la Mère de Laura Palmer, Sarah, se rend dans un bar où elle est draguée par un camionneur qui devient agressif lorsqu'elle refuse ses avances. Alors qu'il persiste et l'insulte, elle ouvre soudain son visage et lui dévoile les Ténèbres. Elle le mord ensuite mortellement à la gorge, le tuant sur le coup. Au Bang Bang Bar, deux femmes, Megan et Sophie, discutent de Billy. La seconde raconte à son amie qu'il est venu rapidement chez elle alors qu'elle était avec sa mère, Tina. Il est brusquement arrivé dans leur cuisine, saignant de la bouche et du nez avant de repartir soudainement...

À Twin Peaks, Nadine Hurley se promène fièrement dans la rue avec sa pelle dorée, achetée après avoir visionné les vidéos de « Dr. Amp » alias docteur Jacoby. Elle se rend au « Big Ed's Gas Farm », la station-service de son époux Ed pour lui annoncer qu'elle a changé, qu'elle sait qu'il est amoureux de Norma et qu'il l'a sacrifiée uniquement pour elle, trop fragile à l'époque pour qu'il l'abandonne. Elle lui déclare qu'il est libre à présent, lui donnant sa bénédiction pour qu'il vive enfin son amour avec Norma. Nadine s'en va, laissant Ed choqué et interloqué. Ce dernier se rend au Double R pour officialiser sa relation avec Norma au moment où Walter Lawford, le businessman qui a franchisé la marque « Double R », perturbe leur intimité. Alors qu'Ed, désemparé, se commande un café, Norma explique à Lawford qu'elle ne veut plus faire affaire avec lui mais qu'elle le laisse exploiter le nom de son restaurant tout en lui offrant ses parts investis dans les autres diners à travers le pays. Déconcerté par son choix, Lawford lui dit qu'elle fait une erreur et la quitte. Elle rejoint Ed qui lui demande de l'épouser, ce qu'elle accepte. Ils s'embrassent devant une Shelly ravie. Au Bang Bang Bar, James Hurley, accompagné de son ami Freddie Sykes, s'approche de la table de Renée mais son mari Chuck, ainsi qu'un de ses amis, l'attaque violemment lorsqu'il lui adresse la parole. Sykes, armé de son gant de jardinage vert, les frappe et les met à terre pour secourir James. Remarquant qu'ils sont tous les deux gravement blessés et paralysés, Hurley demande aux témoins de la bagarre d'appeler les urgences. Ils sont tous les deux arrêtés par Bobby Briggs et Hawk puis enfermés en cellule près de l'adjoint Chad Broxford, l'ivrogne défiguré et Naido, qui continue à pousser d'étranges petits cris. Dans la forêt de la ville, Steven Burnett et sa maîtresse Gersten Hayward se cachent dans le creux d'un arbre. Armé d'un revolver, il lui confesse qu'il veut mettre fin à ses jours alors qu'elle essaye de le raisonner. Ils sont tous les deux surpris par le journaliste télé Cyril Pons, promenant son chien dans les alentours. Paniquée, Gersten laisse Steven seul avec son pistolet avant d'entendre un coup de feu. Pons se rend ensuite au camping « La Grosse Truite » pour alerter Carl Rodd. La nuit tombée, après avoir quitté « La Ferme », le doppelgänger de Cooper arrive dans une station-service lugubre et abandonnée où, après lui avoir demandé de voir Phillip Jeffries, un spectre barbu et recouvert de suie le guide vers un motel, le « Dutchman's ». Une femme étrange lui déverrouille une chambre où l'attend l'agent Jeffries, qui lui parle à travers une théière géante qui émet de la vapeur. Le doppelgänger lui demande s'il a demandé à Ray Monroe de le tuer et si c'est lui qui l'a contacté auparavant dans un autre motel. Jeffries nie les faits puis il est interrogé à propos de Judy, une de ses connaissances, mentionnée lorsqu'il est réapparu dans le quartier général du FBI à Philadelphie en 1989 - une scène issue du film Twin Peaks: Fire Walk with Me. Jeffries lui répond seulement que l'agent Dale Cooper l'a déjà rencontrée et lui non. Jeffries lui transmet également une série de chiffres. Soudainement, un téléphone sonne. Le double maléfique de Cooper répond mais il est rapidement téléporté à l'extérieur de la station-service, dans une cabine téléphonique. Alors qu'il s'apprête à repartir, il est confronté par Richard Horne qui le menace de lui tirer dessus. Il lui avoue qu'il sait qu'il est un agent du FBI car sa mère Audrey Horne lui a montré une photo de lui. Le doppelgänger le désarme et lui ordonne de monter dans sa voiture avec lui. Avant de partir avec lui, il envoie le message « Las Vegas ? » à un numéro inconnu. L'épicerie produit de l'électricité et de la fumée avant de disparaître. À Las Vegas, après avoir reçu l'appel de Gordon Cole, l'agent Wilson signale à l'agent spécial Randall Headley qu'il a retrouvé le couple Jones. Mais ce dernier découvre que son collègue lui a apporté une famille nombreuse du même nom... Duncan Todd demande à Roger, son employé, de lui amener Anthony Sinclair. Soudainement, ils sont tous les deux abattus par Chantal Hutchens. Cette dernière rejoint son mari Gary dans leur van puis se met à manger son hamburger comme si de rien n'était. Chez les Jones, Janey-E offre une part de gâteau à Dale Cooper, toujours léthargique, et lui raconte à quel point elle est heureuse depuis qu'ils sont devenus amis avec les frères Mitchum. Seul à table, il expérimente une télécommande, posée devant lui, et allume la télévision. Il y voit un passage de Boulevard du crépuscule de Billy Wilder et s'illumine lorsqu'il entend le nom de Gordon Cole, son supérieur, qui n'est d'autre qu'un personnage du film. Remarquant ensuite une prise de courant, Cooper rampe sur le sol et tente d'enfoncer les pointes de sa fourchette à l'intérieur. N'y arrivant pas, il retourne alors sa fourchette pour l'introduire par son manche, puis s'électrocute et cause une panne d'électricité, ce qui alarme immédiatement Janey-E. À Twin Peaks, la Femme à la Bûche appelle Hawk pour lui annoncer qu'elle est train de mourir et ce dernier lui présente ses condoléances. Elle lui parle de la mort, lui expliquant qu'il s'agit d'une transition et non d'une fin, et lui dit qu'il doit se souvenir de tout ce qu'elle lui a dit. Elle lui évoque enfin « l'unique » qui se trouve sous la lune dans la montagne de Blue Pine. Avant qu'elle ne raccroche, il lui fait ses adieux. Dans la salle de conférence du commissariat, Hawk réunit Frank Truman, Andy, Lucy et Bobby Briggs pour leur annoncer le décès de Margaret Lanterman. Chez elle, dans sa cabane, la lumière s'éteint lentement. Audrey et son mari Charlie s'apprêtent à partir de chez eux pour chercher Billy au Bang Bang Bar. Mais elle lui reproche d'être devenu différent avec elle. Agacé par ses reproches et son comportement, Charlie renonce à sortir de chez lui. Il est brusquement attaqué par sa femme. Au Bang Bang Bar, alors que le groupe The Veils interprète leur chanson Axolotl sur scène, une jeune fille seule, Ruby, est littéralement virée de sa table par deux hommes. Elle rampe sur le sol jusqu'à la foule et se met soudainement à hurler...

Le doppelgänger de Cooper et Richard Horne, qui se révèle être son fils, arrivent à un site dans le désert, désigné par des coordonnées que lui ont fourni trois personnes. Alors qu'il inspecte un rocher, obéissant au faux Cooper, Horne grimpe dessus, s'électrocute et se désintègre sous les yeux de son père et de Jerry Horne, témoin à distance de la mort du fils d'Audrey. Le faux Cooper envoie le message « :-) TOUS » à Diane et quitte les lieux. À l'hôpital, plongé dans le coma suite à son électrocution, Cooper est veillé par Janey-E Jones, son fils Sonny Jim et Bushnell Mullins. Les frères Mitchum et leurs assistantes, leur apportent de la nourriture et proposent aux Jones d'approvisionner leur maison. Plus tard, alors que Janey-E et son fils s'absentent, Mullins reçoit un appel de Phil Bisby, collègue de Dougie Jones, lui annonçant que le FBI recherche Dougie. Dans leur van, les Hutchens patientent devant la maison des Jones. Les agents Headley et Wilson du FBI arrivent et, constatant que les Jones sont absents, repartent pour aller à la compagnie d'assurances Lucky 7 Insurance. Plus tard, le duo de tueurs assiste au retour du FBI, venu surveiller la résidence, et à l'arrivée des Mitchum. Un comptable arrive en voiture et demande aux Hutchens de déplacer leur véhicule, prétextant qu'ils gênent son accès chez lui. Suite à leur refus, il sort une arme : les Hutchens sont mitraillés et tués dans leur van. Témoin de la fusillade, comme les frères Mitchum, le FBI arrête le comptable. Au chevet de Cooper, Mullins entend un bourdonnement, semblable à celui de l'hôtel Grand Nord, et le quitte. Soudain, Cooper sort de sa léthargie et se réveille, voit MIKE qui lui annonce que son double maléfique n'est pas revenu dans la Loge noire et lui donne la bague verte. En retour, Cooper lui transmet une mèche de cheveux et lui demande de créer un autre double de lui-même. MIKE lui confirme également qu'il possède toujours la petite graine dorée, apparue lors de la désintégration du vrai Dougie Jones. Redevenu l'agent du FBI et sorti de son amnésie, Cooper annonce à Janey-E, Sonny Jim et Mullins qu'il doit sortir de l'hôpital. Mullins lui donne son revolver et appelle les Mitchum pour leur dire que Cooper emmène la famille Jones dans leur casino Silver Mustang et qu'il a besoin d'un avion pour se rendre à Spokane, dans l'état de Washington. Cooper lui donne enfin un message à lire à son supérieur Gordon Cole s' il l'appelle. Cooper s'en va avec les Jones au moment où le FBI de Las Vegas débarque à l'hôpital. Dans le Dakota du Sud, dans un hôtel de Buckhorn, Diane fume et reçoit le message du faux Cooper. Bouleversée, elle se souvient d'une série de chiffres qu'elle lui envoie én réponse. Anxieuse, elle se rend dans la chambre où se trouvent Cole, Rosenfield et Preston pour leur raconter la dernière fois où elle a vu Cooper. Quelques années après sa disparition, alors qu'elle travaillait encore pour le FBI, il lui a rendu visite et l'a embrassée, mais elle sentait que quelque chose était faux lors de leur baiser, ignorant qu'il s'agissait de son double maléfique. Sentant sa peur, il lui a souri et l'a violée. De plus en plus inquiète et bizarre, elle leur explique qu'il l'a ensuite conduite dans une station-service, avant de déclarer qu'elle est dans le bureau du shérif. Agitée, elle leur dit « Je ne suis pas moi » puis vise Cole avec l'arme à feu cachée dans son sac. Aussitôt, Preston et Rosenfield l'abattent et Diane disparaît subitement. Horrifiée, Preston réalise qu'elle était une Tulpa. Dans la Loge noire, Diane est assise dans un fauteuil. MIKE lui dit qu'elle a été manufacturée, ce qu'elle reconnaît. Son visage se fissure et se casse, dévoile une fumée noire et elle se désintègre avant de se transformer en petite orbe dorée. Au Silver Mustang Casino, les frères Mitchum et les Jones remarquent le changement de comportement de Dale Cooper. En privé, l'agent du FBI révèle à Janey-E et son fils qu'il doit partir, reconnaissant avoir passé de bons moments avec eux, et il leur assure qu'il sera de retour. Janey-E découvre qu'il n'est pas son vrai mari, ni le père de Sonny Jim, ce qu'il n'admet pas explicitement. Mais elle le remercie pour son aide et l'embrasse. À leur tour, sur le chemin vers l'avion, les Mitchum comprennent que Cooper est un agent du FBI : il les rassure en leur déclarant que, au-delà de leurs activités criminelles, il ne voit qu'en eux leurs cœurs d'or. À Twin Peaks, au Bang Bang Bar, alors qu'Eddie Vedder, le chanteur du groupe Pearl Jam, interprète sa chanson Out of Sand sur scène, Audrey et son mari Charlie arrivent au relais. Le maître de cérémonie annonce la musique Audrey's Dance - qui n'est d'autre que le thème musical d'Audrey Horne, entendu dans l'épisode 2 de la première saison. Audrey se met à danser, comme autrefois, devant la foule et son mari. Brusquement, un mari jaloux voit un autre homme proche de sa femme, Monique, et le frappe. Paniquée, Audrey se dirige vers Charlie et lui demande de l'aider à partir. Mais, choquée, elle voit brusquement son propre reflet dans un miroir, dans une pièce blanche. Les musiciens reprennent le thème musical, mais à l'envers...

Dans le Dakota du Sud, à Buckhorn, alors qu'ils portent un toast au FBI, Cole révèle à Preston et Rosenfield un secret qu'il a gardé pour lui pendant 25 ans. Avant sa disparition, le général Garland Briggs lui a raconté, ainsi qu'à Dale Cooper, qu'il a découvert une entité maléfique, appelée « Jowday » puis renommée « Judy ». Phillip Jeffries l'a approchée avant de disparaître et Cooper aurait demandé à son supérieur de le retrouver s'il disparaissait à son tour. Cole leur confie que Ray Monroe, son informateur, lui a dit que le doppelgänger de Cooper était à la recherche de coordonnées avant de recevoir un appel de l'agent Headley qui l'informe qu'il a retrouvé la trace de Douglas Jones mais ce dernier a disparu. Bushnell Mullins lui lit ensuite le message crypté que Dougie Jones lui a laissé où il lui écrit qu'il se dirige vers le bureau du shérif Truman. Cole devine aussitôt qu'il s'agit de Cooper et qu'il est reparti à Twin Peaks. À Twin Peaks, Benjamin Horne apprend au téléphone que son frère Jerry a été retrouvé nu au Wyoming. Au commissariat de Twin Peaks, l'adjoint Chad Broxford est toujours emprisonné, en compagnie de l'ivrogne défiguré, Naido, James Hurley et Freddie Sykes. La créature sans yeux fait des bruits étranges, empêchant les deux agents de sécurité de dormir, puis s'endort. Le doppelgänger de Cooper arrive dans la forêt de Twin Peaks, après avoir suivi ses coordonnées. Il arrive près du « Palais de Jack Rabbit », l'endroit où le shérif Truman et ses adjoints ont découvert Naido. Un tourbillon se forme dans le ciel et il est téléporté dans le manoir de « Le Pompier », où flotte la tête de Garland Briggs. Un écran de cinéma montre la maison des Palmer et une route devant le bureau du shérif où le faux Cooper est transféré. Au moment où il s'approche du commissariat, où il aperçoit Andy qui le reconnaît, Naido se réveille, paniquée et l'ivrogne arrache son bandage recouvrant son visage ensanglanté. Andy emmène le double maléfique de Cooper à l'intérieur du poste de police où il rencontre Lucy et Frank Truman. L'adjoint Broxford, grâce à une clé cachée dans la semelle de sa chaussure, s'échappe de sa cellule pour s'armer dans l'armurerie. Andy se souvient d'une vision de lui et de sa femme, qu'il a eu lors de sa rencontre avec « Le Pompier ». Il descend rapidement dans la prison, pour trouver Hawk et lui apprendre que Cooper est revenu, où Broxford le menace de son revolver mais ce dernier est assommé par Freddie Sykes, à travers la porte de sa cellule, à l'aide de son gant vert qui lui donne une force décuplée. Dans le bureau du shérif Truman, le faux Cooper lui explique qu'il est revenu en ville pour des affaires inachevées. Lucy coupe leur entretien en transférant un appel du vrai Cooper à Truman où ce dernier lui dit qu'il sera bientôt en ville. Démasqué, le doppelgänger de Cooper tire dans le chapeau de Truman mais il est aussitôt abattu par Lucy. L'agent Cooper déconseille à Truman de s'approcher de son double mort alors que Andy, Hawk, Freddie, James et Naido arrivent dans son bureau qui, sans explication, s'assombrit et ils voient des spectres recouvrir le cadavre de son propre sang, afin de le ressusciter. Dale Cooper et les frères Mitchum arrivent d'emblée et voient aussi l'orbe noire contenant BOB s'extirper du ventre du doppelgänger. Il attaque Cooper puis Freddie qui, blessé, réussit à l'éclater en plusieurs morceaux avec son poing surpuissant. Cooper place la bague verte au doigt de son double qui disparaît immédiatement. Celle-ci tombe sur le sol de la Loge noire. L'agent du FBI demande à Truman de lui donner la clé de son ancienne chambre à l'hôtel Grand Nord puis retrouve enfin Cole, accompagné de Preston et Rosenfield, débarque dans le bureau suivi des assistantes des Mitchum. Troublé par la présence de Naido, il annonce également à Bobby Briggs, également arrivé dans la pièce, que son père était courant des événements qui ont eu lieu ici même. Naido s'approche de Cooper, son visage lui dévoile la Loge noire avant de se couper en deux pour révéler la vraie Diane. Ils s'embrassent et elle lui dit qu'elle se souvient de tout. Alors que le visage de Cooper se superpose sur eux et proclame « Nous vivons à l'intérieur d'un rêve », il déclare aux témoins présents dans la pièce qu'il espère tous les revoir un jour. Le bureau du shérif s'assombrit une seconde fois et Cole suit Cooper et Diane dans les ténèbres. Ils arrivent dans la chaudière de l'hôtel Grand Nord où ils suivent le bruit indétectable. Ils y trouvent une porte mais Cooper leur recommande de ne pas le suivre. Il leur fait ses adieux et la traverse seul. Dans le noir total, il fait face à MIKE, qui lui récite le poème Fire Walk with Me avant d'être téléporté à la station-service abandonnée. MIKE le guide vers le « Dutchman's », le motel où se trouve Jeffries sous la forme d'une théière géante. Ce dernier lui décerne, par la vapeur qu'elle émet, des instructions pour trouver Judy dont le pétroglyphe de la grotte de Twin Peaks. Le symbole se transforme en deux diamants qui forment à leur tour le chiffre huit. Cooper est ensuite éjecté de la chambre du motel et voyage dans le temps où il se retrouve à Twin Peaks, la nuit de la mort de Laura Palmer. Laura s'enfuit de chez elle pour partir en moto avec son petit ami James Hurley sous les yeux de son père Leland, possédé par BOB. Loin de chez elle, au bord d'une route, ils s'embrassent mais elle remarque Cooper, caché dans les bois, et hurle de peur. James lui propose de la raccompagner à la maison mais, sur leur route, Laura tombe de la moto et, en pleurs, lui dit qu'elle l'aime avant de s'enfoncer toute seule dans la forêt. James la laisse et repart chez lui. Alors qu'elle doit rejoindre Leo Johnson, Jacques Renault et Ronette Pulaski pour participer à une orgie, elle rencontre Dale Cooper sur son chemin. Elle lui dit qu'elle l'a déjà vu dans l'un de ses rêves. Il lui prend la main, pour la ramener chez elle et pour tenter de la sauver de sa propre mort. Dans une réalité modifiée, elle est toujours vivante. Alors que Josie Packard se maquille, Pete Martell embrasse son épouse Catherine et part pêcher normalement, sans découvrir le cadavre de Laura, qui a disparu de l'endroit où il est censé le découvrir. Dans le monde réel, dans sa maison, Sarah Palmer détruit le cadre de la photo de bal de sa fille Laura et s'acharne dessus. Dans le passé, Cooper et Laura se tiennent toujours la main pour sortir ensemble de la forêt mais, soudainement, lorsqu'il se retourne, il remarque qu'elle a disparu. Il entend ses cris de terreur...

Dans la Loge noire, le doppelgänger de Cooper, assis dans un fauteuil, brûle. MIKE, à l'aide d'une graine dorée et d'une mèche de Dale Cooper, crée un nouveau Dougie Jones. Ce dernier, lorsqu'il retourne chez lui, est chaleureusement accueilli par sa femme Janey-E et leur fils Sonny Jim. Dans un passé modifié, Cooper, la nuit du meurtre de Laura Palmer, lui tient la main pour la ramener chez elle et l'éloigner de sa propre mort inévitable. Lorsqu'il se retourne, elle a disparu et il entend ses cris de terreur. Dans la Loge noire, Cooper est assis face à MIKE qui lui pose la question « Est-ce le futur ou le passé ? ». L'agent du FBI observe le fauteuil vide Laura et suit MIKE pour voir « Le Bras », qui lui demande si « c'est l'histoire d'une petite fille qui vit à deux pas de l'allée ». Puis Laura murmure à l'oreille de Cooper, à nouveau dans son fauteuil. Soudainement, elle crie et elle est éjectée de la Loge noire. Cooper, perdu, rencontre Leland Palmer, le père de Laura, qui lui dit de retrouver sa fille puis il traverse des rideaux mouvants où il aperçoit Glastonbury Grove, l'entrée de la Loge noire située dans la forêt de Twin Peaks, où l'attend Diane. Elle veut savoir s'il est bien le vrai Cooper qui, lui aussi, l'interroge pour être sûr qu'elle est la vraie Diane. Ils partent aussitôt en voiture, parcourt 430 miles et Diane l'avertit que sa destination ne sera sans doute pas ce qu'il espère. Lorsqu'ils y arrivent, au milieu d'une route en plein désert, Cooper sort de la voiture et inspectent les alentours. Il revient vers elle et lui qu'il s'agit du bon endroit. Ils s'embrassent avant de rouler à travers un portail qui les téléporte sur une route sombre. Ils atteignent ensuite un motel en pleine nuit. Cooper sort de la voiture pour louer une chambre alors que Diane voit son double près de l'entrée qui disparaît lors qu'il revient vers elle. A l'intérieur, alors qu'ils font l'amour, Diane lui cache le visage et sanglote. Le lendemain matin, Cooper se réveille seul et découvre un message d'adieu adressé à un certain Richard et signé Linda, qui lui annonce qu'elle est partie pour toujours, que leur histoire est terminée et qu'il ne doit pas la retrouver. Cooper quitte ensuite le motel et remarque que le bâtiment est complètement différent de celui de la veille. Alors qu'il atteint la ville d'Odessa, il s'arrête à un café nommé « Judy's ». Il demande à Kristi, la serveuse, si sa collègue travaille aujourd'hui également. Cette dernière, intriguée, lui répond qu'elle a un jour de congé. Alors qu'il boit son café, il voit trois clients, des cowboys, harceler Kristi et leur conseille de la laisser tranquille. Ils le menacent avec leur revolver mais Cooper les désarme rapidement. Il demande à Kristi de lui donner l'adresse de sa consœur qui lui écrit sur un bout de papier. Cooper quitte aussitôt le restaurant face à des clients circonspects. En arrivant à la maison de la serveuse manquante, Cooper note la présence d'un poteau électrique portant le chiffre 6 devant sa résidence. Il toque à la porte et découvre une sosie âgée de Laura Palmer. Intrigué, il lui demande si elle s'appelle Laura, ce qu'elle répond par la négative. Elle lui rétorque qu'elle s'appelle Carrie Page mais Cooper insiste que son prénom est Laura et lui propose de la ramener chez sa mère Sarah, dont le prénom la trouble. Elle accepte et lui propose de rentrer chez elle, le temps qu'elle prépare ses affaires. Il y découvre le cadavre d'un homme, mort d'une balle dans la tête, ainsi qu'une statuette d'un cheval blanc. Sur la route vers Twin Peaks, la nuit tombée, alors qu'ils roulent, Carrie se sent poursuivie par une autre voiture qui les suit. Elle raconte superficiellement à Cooper des morceaux de sa vie à Odessa puis s'endort. Il s'arrêtent ensuite à une station-service. Arrivés à Twin Peaks, Cooper demande à Carrie si elle reconnaît la ville, en passant notamment devant le Double R, mais elle ne se souvient de rien. Devant la maison des Palmer, Cooper toque mais il découvre que les Palmer sont absents. Ils font connaissance avec la nouvelle propriétaire, qui ne connaît pas le nom de Sarah Palmer et qu'elle a acheté la résidence à une certaine Mrs. Chalfont. Puis elle leur donne son nom : Alice Tremond. Perplexes, Cooper et Carrie partent. Confus, Cooper hésite à repartir, se retourne en direction de la maison des Palmer et, sentant que quelque chose ne va pas, se demande en quelle année ils sont. Carrie la regarde à son tour et entend Sarah Palmer crier le nom de sa fille. Soudainement, Carrie hurle d'effroi alors que la maison plonge dans le noir total...