Trois ans après l’affrontement entre Hiro et Leon, le calme semble revenu, même si Marguerite, la nouvelle PDG de Genesis, reste plus que vigilante. De son côté, un jeune garçon du nom de Light Tenryu fait son entrée à l’académie Shadowverse, bien que n’ayant jamais joué à ce jeu…

Maintenant que Light s’est trouvé un club Shadowverse, il va falloir qu’il s'arrange pour l’empêcher de fermer. Et comme les inscriptions ne suivent pas trop, ses amis et lui vont devoir aller chercher les membres potentiels où ils sont : dans les autres clubs…

Le duel de Light et de Shinobu continue, avec un Light qui découvre peu à peu le potentiel de son deck et les capacités de ses cartes. Se pourrait-il que, malgré son inexpérience, il puisse faire jeu égal avec la présidente de Sixth Magic ?

Le véritable génie derrière la victoire sans surprise de Shinobu a fait son apparition, et son nom est aussi inattendu que son apparence. S’engage alors un duel sans merci entre Light, qui a déjà bien progressé, et cet étrange adversaire à la langue acérée…

Trop en confiance, Gentleman ? Lui qui ne cessait de vanter son expertise Shadowverse commence à voir les attaques de Light l’atteindre de plus en plus, même en sortant des cartes parmi les plus redoutables.

Il manque toujours deux membres pour que la survie de Seventh Flame soit assurée. C’est pourtant tout à fait par hasard que Light va avoir l’occasion de convaincre un des membres de Fifth Sword, un club très exigeant physiquement, de la nécessité de les rejoindre.

Tatsumi, le président de Fifth Sword, a très mal pris la proposition faite à Ren de quitter son club pour Seventh Flame. Il lance donc un défi à Light et ses amis, mais cette fois-ci, c’est Itsuki qui se porte volontaire pour tenter de battre ce garçon au style diamétralement opposé au sien.

On commence à parler de plus en plus, à l’académie Shadowverse, du club moribond qui cherche à sauver sa peau au détriment des autres. Si certains approuvent la démarche, d'autres sont choqués. Ils vont devoir s’y faire, parce que Seventh Flame se tourne déjà vers une nouvelle proie : Fourth Wind…

Subaru est aux prises avec Fuwari, la présidente de Fourth Wind, qui clame haut et fort sa passion pour Shadowverse et le beau jeu. Soutenue par ses supporters, elle reproche à Subaru son manque de sérieux et son peu de motivation.

Jeune fille très populaire, Tsubasa est aussi à la tête de Third Feather, dont elle a hérité après la victoire écrasante de Haruma sur sa présidente. Elle s’évertue d’ailleurs à faire profil part pour ne pas subir le même sort, ce qui lui permet de mener une existence facile et sans heurts, même si cela lui pèse…

Comme l’avait d'ailleurs anticipé Tsubasa, Light et ses amis vont toquer à la porte de Third Feather pour tenter de recruter leur ultime membre. Mais la présidente est déjà au stade, bien décidée à en découdre.

Tsubasa oppose à Light la panoplie complète de ses cartes et se décide enfin à livrer bataille sérieusement. Son adversaire n’en continue pas loin à garder le même sourire confiant, sans être le moins du monde découragé par la situation.

Enfin six, nos amis de Seventh Flame courent directement auprès de Haruma pour le provoquer en duel. Mais malgré les progrès réalisés, Light a encore beaucoup à apprendre, et Haruma est vraiment trop fort.

Haruma, adversaire décourageant et antipathique au possible, brise impitoyablement les espoirs de Light avec ses combos meurtriers assaisonnés de phrases assassines. Notre ami trouvera-t-il la solution à temps ?

Totalement sonné, Light retrouve ses amis et leur apprend sa défaite tout en gardant pour lui les paroles prononcées par Haruma. Une rencontre avec l’administrateur de l'école va heureusement lui remonter le moral.

En proie à de vives inquiétudes à cause de l’ultimatum lancé par Mikado, Subaru croise le chemin d’une jeune fille importunée par un démarcheur d’Enigma, un groupe qui promet une plongée dans le monde virtuel. Elle semble aussi mal dans sa peau que lui…

Subaru peine face à Mimori, mais l’intérêt de cette bataille très bon enfant réside ailleurs. Pourquoi donc Subaru joue-t-il avec si peu d’entrain ?

Itsuki trouve enfin celui qu’il cherchait pour se familiariser avec le style des Vampiriques, mais on ne peut pas dire que ce soit dans l’ambiance la plus amicale qui soit. En effet, l’individu en question a lâchement abandonné son amirtuel, récupéré par Itsuki…

Malgré ses sarcasmes, Ryôga est bien obligé de convenir qu’Itsuki se révèle plus distrayant que prévu. Cela ne l’empêche pas de passer à la vitesse supérieure, et le président de Seventh Flame a bien du mal à suivre.

Tsubasa a beau faire à présent partie de Seventh Flame, elle ne fait pas beaucoup d’efforts pour s’intégrer. Après Gentleman, Ren s’y casse aussi les dents, mais elle est du genre coriace.

La gentillesse et la passion de Ren aura-t-elle raison de la froideur et du détachement de Tsubasa ? La réponse semble évidente, à voir cette dernière empiler les coups gagnants et collectionner les habiletés, mais à Shadowverse, rien n’est jamais perdu, et ce jusqu’à la fin de la partie…

Chez Tsubasa, Ren apprend à mieux connaître l’ex-présidente de Third Feather, et découvre que derrière la star de l’école, admirée pour sa classe et sa beauté, se cache une jeune fille pas si parfaite que ça, et plus intéressée par les autres qu’elle n'en a l'air.

Lors du duel qui l’oppose à Gentleman, Tsubasa bombarde son adversaire de questions, ne comprenant pas pourquoi quelqu’un d’aussi talentueux a ressenti le besoin de se dissimuler derrière un avatar. Il faut dire aussi que l’attitude de Gentleman lui rappelle beaucoup la sienne.

Malgré tous les progrès constatés dans le jeu des uns et des autres, Seventh Flame n’est toujours pas en mesure de ramener Haruma à la raison, c’est-à-dire de le battre. Chacun va essayer à sa façon de trouver un Nécromancier d’un niveau suffisant pour se préparer à ce duel fatidique.

Light se réjouit d’avoir la chance de disputer une bataille avec Andrea, qui lui dispense nombre de judicieux conseils. Elle ne le ménage pas pour autant, mais Light ne se laisse pas faire.

Après être passé si près de la dissolution et avant la grande compétition interclubs, il est normal que Seventh Flame reprenne un peu son souffle en nous rappelant quelles péripéties ont accompagné sa résurrection.

La partie continue, toujours plus à l’avantage de Shinobu. Le pauvre Gentleman, ou plutôt la pauvre Shion, réalise que son vis-à-vis n’a plus rien de la dilettante un peu déprimante qu’elle était auparavant. C’est que depuis le départ de Gentleman pour Seventh Flame, bien des choses ont changé.

Cette compétition semble placée sous le signe des retrouvailles, puisque Tsubasa va devoir se mesurer, de façon tout à fait inattendue, à Seira, l’ex-présidente de Third Feather. Or, elle ne l’a jamais battue auparavant…

Ren, à qui il n’en faut déjà pas beaucoup pour s’enflammer, a été si fortement marquée par le duel précédent qu’elle s’embarque la fleur au fusil dans une bataille contre Tatsumi, le président de Fifth Sword. Les deux adversaires semblent armés de la même combativité, mais l’un d’eux a quelque chose en plus…

C’est à Subaru d’entrer en scène face à la présidente de Fourth Wind, son amie Fuwari Hahajima. Si cette dernière est ravie de constater le changement d’attitude du jeune homme, ce n’est pas pour autant qu’elle va le laisser gagner.

La compétition se poursuit avec la demi-finale entre Seventh Flame et Second Blood, un club pourtant inactif depuis un bon bout de temps. C’est aussi le retour du match perdu par Itsuki face à Ryôga, qui avait abandonné son amirtuel.

Depuis le temps que Light attend de pouvoir affronter et battre le président de First Reaper, il s’est beaucoup amélioré, en particulier en affrontant des Nécromanciers. La compétition interclubs Shadowverse voit donc débuter son dernier match dans une ambiance survoltée et pas mal de tension entre les deux finalistes.

Les propos de Haruma font comprendre de plus en plus clairement que le harceleur en chef de l’académie Shadowverse fut lui-même brisé par la morgue et la cruauté d’un adversaire plus fort que lui. Light atteindra-t-il son véritable but, à savoir non pas vaincre Haruma, mais le cerner un peu mieux ?

Après l’effort, le réconfort ! Seventh Flame au grand complet met le cap sur l’île privée de la Genesis Company avec quelques amis choisis pour une journée de détente et de jeux. On ne peut qu’admirer la naïveté de nos jeunes joueurs, s’ils croient qu’il s’agit uniquement de les récompenser.

Seventh Flame et ses invités s’en donnent à cœur joie sur Genesis Island, entre barbecue et châteaux de sable. Shion, qui est venue par un autre bateau, réussit finalement à se présenter aux autres, très surpris de découvrir le véritable visage de Gentleman…

Après avoir battu Haruma, Light est encore plus désireux de faire la connaissance de Mikado Shirogane. Maintenant qu’il a un peu plus de bouteille, il devrait être blindé contre l’attitude cruelle et désinvolte de l’administrateur de l’académie, mais rien à faire…

Contrairement à Haruma, chez lequel le sadisme était surtout l’expression d’une souffrance intolérable, Mikado affiche tranquillement et sans passion son mépris pour ses adversaires. C’est aussi son point faible, car, en réalité, il s’ennuie…

Après son affrontement avec Mikado, Light était si épuisé qu’il a dormi trois jours, ce qui a beaucoup inquiété ses amis de Seventh Flame. Il a à peine le temps de les remercier qu’un nouveau défi s’annonce : il s’agit de gagner son ticket d’entrée pour une confrontation avec les fameux Seven Shadows.

Light affronte donc Vanessa et Vivian Justine, qui ne sont pas là pour plaisanter puisqu’elles ont été engagées par le PDG de la Genesis Company. Notre héros réussira-t-il à battre ces duettistes particulièrement redoutables ?

En gagnant 2 500 points grâce à son premier duel, Light est passé d’un coup de l’ombre à la lumière. Immédiatement, un nouveau joueur se présente à lui, très intrigué par ce garçon dont il n’avait pas encore entendu parler, alors que lui-même est un joueur pro…

Light tombe sur Mikado et lui propose un nouveau duel. Une fois encore, son adversaire lui fait part de son ennui profond à ne pouvoir être battu par personne et sa confiance absolument dans ses dons naturels, se moquant ouvertement de la motivation de Light et de ses efforts.

Au soir du premier jour du Classement mondial, Seventh Flame se réunit pour faire le point. Malgré son enthousiasme habituel, Light semble un peu plus tendu qu’à l’accoutumée, ce que Subaru remarque tout de suite…

Shion a soif de victoire, et avoir gagné cinq fois d’affilée ne semble pas l’avoir contentée. Avisant un joueur très intéressant dans la foule, elle décide de prendre le risque de l’affronter.

Quittons un peu Seventh Flame, et intéressons-nous à Wolfram Zega, le fondateur de l’académie Shadowverse. Dans le même esprit que celui qui l’aurait poussé à aborder Light autrefois, le voilà qui se présente à Ryoga Jasei pour lui lancer un défi.

Itsuki a secouru Ryoga, qui risquait l’hypothermie, mais c’est un autre joueur des Vampiriques qui va se dresser face à lui pour lui proposer un duel. Et c’est loin d'être le premier venu…

En ce troisième jour du Classement mondial, Ren commence à paniquer en voyant qu’elle ne parvient pas à gagner assez de duels. Elle en est là de ses réflexions, lorsque quelqu’un la bouscule sans ménagement.

La déconcertante adversaire de Ren, aussi fan de séries de superhéros qu’elle mais plutôt côté méchants, continue à se moquer de sa naïveté et de sa gentillesse. Pendant ce temps, Tsubasa demande une faveur à Mme Andrea.

Tsubasa a fort à faire pour contrer les attaques de Mme Andrea, qui l’intrigue de plus en plus. Comment se fait-il que quelqu’un de si fort soit si peu connu ?

Le quatrième et dernier jour de compétition se lève, avec un petit changement de règlement pour les sept premiers du classement. Light va saisir cette occasion pour essayer d’avoir sa revanche sur Seiya, qui occupe la deuxième place.

L’affrontement final de Light et Mikado tient toutes ses promesses, et même si Mikado semble une fois de plus avoir l’ascendant sur Light, ce dernier ne se laisse plus déstabiliser par l’arrogance de son adversaire. Mais cela suffira-t-il ?

Le Classement mondial arrive à son terme. Light a enfin réussi à battre Mikado, mais celui-ci a du mal à l’accepter. Pendant ce temps, les autres membres de Seventh Flame terminent leurs duels contre les joueurs professionnels les mieux classés.

Light et ses amis retrouvent Mikado et Ryoga à la Genesis Company. Les huit gagnants du Classement mondial sont ensuite emmenés en hélicoptère à la mystérieuse zone Shadow, où les attendent les membres de Seven Shadows.

Le duel opposant Hiro à Mikado commence, mais contrairement à ce qui avait été annoncé, le joueur de Seven Shadows n’utilise pas les Draconiques. Cependant, Mikado est loin de perdre confiance pour autant.

Furieux que Hiro mette le doigt sur ses faiblesses, Mikado s’emploie à détruire les combattants de son adversaire. Cependant, ce dernier reste de marbre face à ses attaques.

Malgré le refus de Mikado, Light décide finalement de l’accompagner. Ses amis poursuivent donc leur route sans lui et arrivent à la zone suivante, où la manieuse de Nécromanciers de Seven Shadows les attend.

Le duel opposant Tsubasa et Andrea se poursuit. Tout en jouant, Tsubasa tente de convaincre Andrea qu’elle a toujours de l’espoir dans sa vie, mais cette dernière reste de marbre et continue à déployer sa puissance écrasante.

Tandis que Marguerite se remémore les circonstances qui l’ont amenée à devenir la PDG de la Genesis Company, elle reçoit une visite inattendue. Dans la zone Shadow, Ryoga s’apprête enfin à affronter Wolfram Zerga.

Ses espoirs déçus, Wolfram prend l’ascendant sur Ryoga et s’apprête à mettre fin à leur duel. Démonia parviendra-t-il à secourir son ami à temps ? Et surtout, Ryoga acceptera-t-il enfin son aide ?

Ren et Hina se retrouvent pour un nouveau duel. Tandis que Ren est heureuse de revoir une autre fan de Battle Fencer, Hina compte bien lui prouver à cette occasion que le Mal est supérieur au Bien.

Après avoir joué une nouvelle amulette, Hina change de style de combat et attaque de plus belle son adversaire. Très vite, Ren se retrouve en mauvaise posture, mais elle ne désespère pas pour autant.

Tandis que Mikado s’obstine à nier sa défaite et à rejeter l’aide de Light, Subaru s’apprête à affronter le prochain joueur de Seven Shadows, qui n’est autre que son petit frère.

Les amirtuels transformés en monstres attaquent le monde entier. À Nekome, les présidents des clubs Shadowverse s’allient pour secourir les élèves. Pendant ce temps, Marguerite confie une mission cruciale aux vainqueurs du tournoi.