Ce qui commence comme une journée typique à Domino High School s'avère tout sauf typique. Le groupe se lance dans un voyage exotique à quatre en Inde, mais lorsque leur avion s'écrase dans une forêt déserte, leurs vacances reposantes se transforment en un dangereux jeu de survie !

Réalisant qu'ils font désormais partie d'une version réelle du jeu de société Capsule Monsters, le groupe a du mal à trouver une issue.

Enfin réunis, Yugi et ses amis se réjouissent. Mais leur célébration est bientôt interrompue par une meute de loups mangeurs d'hommes, une tortue géante et un génie en colère !

Grand-père traduit une ancienne tablette de pierre qui demande au gang de localiser la « Forteresse de la peur ». Maintenant, ils ont jusqu'au coucher du soleil pour trouver cette mystérieuse structure ou ils seront piégés dans le monde de Capsule Monsters pour toujours !

Yugi et ses amis découvrent que pour rentrer chez eux dans le monde réel, ils doivent passer une série de tests - les cinq épreuves sacrées - dont le premier les oppose à d'énormes vers de sable et à une voix mystérieuse qui voyage avec le vent du désert.

Après avoir échappé de peu à leur bataille dans le désert, le gang se retrouve bloqué sur une mystérieuse île flottante. Ici, ils doivent affronter un monstre qui tire sa force du soleil lui-même ! Mais cette créature de lumière travaille-t-elle seule !?

C'est au niveau trois que Yugi et ses amis sont transportés dans un terrain vague recouvert de lave. Pour aggraver les choses, Joey est possédé par une force maléfique, et la détruire peut signifier également détruire Joey !

Yugi et ses amis sont confrontés à une tâche impossible - localiser une pomme magique dans une forêt pleine de pommiers. Comme si cela n'était pas assez difficile, ils se retrouvent piégés dans un labyrinthe sans fin avec des créatures dangereuses à chaque tour !

Le gang tombe sur un petit royaume dominé par un clan de dragons féroces connu sous le nom de The Fiendish Five. S'ils ne parviennent pas à tuer ces bêtes, l'un des amis de Yugi doit abandonner son âme !

Yugi et ses amis battent les Fiendish Five… du moins c'est ce qu'ils pensent ! Ces dragons féroces ont fusionné et sont maintenant plus puissants que jamais ! Le gang terminera-t-il son cinquième et dernier test, ou sera-t-il piégé pour toujours ?

Bien que le groupe ait réussi les cinq épreuves sacrées, l'épreuve la plus dangereuse reste à venir. Maintenant, Yugi doit affronter l'esprit d'Alexandre le Grand dans une guerre totale contre les monstres capsule avec les enjeux ultimes !

Les amis de Yugi sont inconscients, le laissant vaincre Alexandre le Grand tout seul ! Cependant avec l'indestructible Reshef the Dark Being dans son coin, Alexander semble invincible !