L'HMS Petrel glisse sur les eaux pour gagner l'Angleterre. A bord, Tom Lowe, un espion anglais chargé de garder un œil sur un outil de navigation ultra-sophistiqué qu'abrite le navire. Lowe doit aussi, si l'opportunité se présente, assassiner Edward Teach, alias Barbe Noire, un pirate que tous croient mort depuis des années...

Barbe Noire convie son vieil ami et allié, le capitaine Sam Valentine, à passer quelques temps auprès de lui sur l'île de Santa Campana. Il lui propose de revendre l'objet dérobé aux Anglais. Mais Valentine en a décidé autrement. Lowe tombe dans le piège que lui tend son rival, maître dans l'art de la manipulation...

Lorsque Kate est capturée lors d'un voyage commercial, Barbe Noire et Lowe doivent travailler ensemble afin de la sauver avant qu'elle ne révèle l'emplacement de l'île à William Jagger. Au cours du processus, Lowe découvre que Barbe Noire a un motif caché, profondément personnel, pour le garder à ses côtés.

Ayant appris les plans de Barbe Noire d'attaquer des civils innocents en Jamaïque, Lowe élabore un moyen de rendre compte à son maître espion, William Jagger. Mais après l'avoir fait, Lowe découvre que Jagger pourrait être un fou encore plus grand que le Commodore. Le moment est venu de choisir entre deux maux. Vers où va-t-il se tourner ?

Lowe projette de kidnapper Barbe Noire pour le livrer aux autorités britanniques, persuadé que c'est la seule solution pour sauver le peuple de Santa Compana, menacé par la folie de Jagger. Ce dernier visite un asile, pensant y trouver la clé pour vaincre son ennemi...

Balfour entend Lowe avouer à Kate qu'il est un espion anglais envoyé pour tuer Barbe Noire et en parle à Selima, qui envoie des pirates à la recherche de Lowe. La torture d'Antoinette se poursuit entre les mains de Jagger, qui utilise maintenant le carnet de croquis de Lowe comme preuve...

Déconcertée, Nelly découvre finalement la lettre que Rose a laissé derrière elle. Elle demande alors à Tom Lowe et à Fletch de l'aider à retrouver son amie. Les deux hommes acceptent sans hésiter. De son côté, Nenna passe à l'acte en mettant à exécution le plan d'évasion qu'elle a patiemment imaginé. Or, elle met malencontreusement Lowe en danger. Parallèlement, James Balfour réussit à former une alliance inattendue. Elle pourrait bien, elle aussi, coûter la vie à Lowe. Ne reculant devant aucune extrémité, Balfour révèle également à Kate quel genre d'individu il est vraiment. Comment réagira la jeune femme face à ce sinistre individu ?...

Sous la pression d'un mystérieux chef de guerre, Barbe Noire décide de mettre les voiles. Son but : intercepter la flotte espagnole et mettre la main sur son trésor en orchestrant un raid surprise. Mais Jagger, qui connaît ses plans, guette...

Jagger lance l'assaut final sur Santa Campana, muni d'une arme secrète et redoutable. Barbe Noire veut unir son équipage et les habitans de Santa Campana pour lutter contre l'ennemi. Cette bataille cruciale confronte Lowe, qui doit faire un choix difficile...