En A.G. 101, sur « Le jour où l’ange est tombé », la mère mourante de Flit Asuno lui a fourni les schémas d’un légendaire Mobile Suit connu sous le nom de « Gundam ». Après avoir passé les 14 années suivantes à travailler au développement de cette arme, il doit bientôt la mettre à l’épreuve lorsqu’une flotte d’U.E. envahit sa colonie de Nora et menace la vie de ses amis.

L’attaque de Nora par les États-Unis a laissé la colonie dans un effondrement imminent. Le commandant de la colonie de la Fédération, Hendrick Bruzar, a mis au point un plan pour utiliser le cuirassé amiral, Diva, pour sauver le noyau de la colonie, permettant ainsi aux habitants de la colonie d’échapper à la destruction. Cependant, le capitaine de la Diva a d’autres plans. Pendant ce temps, Flit tente de s’échapper de la colonie tout en pilotant le Gundam, mais tombe sur une fille échouée nommée Yurin, qui semble avoir ses propres pouvoirs mystérieux.

Diva se préparait à tirer le Noyau de Nora lorsque deux nouveaux UE s’approchèrent d’eux, alors Grudeck décida de les affronter avant de reprendre l’opération. Les nouveaux UE se sont avérés être un adversaire redoutable pour Flit qui a commencé à perdre son sang-froid, mais Yurin l’a calmé tout en l’aidant à élaborer un plan pour éliminer efficacement leur adversaire. L’une des deux unités d’intervention est entrée dans Nora et a attaqué la base de contrôle où se trouvait Bruzar, le blessant grièvement dans le processus. Flit se bat contre l’UE restante pour le distraire de Diva, mais lorsque les munitions du fusil DOTS ont été épuisées, il a arrêté l’UE en protégeant le Gundam devant Nora et a dit à l’UE qu’il ne laisserait pas les citoyens blessés. À sa grande surprise, l’UE est partie.

L’as pilote de la Fédération Woolf Ennéacle se réveille d’un sommeil réparateur à bord du Diva. Il tente de revendiquer le Gundam pour lui-même au grand dam de Flit, et décide d’avoir une bataille simulée pour déterminer qui devrait piloter la combinaison mobile. Cependant, au cours de la bataille simulée, les deux sont soudainement attaqués par l’UE, et finissent par faire une découverte surprenante sur la façon dont l’UE est capable de rester caché.

Diva s’amarre à la colonie spatiale Fardain. La Fédération avait prévu d’arrêter Grodek et de le faire traduire en cour martiale, mais il a réussi à faire chanter l’officier responsable. Là, Flit rencontre un jeune garçon qui vole le Gundam et attaque plusieurs forces de type UE mobile suit avec. Le garçon rend ensuite le Gundam à Flit et s’en va. Dans une autre section de Fardain, le garçon est accueilli par plusieurs hommes cagoulés qui lui expliquent qu’il fait partie du groupe de personnes « choisies par l’Éden ».

L’équipage est autorisé à se rendre à Fardain. Grodek rencontre un personnage louche Boyage afin de recruter plus de personnes pour lutter contre l’UE. Flit, Emily et Dique sont allés explorer la colonie et ont été pris dans une bataille entre Zalam et Euba. Des complications sont survenues et Flit s’est lancé dans le gundam pour briser le combat entre les deux forces. Juste au moment où Flit arrêtait les deux forces, une nouvelle combinaison mobile de l’UE attaqua. Flit a été arrêté en raison des dommages collatéraux causés par le mobile suit Gundam et UE.

Flit, emprisonné par Zalam pour la destruction qu’il a causée, est amené devant leur chef Don Boyage. Flit soutient que Zalam et Euba devraient cesser leur querelle pour le contrôle de Fardain, mais est rejeté par Boyage. Ensuite, le boss d’Euba, Ract Elfamel, attaque à la tête d’un escadron de combinaisons mobiles. Une autre guerre éclate au sein de la colonie. Flit se dresse dans le Gundam pour l’empêcher, mais un assaut de l’US déclenche une bataille à trois. Incapable d’utiliser des armes à rayon à l’intérieur d’une colonie, le Gundam prend une nouvelle forme pour tenir tête à l’U.E.

Pour faire tomber les États-Unis qui ont infiltré Fardain, Flit se bat sous la nouvelle forme du Gundam : Titus. Ce que le Titus perd en abandonnant son fusil Dodds, inutilisable dans les colonies, il le compense largement par la force brute. Pendant ce temps, des doutes subsistent entre Zalam et Euba, et des affrontements éclatent alors qu’ils se rencontrent sur le champ de bataille. Alors que la situation devient de plus en plus désespérée, Flit se bat pour unir les éléments Zalam et Euba sous une seule bannière. Une nouvelle combinaison mobile se dresse sur le champ de bataille.

Flit interroge Woolf sur l’origine des nouveaux G-EXES. Woolf avoue et conduit Flit à son ancien repaire, l’usine Madorna. Flit est étonné par la gamme de combinaisons mobiles en cours de construction. Mais alors, un spectacle choquant ! Parmi les autres modèles, il y a une combinaison mobile U.E. ! Flit et compagnie sont stupéfaits. Juste à ce moment-là, la combinaison U.E. s’active et commence à détruire le contenu de l’usine. Flit et Woolf se battent ensemble contre elle, mais ne peuvent résister à ses attaques féroces...

Le Gundam et le Diva sont à la tête d’une coalition combinée de combinaisons mobiles Zalam et Euba dans le but de protéger la colonie Fardain de la destruction par le vaisseau-mère de l’UE et ses forces de combinaisons mobiles. Au cours de la bataille, les forces de Zalam et d’Euba sont en mesure de soutenir la combinaison mobile de Diva pour repousser les forces de l’UE, mais au prix de vies humaines.

La Diva arrive à la colonie spatiale neutre de Minsry, où le capitaine Grodek Ainoa assiste à une conférence pour élaborer une stratégie pour combattre l’UE. Flit assiste également à la réunion, où la jeune fille Yurin rencontre une fois de plus. Alors qu’ils assistent à la conférence, les forces de la Fédération interviennent pour arrêter le capitaine sous l’accusation de mutinerie.

L’équipage de commandement des évasions de la Diva, le commandant de la Fédération Stroller Guavaran et ses forces sur la colonie spatiale neutre Minsry, remontent à bord du vaisseau. Cependant, alors que la Diva s’en va, la force opérationnelle de navires de guerre du commandant Guavaran apparaît et piège la Diva dans une deuxième tentative pour capturer le capitaine mutiné.

L’équipage du Diva, plaçant ses espoirs dans une bataille finale décisive, a mis le cap sur la forteresse spatiale Ambat. Les tambours de guerre s’élèvent à leur paroxysme. Les États-Unis attaquent avec une force de combinaisons mobiles et d’énormes navires de guerre. Dans une bataille comme elles n’en ont jamais eue auparavant, la Diva et les forces combinées de Zalam et d’Euba répriment leur peur et luttent pour leur survie. Flit, qui utilise désormais son pouvoir en tant que X-rounder, se bat contre une puissante combinaison mobile américaine. Pour frapper préventivement les États-Unis, la Diva change de forme, dévoilant une nouvelle arme. Sa lumière conduira-t-elle l’humanité à la victoire ?

Decil se bat à nouveau en duel avec Flit et fait appel à son arme secrète, l’ami de capture de Flit, Yurin L’Ciel. Elle est forcée par Decil de combattre Flit comme un simple outil pour le vaincre. Au cours du duel, elle est tuée par Decil, ce qui rend Flit furieux. En utilisant ses capacités X-Rounder, Flit désactive rapidement le Mobile Suit de Decil et le laisse dériver dans l’espace. Cependant, Flit est émotionnellement désemparé par la mort de Yuril, ce qui le rend sans émotion. Flit est bientôt appelé par Diva pour ouvrir la voie vers la cale sèche de la forteresse. Volant avec un abandon téméraire, il se fraye un chemin dans la forteresse. Ses efforts permettent au Diva de s’y amarrer et d’y embarquer ses forces terrestres. Flit retourne à la Diva et réaménage rapidement le Gundam à la configuration AGE-1 Normal, puis accompagne l’équipage d’embarquement tout en ne répondant à personne.

L’équipage s’infiltre dans la forteresse spatiale d’Ambat. Le commandant de la forteresse Gerra Zoi pilote le haut de gamme Defurse pour vaincre le Gundam. Le Gundam et Defurse ont une bataille finale à l’intérieur de la forteresse, mais mû par sa haine envers l’UE, Flit finit par coincer Gerra. Mais une vérité surprenante l’attend. Qu’est-ce que Gerra leur dit sur le passé maudit de la terre ? Qui sont les UE ? La vérité est révélée !

Vingt-cinq ans se sont écoulés et l’histoire est transmise à une nouvelle génération. La guerre entre la Fédération de la Terre et les Vagans, qui étaient autrefois connus sous le nom d’UE, continue. Le commandant militaire de la Fédération, Flit Asuno, offre à son fils Asemu l’appareil AGE le jour de son 17e anniversaire. Juste à ce moment-là, la colonie d’Asemu, Tordia, est attaquée par les Vagan. Asemu se lance dans un Gundam caché pour protéger la colonie.

Zeheart rejoint le Mobile Suit Club et aide Asemu et ses amis à construire un nouveau Mobile Suit. Cependant, Zeheart est en fait un espion Vagan. Lorsque ses alliés apprennent que le Gundam ne peut se trouver que sur les domaines d’Asuno, ils chargent Zeheart d’infiltrer les lieux. Zeheart localise le Gundam. Lorsque le championnat des Mobile Suit Battles de la colonie arrive, les Vagan attaquent la résidence Asuno dans l’espoir de s’emparer de Gundam. Asemu court chez lui pour sauver Gundam, mais peut-il arriver à temps ? Pourquoi les Vagan veulent-ils tant le Gundam ?

Le jour de la remise des diplômes arrive pour Zeheart et Asemu. Alors que la cérémonie de remise des diplômes se déroule, la police militaire arrive et tente d’arrêter Zeheart pour espionnage. Asemu le défend, et l’un des alliés de Zeheart fait diversion pour permettre à Zeheart de s’échapper. Afin de s’échapper, Zeheart enfile son Mobile Suit, mais cela conduit à une bataille avec Asemu où l’identité de Zeheart est révélée à Asemu et Romary. Le commandant Woolf arrive et poursuit Zeheart, mais Asemu ne peut s’empêcher de se souvenir des paroles de Zeheart - il est trop gentil pour être un guerrier.

Asemu et Romary rejoignent tous les deux les forces militaires et sont placés sur le Diva. Le Mobile Suit Commander d’Asemu n’est autre que le Commandant Woolf, et son père est maintenant le principal supérieur du Big Rig. Les Vagan contre-attaquent en plaçant Cœur-Zé à la tête de leurs forces principales. Alors que la Diva commence à quitter la colonie, Dique se révèle être la nouvelle technicienne du vaisseau de la Diva. L’attaque Vagan, la Diva soupçonnant Gundam d’être à bord. Cependant, le Gundam AGE-1 a été envoyé en avant avec Flit, et Asemu est obligé d’attendre que le système AGE apporte la touche finale au nouveau modèle - Gundam AGE-2. Lorsque les choses semblent désastreuses, Asemu est enfin en mesure de se lancer dans l’AGE-2 où il montre aux nouveaux pilotes et aux gens sur la Diva qu’il peut devenir un sauveur pour la nouvelle génération.

Les Vagan lancent un nouveau modèle de combinaison mobile rouge qui entre dans une bataille en tête-à-tête avec AGE-2. Le commandant de la nouvelle combinaison mobile n’est autre que Zeheart, qui espère que cette combinaison mobile pourra résister à ses capacités X-Rounder. Le nom de la combinaison... xvm-zgc Zeydra.

Après que Zeheart ait épargné la vie d’Asemu, celui-ci passe le test d’entraînement militaire avancé pour découvrir ses aptitudes en tant que X-Rounder.

Les Vagan lancent une attaque totale sur le Grand Anneau. Le vainqueur de la bataille aura une route directe vers la Terre qui pourrait faire basculer l’échelle de la guerre de son côté. Le commandant Flit déploie les combinaisons dans une stratégie spécifique dans l’espoir de résister à l’attaque, et Asemu est affecté à la ligne de front où il devra une fois de plus affronter Zeheart. De plus, Flit décide de piloter son ancienne unité Age-1 malgré le fait qu’il n’utilise pas le système AGE, il affronte Desil Galette dans le nouveau xvm-dgc Khronos, Desil veut se venger de Flit après 26 ans de destruction d’Ambat.

Flit rejoint l’équipage du Diva dans une mission secrète pour enquêter sur une colonie soupçonnée de fournir un soutien à l’effort de guerre de Vagan. Lorsque leurs soupçons sont confirmés, Flit ordonne une attaque contre les conspirateurs, mais son fils s’oppose à lui craignant que la vie de colons innocents ne soit mise en danger, et Asemu se retrouve dans une impasse entre suivre les ordres de son père et ses propres convictions. Grodek a été libéré de sa peine et Flit lui rend visite dans un bar.

Des retrouvailles d’amis. Deux vies rapprochées sont ballottées dans le tourbillon de la guerre. Gundam AGE-2 Double Bullet arrive et tue deux Veigan X-Rounders de Magician 8. Arabel Zoi, 35 ans, poignarde Grodek à cause de la mort de Gerra Zoi, puis abattu par 3 hommes portant des lunettes de soleil.

Flit récupère un cockpit Vagan intact de leur précédente bataille et l’équipe de Dique découvre que son pilote utilisait un casque spécial pour stimuler artificiellement ses capacités X-Rounder. Contre les ordres, Asemu vole le casque en pensant qu’il lui donnerait la chance d’être à égalité avec les compétences de Zeheart, mais les effets secondaires de le porter au combat mettent sa vie en danger.

Les Vagans lancent une attaque sur la colonie industrielle de Nortram, prévoyant de s’en emparer et d’utiliser ses ressources pour mener leur invasion de la Terre, mais une fois de plus, les forces de la Fédération se dressent sur leur chemin, déployant leur nouvelle arme contre eux. Decil désobéit une fois de plus aux ordres de Zehart et part seul en cherchant à affronter Flit, mais lorsqu’il se retrouve face à Asemu et Woolf ensemble, la tragédie frappe des deux côtés du conflit.

La bataille pour Nortram s’intensifie jusqu’à ce que la forteresse principale des Vagans soit gravement endommagée et menace de tomber sur Terre. Pour éviter que le désastre ne frappe la planète, Asemu et Zeheart unissent leurs forces dans une mission suicide pour la détruire de l’intérieur. Après avoir accompli leur devoir, les deux pilotes acceptent leur mort imminente et règlent leurs différends, jusqu’à ce que Zeheart se voie montrer une issue de secours les menant en sécurité.

Un an après la bataille de Nortram, Flit utilise les informations qu’il a obtenues de Grodek pour exposer au public la conspiration entre le Gouvernement de la Terre et les Vagans. Une fois leurs plans découverts, les Veigans lancent une attaque pour tuer le Premier ministre de la Terre, mais Asemu se dresse sur leur chemin.

Juste après la naissance de son fils Kio, Asemu part pour une mission spéciale mais ne revient jamais. En 164 apr. J.-C., les Vagans lancent une invasion à grande échelle sur Terre qui envahit les forces de la Fédération par surprise. Juste au moment où tout semble perdu, Flit et Kio montent à bord du tout nouveau Gundam AGE-3 pour se battre.

Flit et Kio luttent pour contenir Zeheart et l’offensive Vagan sur leur ville d’Olivernotes. À la demande de Flit, la Diva à la retraite est réintégrée dans ses fonctions et lancée pour les aider.

La Diva vole à basse altitude pour éviter d’être détectée par l’ennemi lors de son passage dans un désert, lorsqu’elle est prise en embuscade par le « Phantom 3 », une unité spéciale Vagan dont l’équipement orienté vers le désert lui donne le dessus. Kio et les autres luttent pour garder l’ennemi à distance assez longtemps pour que l’Age Builder termine leur nouvelle arme, le G-Hopper, et l’envoie assembler la forteresse Gundam AGE-3.

En route vers la base de la Fédération de Roustroulam, l’équipage du Diva apprend que l’un de leurs pilotes, Shanalua Mullen, est un espion travaillant pour les Vagans. Kio reçoit l’ordre de son grand-père d’aider à défendre la base contre les Vagans, mais il décide de s’en prendre à Shanalua à la place, s’interrogeant sur les raisons de sa trahison.

La bataille de Roustroulam se poursuit, mais lorsque Flit et les autres réalisent les véritables intentions des Vagans, ils doivent se lancer dans une course contre la montre pour désarmer les bombes laissées par l’ennemi.

La Diva part pour l’orbite lunaire ; Ils sont attaqués par des pirates en cours de route.

L’équipage du Diva prend en compte le message laissé par Asemu révélant l’existence d’EXA-DB, une ancienne base de données militaire dont les secrets peuvent changer le cours de la guerre. Zeheart rejoint son collègue commandant Zanald Beyhard dans une attaque en tenaille sur la Diva, et pour la protéger de l’ennemi, Kio pilote le tout nouveau Gundam AGE-3 Orbital.

Les Vagans fuient le champ de bataille après avoir capturé Kio, au grand désespoir de Flit. La Diva est forcée de s’arrêter à l’atelier Madorna pour des réparations et du réapprovisionnement où Flit est contacté par Asemu, lui demandant de le laisser diriger avec le Visidien la mission de sauvetage de Kio.

À la capitale de Vagan, Kio est amené devant leur chef Fezarl Ezelcant, qui le traite plus comme un invité que comme un prisonnier. Ezelcant demande à Kio d’explorer la colonie pour en savoir plus sur la situation difficile de ses habitants tandis que l’équipe de Zanald fait analyser le Gundam AGE-3 dans le cadre de leurs plans pour développer leur propre Gundam.

Kio aide Ezelcant à compléter son propre Gundam en échange de médicaments pour son nouvel ami Lu. Il passe ensuite ses journées à Vagan heureux aux côtés de Lu et de son frère Deen jusqu’à ce que les Wisidiens s’infiltrent dans la colonie pour le sauver et récupérer le Gundam AGE-3.

L’évasion d’Asemu et Kio des Vagans est stoppée par Ezelcant, pilotant le Gundam Legilis récemment achevé et ils se retrouvent encerclés par l’ennemi jusqu’à ce que les pirates bisidien se joignent au combat pour les aider. Au cours de leur combat, Ezelcant révèle à Kio la véritable nature de son plan directeur, le « Projet Eden ».

Après de brèves retrouvailles avec sa famille, Kio prend part à une mission pour reprendre la base lunaire de la Fédération aux Vagans tout en étant déterminé à suivre sa volonté de protéger tout le monde, quel que soit le camp, en pilotant la création ultime du système AGE, le Gundam AGE-FX.

La bataille pour la base lunaire s’intensifie alors que Zeheart et son assistant Fram Nara se préparent à rejoindre les lignes de front. Kio tente de dissuader Fram sans succès et juste au moment où il se retrouve dans une situation difficile, Asemu se joint au combat et confronte Zeheart sur les véritables intentions d’Ezelcant.

La confrontation de Kio avec Fram est interrompue par Girard Spriggan, un ancien membre de la Fédération de la Terre qui a changé de camp. Alors que Kio lutte contre Girard, son passé et les raisons de sa défection sont révélés et Flit se joint à la bataille avec son Gundam AGE-1 Gransa amélioré pour l’aider.

Les forces fédérales brisent les lignes de défense de l’ennemi et s’infiltrent dans la base lunaire. Alors que Seric Abis convainc les Vagans d’admettre leur défaite, les pouvoirs X-Rounder de Girard deviennent fous furieux et elle commence à attaquer à la fois les alliés et les ennemis.

Après avoir réussi à prendre le contrôle de la base lunaire, les forces de la Fédération tournent leur attention vers La Gramis, la principale forteresse des Vagan. Kio et Asemu confrontent Flit à propos de son envie de se venger de toute la race Vagan pour tous les amis et proches qu’il a perdus pendant la guerre et après avoir révélé à Zeheart toute la vérité sur le projet Eden, Ezelcant le nomme son successeur, lui confiant le Gundam Legilis.

Zeheart affronte l’armure mobile SID déterminé à maîtriser toute la puissance du Gundam Legilis et à récupérer l’EXA-DB. Les Bisidiens prennent garde à la bataille et lancent également une attaque contre SID, mais elle s’avère plus puissante qu’Asemu et Zeheart ne peuvent en supporter jusqu’à ce qu’ils finissent par unir leurs forces pour le vaincre.

Les Vagans mènent des plans d’invasion à grande échelle en utilisant la Seconde Lune des Vagans, La Gramis. La Fédération, sachant qu’elle doit mettre un terme à ces plans, monte une opération pour s’emparer de La Gramis. Nous suivons les deux camps alors que les soldats se préparent pour la bataille finale. Que nous réserve l’avenir pour cette ultime bataille ?

Dans la bataille rangée pour La Gramis, Kio découvre qu’il se bat contre Deen, un Vagan avec qui il s’était lié d’amitié. Pour Kio, l’attaque de Deen, le X-Rounder est le pire ennemi qu’il puisse affronter.

Zeheart sait que si le Dig-Magellan devait tirer, il tuerait beaucoup de ses camarades, mais le cœur serré, il donne l’ordre de tirer. Flit, ayant prédit l’attaque et la destruction de Diva travaille pour sauver Gundam et l’équipage de la Diva. Si cette attaque échoue, Cœur-de-Zé sera chassé des forces Vagan, et que fera Asemu... ?

Le siège de la forteresse spatiale de La Gramis touche à sa fin, et malgré les énormes pertes subies par les Vagans et la Fédération, les atrocités de la guerre ne semblent qu’augmenter. Alors que la longue lutte touche à sa fin, Flit, Asemu et Kio parviendront-ils à un accord avec Ezelcant ?