Alors qu'ils se préparent à rentrer en Italie, José et Hilshire se rendent dans un magasin d'antiquités en France pour choisir des cadeaux pour leurs partenaires, Henrietta et Triela. Dans le train du retour, José se souvient de l'époque où il avait été affecté aux Balkans et avait dû laisser sa jeune sœur, Enrica, à son frère aîné, Jean.

Dans un flashback, Pinocchio, un jeune enfant, commet son premier meurtre sous les auspices de son père adoptif Cristiano. Dans le présent, il termine un assassinat pour le compte de la faction de la République de Padanie (PRF).

Hilshire et Triela sont chargés d'une mission pour retrouver un membre de la Division de la sécurité publique qui a disparu dans sa recherche d'un assassin padanien nommé Pinocchio. Alors qu'elle enquête dans un hôtel de Montalcino, Triela tombe sur un livre intitulé "Pinocchio" et commence à le lire, avant de le jeter par terre, faute d'une meilleure histoire.

Angelica est autorisée à effectuer sa première mission sur le terrain depuis son hospitalisation. Avec Marco, son "handler", Rico et Jean, ils se rendent à Milan pour obtenir plus d'informations sur les activités de la PRF et sur Pinocchio en particulier. Olga et Priscilla se sont également rendues à Milan pour s'enquérir de l'état de santé d'Angelica et Marco leur demande de l'aider dans sa mission.

Un mois après le retour d'Angelica, elle semble aller bien. Marco, cependant, a encore des doutes et est contrarié par le fait qu'elle devient de plus en plus différente de l'ancienne Angelica ; Triela, d'autre part, reste profondément déprimée après son échec dans le combat contre Pinocchio.

La Section 2 est chargée de surveiller une femme politique importante, la présidente Isabella d'Angelo, dont l'agence est responsable du projet de pont sur le détroit de Messine. Pendant ce temps, les agents du PRF envoient Nino, le "Terrier tibétain", l'un de leurs meilleurs kidnappeurs, pour s'emparer d'elle.

Des flashbacks révèlent que Franca, de son vrai nom Caterina, est la personne qui a présenté Patricia à Marco lorsqu'ils allaient tous deux à l'université de Rome. Franca, Franco et Pinocchio se cachent et se rétablissent dans sa ferme de Frascati après l'évasion de la Section 2.

Claes rêve du temps qu'elle a passé avec Raballo, mais ne parvient pas à se souvenir de qui il est, ce qui l'angoisse. Jean, préoccupée par les souvenirs de Claes, lui fait regarder une vidéo sur la nature qui évoque les parties de pêche qu'elle faisait avec son maître-chien ;

José retrouve un vieil ami de l'armée italienne, avec lequel il se remémore le passé, et surtout sa sœur, Enrica Croce, jusqu'à ce qu'un terroriste du PRF fasse exploser une bombe près de leur restaurant. Après sa capture par Bernardo et Beatrice et son interrogatoire par Jean et Rico, qui révèlent un important stock d'explosifs plastiques fournis au PRF par l'intermédiaire de l'armée,

Triela est toujours bouleversée par son échec à vaincre Pinocchio. Mario Bossi témoigne contre la mafia et Hilshire et Triela sont envoyés à Naples pour garder sa fille adolescente, Maria "Mimi" Machiavelli. Triela suit un entraînement au combat rapproché dans une base de carabiniers.

Un assassin se promène dans une maison, tuant toutes les personnes qu'il rencontre. Il appelle Cristiano pour lui annoncer qu'il a réussi son coup et celui-ci arrive pour le confirmer. Au moment de partir, Cristiano détecte un faux plancher et, dans une pièce en contrebas, ils trouvent un jeune garçon, qui deviendra Pinocchio.

De retour au pont, les fratelli cherchent Franca, Franco et Pinocchio. Henrietta les découvre alors qu'ils étaient en train de miner le pont. Elle ouvre le feu et une fusillade s'ensuit. Ils s'échappent en bateau et Franco déclenche les charges, mais cela ne suffit pas à faire tomber le pont.

L'histoire de Pinocchio se termine. Franca et Franco décident de venir en aide à Cristiano et Pinocchio. Triela et Pinocchio s'affrontent avec des armes à feu et des couteaux pendant que Hilshire cherche Cristiano. Pinocchio tire sur Triela avec son propre pistolet et Cristiano est abattu puis capturé par Jean et Rico.