Plusieurs mois après les événements de leur première aventure, les aventuriers survivants, désabusés, tentent de reprendre le cours de leur vie. Jil et Fatina rencontrent une petite fille qui leur montre que leur ascension doit continuer.

Les laquais corrompus du roi Gilgamesh envoient l'armée pour capturer la jeune fille, mais Jil et ses amis lui promettent de la mettre en sécurité et de l'emmener au sommet de la tour. Mais tout le monde n'est pas ravi d'être de la partie.

Le groupe atteint le désert de glace infernal au sommet de la tour, mais le désert n'est plus ce qu'il était depuis que leur ami Melt y a développé son entreprise de floraison douteuse. Cependant, l'accueil qui lui est réservé n'a rien d'un ver.

Afin d'atteindre le sommet secret de la tour, le groupe doit une fois de plus vaincre le Druaga, désormais beaucoup plus faible. Certains mystères sont résolus, mais d'autres demeurent, car un nouveau groupe d'ennemis se révèle. De plus, le voyage vers le sommet pourrait être à sens unique.

Le premier niveau de la partie secrète de la tour est un désert où rôdent des démons de l'ombre. Tandis que les trois parties en conflit tentent de trouver un moyen de leur échapper, le vieux roi Gilgamesh est en train de perdre sa bataille contre sa moitié maléfique.

Les trois partis, Neeba et Kaaya affrontent les quatre mystérieux assassins. La bonne nouvelle, c'est que Jil est enfin sur les traces de Neeba et Kaaya.

Les participants atteignent le merveilleux manoir de l'Éternel Printemps, où se matérialisent les souvenirs de ceux qui sont partis et des choses perdues. Même si personne ne veut partir, Jil sait que leur mission ne peut pas attendre. Les quatre assassins et un traître les suivent.

Jil rattrape enfin Neeba et obtient quelques réponses, mais l'un des quatre assassins attaque. Le passé et les motivations de Neeba ainsi que la nature de la tour sont révélés. Une rébellion contre le roi Gilgamesh, devenu fou, est imminente.

Le traître emmène Kaaya et Coopa au sommet de la tour où le roi des ombres les attend. Neeba trouve également un moyen d'accéder au royaume du roi des ombres, ainsi que Jil. Le roi Gilgamesh cède à sa folie et la rébellion est sur le point d'échouer.

Melt part à la recherche de Coopa, tandis que cette dernière élabore son propre plan d'évasion. Neeba et Jil affrontent les assassins restants. Le roi des ombres attend son adversaire. La rébellion contre le roi Gilgamesh connaît un destin inattendu.

La bataille contre le roi des ombres commence. Elle décidera également du sort de la rébellion.

Le nouveau seigneur de la tour commence à attaquer les dieux eux-mêmes. C'est maintenant à Jil et à ses amis d'en finir avec lui et de sauver le monde.