Heidi, petite fille joyeuse âgée de 5 ans, doit aller vivre chez son grand-père, sa tante Dete ayant retrouvé un travail à Francfort. La rumeur dit que son grand-père est un homme peu sympathique…

Heidi rejoint Pierre dans les pâturages. Bien que Grand-Père ait demandé à Heidi de rester près de Pierre, Heidi s'égare. Pierre la retrouve, mais Noiraude se blesse en chemin, ce qui rend Grand-Père furieux.

Karl, Thérésa et William ennuient constamment Pierre, qui met Karl au défi : le premier à rejoindre le rocher aura gagné. Mais Karl glisse lors de son ascension. Heidi demande à son grand-père de le secourir.

Heidi trouve un oiseau mal en point. Elle tente de prévenir Pierre, qui est absent. La grand-mère de Pierre connait le remède pour soigner l'oiseau: une plante de montagne. Hercule et Pierre lui indiqueront où la trouver.

Thérésa, William et Karl veulent trouver la cabane secrète de Pierre, persuadés qu'il y cache un trésor. Heidi et Pierre tentent de les induire en erreur.

L'instituteur vient rendre visite au grand-père d'Heidi pour le persuader d'envoyer celle-ci à l'école et lui apporter une lettre de Dette annobçant qu'elle viendra chercher Heidi au printemps; angoissée par ce que Peter lui a raconté sur l'école Heidi prend peur et s'enfuie pendant la nuit.

Heidi et son grand -père descendent au village pour faire des réserves avant l'hiver, Heidi voudrait offrir du pain à grand mère, elle échange alors une miche de pain contre son fossile avec theresa, mais ce pain est celui de Barbel et Heidi va être alors accusée de vol...

Heidi et Grand père descendent au village, Heidi retrouve Peter à l'école mais Karl et Teresa les poursuit en les bombardant de boules de neige, ils se réfugient alors dans le manoir qui a été la maison de Grand -Père et du papa d'Heidi.

Un loup rôde au village les villageois partent alors le chasser dans la montagne, pendant ce temps Heidi découvre un louveteau pris dans un piège, elle le délivre mais la louve ne tarde pas à arriver

Le printemps est arrivé et Pilou est de retour au chalet. Karl et Teresa décident d'aller voler le trésor de Peter, mais Heidi et Peter s'en aperçoivent et le récupèrent en leur tendant un piège

Karl et sa bande décide de voler sa cabane à Peter,ce dernier décide se venger mais Heidi préfère ruser et demande de l'aide au Grand-père pour les faire sortir de la cabane et ainsi la récupérer.

Heidi aimerait bien devenir générale chevrière mais Peter n'a pas la tête à cela car Mignonne la chèvre des Keller ne donne plus de lait et doit alors partir chez le boucher, Heidi demande à Grand-père de l'aider à la soigner avec l'aide de Teresa et de Peter.

Heidi est enfin générale chevrière mais quand elle rentre au chalet pour apprendre la bonne nouvelle à Grand Père elle trouve sa tante Dete qui lui annonce qu'elle l'emmène à Francfort, mais qu'elle reviendra très vite avec des cadeaux.

Heidi arrive à Francfort et a hâte de rencontrer Clara mais Mme Rottenmeier lui fait passer des tests afin de voir si Heidi répond bien aux exigences de la maison, mais malheureusement Heidi va devoir repartir dans ses montagnes, mais des qu'elle rencontre Clara c'est le coup de foudre immédiat.

Heidi qui aimerait bien voir ses montagnes part à la recherche du clocher de Francfort pour tenter de les apercevoir mais sans succès, elle en rapporte deux petits chatons, mais pendant ce temps tout le monde la cherche, seule Clara sait où elle est partie.

Mme Rottenmeier découvre les chatons dans la chambre de Clara, elle punit Heidi en l'enfermant à la cave et charge Sébastien d'aller se débarrasser des chats.

Heidi entraine clara à se tenir debout, et lui propose d'en faire la surprise à son papa qui doit arriver, mais Clara fait tomber l'horloge, Mme Rottenmeier en rend Heidi responsable et souhaite son départ mais heureusement Mr Sesemann se rend compte des bienfaits de la petite fille sur Clara.

M. Seseman décide que Heidi va suivre les leçons données par le précepteur de Clara, mais ce dernier se rend compte que Heidi ne sait ni lire ni écrire et qu'il serait préférable qu'elle prenne des cours particuliers avec lui, à la grande déception des deux jeunes filles.

Le précepteur décide de tester une méthode intensive pour apprendre à lire à Heidi. Pendant ce temps, Grand-maman, qui est arrivée, propose à Clara et Heidi d'apprendre une pièce de théâtre, mais Heidi a bien du mal à apprendre à lire et se décourage.

Heidi sait maintenant lire. Alors que le printemps arrive, Grand-Maman propose d'aller la journée au parc. Heidi est alors très heureuse de pouvoir courir dans l'herbe mais Clara est soudain très triste car elle ne pense pas pouvoir marcher.

Heidi et Grand-maman sont décidées à rendre le sourire à Clara en installant une balançoire dans le jardin, mais Clara continue à être triste, Heidi lui reproche de ne pas tenir sa promesse d'essayer de remarcher, alors elle lui fait la surprise de se tenir debout

Profitant de l’absence de Mlle Rottenmeier, Sebastien et Dete emmènent Heidi et Clara au parc. En voyant un chevreau souffrant, Heidi décide de subtiliser le chevreau pour le soigner chez les Sesemann et de son côté, Sébastien déclare enfin son amour à Dete et la demande en mariage.

Mademoiselle Rottenmeier rentre plus tôt que prévu et découvre le chevreau dans la maison. Elle décide alors de démissionner, n'en pouvant plus des facéties d'Heidi. Mais Clara est très peinée, alors Heidi préfère rentrer dans ses montagnes pour que Mademoiselle ne quitte pas Clara.

Mr Seseman revient passer l'été à Francfort et annonce qu'il va adopter Heidi, mais celle-ci refuse ayant peur de ne plus jamais revoir ses montagnes et son grand-père, elle va alors se réfugier dans l'arbre de la cour.

Heidi a le mal du pays et aimerait beaucoup revoir son grand-père. Une nuit, Melle Rottenmeier croit entendre un fantôme... Mr Seseman monte la garde et découvre alors qu'Heidi est somnambule.

Heidi attend les lettres de son grand-père qui n'arrivent en fait jamais, car Dete n'a pas envoyé le courrier d'Heidi. Pour la préserver, celle-ci s'évanouit souvent et doit rester couchée. Alors, à contre-coeur, Clara demande à son père qu'Heidi puisse retourner dans ses montagnes.

Heidi quitte Clara et prend le train à Frankfurt avec Sébastien : elle est en route pour rejoindre ses montagnes et est aux anges à l'idée de revoir son Grand-père, Peter et tous les autres, mais elle ne sait pas que ce même jour, Grand-père, qui n’a pas reçu sa lettre, a décidé de quitter son chalet pour toujours

Heidi repart avec Peter dans l'alpage mais un orage menace. Alors que Peter part secourir Karl qui est tombé dans un trou, Heidi ramène le troupeau au chalet où Grisette va donner naissance à son chevreau.

Heidi et Grand-père viennent de s’installer au Manoir pour y passer l’hiver et permettre à Heidi d'aller à l'école mais Mme Keller refuse de servir Grand-père, car il a annulé la vente du manoir puis Theresa brise une statue de bois qui faisait la fierté de sa mère et demande l'aide de Grand-père qui refuse du coup, Theresa fugue dans la montagne…

Grand-mère est malade et a besoin de médicaments qui coûtent très cher. Mais Peter et Brigitte n'ont pas assez d'argent pour les lui acheter, alors Heidi, bouleversée par la maladie de la vieille femme, a par ailleurs retrouvé la broche de sa grand-mère et va la vendre aux Keller pour pouvoir acheter les médicaments.

Mr Traber a organisé un examen de fin d'année pour les grands et le meilleur élève sera récompensé par un livre de collection et une pièce d'argent. Teresa ayant peur que Peter ne gagne, va ouvrir l'enclos des chèvres pour que Peter ne puisse pas venir passer l'examen.

Traber a accepté un nouveau poste d'instituteur dans la vallée, et doit partir avec Karl, celui-ci décide alors de se séparer de son sac de fossiles et pour ne pas faire de jaloux, il organise une chasse au trésor : le premier qui trouve son sac de fossiles, en sera le nouveau propriétaire.

Clara arrive à Dorfli avec Melle Rottenmeier qui refuse d'aller s'installer au chalet, alors les enfants lui font des farces pour la faire changer d'avis.

Alors que Melle Rottenmeier s'y était opposé et en l'absence de celle-ci, Grand Père emmène Heidi et Clara à l'alpage, à son retour ne les trouvant pas Melle part à leur recherche mais se perd dans la montagne alors qu'un orage éclate.

Le comité du village demande au grand-père de terminer le pont du diable qu'il avait commencé il y a 6 ans. Très angoissé, il se met à faire des cauchemars qui intriguent Heidi. Elle décide alors d'enquêter avec Peter et Clara pour savoir ce qu'il s'est passé lors de la construction de ce pont.

Mademoiselle Rottenmeier est surprise de voir arriver au Village Friedrich, un compagnon du devoir qui cherche du travail et qu’elle a connu quand elle était jeune : son amour de jeunesse mais a tiré un trait sur ses origines et prétend ne pas le connaître alors quand celui-ci trouve du travail auprès de Grand-père et s’installe pour quelques jours au chalet, Mademoiselle Rottenmeier décide de partir à Francfort avec Clara.

Peter est jaloux car Heidi passe tout son temps avec Clara, notamment pour l'entraîner à la marche puis Heidi emmène Clara à la cabane Peter furieux et jaloux vole le fauteuil de Clara, qui était resté au chalet, et le jette dans le torrent, où il se brise.

Le père de Clara et Bonne maman arrivent à Dörfli , en les croisant, Peter imagine que la police le recherche à cause du vol du fauteuil, et s’enfuit... au chalet, la joie de voir Clara remarcher est tempérée par l’inquiétude de Brigitte, qui ne sait pas où est son fils alors tout le monde part à la recherche du garçon qu'Heidi retrouve dans la cabane, et le convainc de revenir avec elle.

Grand-père a terminé le Pont du Diable et tout le village se prépare à son inauguration, Dete et Sébastien arrivent pour l’occasion, mais l’ambiance est tendue entre Dete et grand-père, qui ne se sont pas vus depuis que Dete est venue prendre Heidi pour l’emmener à Francfort.